36 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dfer_1816 on replicon NC_013037
Organism: Dyadobacter fermentans DSM 18053



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013037  Dfer_1816  Antibiotic biosynthesis monooxygenase  100 
 
 
104 aa  211  1.9999999999999998e-54  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.148462  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1276  Antibiotic biosynthesis monooxygenase  58.06 
 
 
148 aa  118  1.9999999999999998e-26  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.484559 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2430  antibiotic biosynthesis monooxygenase  55.91 
 
 
150 aa  114  5e-25  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.343798 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0418  Antibiotic biosynthesis monooxygenase  51.52 
 
 
104 aa  103  8e-22  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.324945  hitchhiker  0.00133248 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0385  Antibiotic biosynthesis monooxygenase  51.52 
 
 
104 aa  102  1e-21  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.0306824 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1805  Antibiotic biosynthesis monooxygenase  45.16 
 
 
153 aa  87  7e-17  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.874842  normal  0.0169557 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0840  antibiotic biosynthesis monooxygenase  42.86 
 
 
129 aa  85.9  2e-16  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.0327839 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3087  antibiotic biosynthesis monooxygenase  40.82 
 
 
128 aa  83.6  9e-16  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.804464  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0841  antibiotic biosynthesis monooxygenase  31.76 
 
 
137 aa  63.2  0.000000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.0327839 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1703  antibiotic biosynthesis monooxygenase  32.93 
 
 
100 aa  61.6  0.000000004  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.12592 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1875  antibiotic biosynthesis monooxygenase  36.05 
 
 
252 aa  58.9  0.00000002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0564  antibiotic biosynthesis monooxygenase  29.27 
 
 
110 aa  53.5  0.0000008  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0547682  normal  0.294784 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_20250  hypothetical protein  32.93 
 
 
100 aa  53.5  0.0000009  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.25525  normal  0.833496 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1741  hypothetical protein  32.93 
 
 
100 aa  53.5  0.000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0727  antibiotic biosynthesis monooxygenase  32.5 
 
 
100 aa  53.1  0.000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.235106  normal  0.0173261 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6899  Antibiotic biosynthesis monooxygenase  29.27 
 
 
109 aa  52.4  0.000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4706  antibiotic biosynthesis monooxygenase  32.5 
 
 
100 aa  52.4  0.000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00216246 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4705  antibiotic biosynthesis monooxygenase  31.65 
 
 
97 aa  50.8  0.000006  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.190187  normal  0.040711 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4571  antibiotic biosynthesis monooxygenase  31.25 
 
 
100 aa  50.8  0.000007  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.683113  normal  0.464576 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0873  antibiotic biosynthesis monooxygenase  26.19 
 
 
107 aa  49.3  0.00002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3392  hypothetical protein  37.5 
 
 
96 aa  47.8  0.00006  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1575  Antibiotic biosynthesis monooxygenase  27.16 
 
 
106 aa  47  0.0001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0535  Antibiotic biosynthesis monooxygenase  31.75 
 
 
101 aa  45.4  0.0002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.494763  normal  0.309514 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0842  antibiotic biosynthesis monooxygenase  26.92 
 
 
105 aa  44.7  0.0004  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2501  antibiotic biosynthesis monooxygenase  42.86 
 
 
96 aa  44.7  0.0005  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.180823  normal 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6277  Antibiotic biosynthesis monooxygenase  32.35 
 
 
97 aa  44.3  0.0006  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  hitchhiker  0.000255974  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0717  antibiotic biosynthesis monooxygenase  30.38 
 
 
104 aa  43.9  0.0008  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0774  antibiotic biosynthesis monooxygenase  31.75 
 
 
104 aa  42.4  0.002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.924912  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0491  Antibiotic biosynthesis monooxygenase  30.26 
 
 
110 aa  42.4  0.002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3619  Antibiotic biosynthesis monooxygenase  26.76 
 
 
103 aa  42.7  0.002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0204  Antibiotic biosynthesis monooxygenase  27.06 
 
 
99 aa  42  0.003  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4364  antibiotic biosynthesis monooxygenase  31.91 
 
 
97 aa  42  0.003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3152  antibiotic biosynthesis monooxygenase  26.53 
 
 
102 aa  40.4  0.008  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.756738  normal  0.106564 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3507  hypothetical protein  26.53 
 
 
102 aa  40.4  0.008  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1905  antibiotic biosynthesis monooxygenase domain-containing protein  28.95 
 
 
226 aa  40.4  0.009  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.0647203  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0549  hypothetical protein  28.21 
 
 
129 aa  40  0.01  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.989851  normal  0.727681 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>