41 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Slin_1276 on replicon NC_013730
Organism: Spirosoma linguale DSM 74



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013730  Slin_1276  Antibiotic biosynthesis monooxygenase  100 
 
 
148 aa  306  4e-83  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.484559 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1816  Antibiotic biosynthesis monooxygenase  58.06 
 
 
104 aa  118  1.9999999999999998e-26  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.148462  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2430  antibiotic biosynthesis monooxygenase  47.01 
 
 
150 aa  114  6e-25  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.343798 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3087  antibiotic biosynthesis monooxygenase  45.87 
 
 
128 aa  108  2.0000000000000002e-23  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.804464  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0385  Antibiotic biosynthesis monooxygenase  53.76 
 
 
104 aa  107  6e-23  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.0306824 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1805  Antibiotic biosynthesis monooxygenase  45.52 
 
 
153 aa  99.8  1e-20  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.874842  normal  0.0169557 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0418  Antibiotic biosynthesis monooxygenase  51.61 
 
 
104 aa  99.4  1e-20  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.324945  hitchhiker  0.00133248 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0840  antibiotic biosynthesis monooxygenase  44.21 
 
 
129 aa  95.9  2e-19  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.0327839 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0841  antibiotic biosynthesis monooxygenase  32.56 
 
 
137 aa  64.7  0.0000000005  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.0327839 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1875  antibiotic biosynthesis monooxygenase  38.96 
 
 
252 aa  58.9  0.00000002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1703  antibiotic biosynthesis monooxygenase  29.41 
 
 
100 aa  54.3  0.0000005  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.12592 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0564  antibiotic biosynthesis monooxygenase  27.59 
 
 
110 aa  53.1  0.000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0547682  normal  0.294784 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6899  Antibiotic biosynthesis monooxygenase  29.27 
 
 
109 aa  52.8  0.000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4705  antibiotic biosynthesis monooxygenase  32.94 
 
 
97 aa  48.9  0.00002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.190187  normal  0.040711 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4571  antibiotic biosynthesis monooxygenase  31.76 
 
 
100 aa  47.8  0.00005  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.683113  normal  0.464576 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0491  Antibiotic biosynthesis monooxygenase  28.95 
 
 
110 aa  47.4  0.00007  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4706  antibiotic biosynthesis monooxygenase  31.76 
 
 
100 aa  47  0.00009  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00216246 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1575  Antibiotic biosynthesis monooxygenase  26.6 
 
 
106 aa  46.2  0.0001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1214  Antibiotic biosynthesis monooxygenase  28.3 
 
 
110 aa  46.6  0.0001  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.85027  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2453  antibiotic biosynthesis monooxygenase  29.67 
 
 
96 aa  46.6  0.0001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.237842  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2954  antibiotic biosynthesis monooxygenase  34.88 
 
 
112 aa  45.1  0.0003  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0545  hypothetical protein  30.67 
 
 
598 aa  44.7  0.0004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.226286 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1741  hypothetical protein  27.5 
 
 
100 aa  44.3  0.0005  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0727  antibiotic biosynthesis monooxygenase  28.24 
 
 
100 aa  43.9  0.0008  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.235106  normal  0.0173261 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3826  antibiotic biosynthesis monooxygenase  28.57 
 
 
99 aa  43.9  0.0008  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.434397 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_20250  hypothetical protein  27.85 
 
 
100 aa  43.1  0.001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.25525  normal  0.833496 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4294  antibiotic biosynthesis monooxygenase  27.47 
 
 
99 aa  43.1  0.001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.918403 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0873  antibiotic biosynthesis monooxygenase  24.44 
 
 
107 aa  43.5  0.001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1144  antibiotic biosynthesis monooxygenase  27.37 
 
 
107 aa  42.4  0.002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.976851  normal  0.57363 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4364  antibiotic biosynthesis monooxygenase  35.82 
 
 
97 aa  42.4  0.002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4574  antibiotic biosynthesis monooxygenase  41.07 
 
 
111 aa  42  0.003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.210178  normal  0.879884 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2501  antibiotic biosynthesis monooxygenase  32.47 
 
 
96 aa  41.6  0.003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.180823  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3962  antibiotic biosynthesis monooxygenase  25.27 
 
 
99 aa  41.6  0.004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4405  antibiotic biosynthesis monooxygenase  25.27 
 
 
99 aa  41.6  0.004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.508922 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3619  Antibiotic biosynthesis monooxygenase  27.03 
 
 
103 aa  41.6  0.004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4361  antibiotic biosynthesis monooxygenase  39.29 
 
 
111 aa  40.8  0.006  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.443758  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4005  antibiotic biosynthesis monooxygenase  39.29 
 
 
111 aa  40.8  0.006  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.601713  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3518  antibiotic biosynthesis monooxygenase  39.29 
 
 
111 aa  40.8  0.006  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.821089  normal  0.461755 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0258  hypothetical protein  29.33 
 
 
485 aa  40.4  0.008  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3167  antibiotic biosynthesis monooxygenase  27.91 
 
 
98 aa  40.4  0.009  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.347958  normal  0.104633 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0717  antibiotic biosynthesis monooxygenase  29.69 
 
 
104 aa  40  0.01  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>