16 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sros_0545 on replicon NC_013595
Organism: Streptosporangium roseum DSM 43021



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013595  Sros_0545  hypothetical protein  100 
 
 		 598 aa  1178    Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.226286 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0258  hypothetical protein  53.69 
 
 		 485 aa  238  2e-61  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4443  Antibiotic biosynthesis monooxygenase  61.39 
 
 		 442 aa  119  9.999999999999999e-26  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4354  hypothetical protein  50 
 
 		 380 aa  112  3e-23  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.501601  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2721  hypothetical protein  48.94 
 
 		 415 aa  104  4e-21  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.632989  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1527  antibiotic biosynthesis monooxygenase  50 
 
 		 111 aa  95.9  2e-18  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4371  Antibiotic biosynthesis monooxygenase  45.92 
 
 		 103 aa  91.3  5e-17  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2777  hypothetical protein  46.94 
 
 		 102 aa  88.6  3e-16  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0875  antibiotic biosynthesis monooxygenase  42.17 
 
 		 106 aa  75.1  0.000000000004  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.524457 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1632  large adhesin  33.33 
 
 		 2914 aa  60.1  0.0000001  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0102  Antibiotic biosynthesis monooxygenase  36.36 
 
 		 98 aa  55.1  0.000004  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.146325  normal  0.027185 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0840  antibiotic biosynthesis monooxygenase  28.95 
 
 		 129 aa  48.5  0.0003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.0327839 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0841  antibiotic biosynthesis monooxygenase  31.76 
 
 		 137 aa  48.9  0.0003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.0327839 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1276  Antibiotic biosynthesis monooxygenase  30.67 
 
 		 148 aa  44.7  0.005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.484559 
 
 
-
 
NC_002976  SERP2398  accumulation associated protein  33.83 
 
 		 2397 aa  43.9  0.009  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.53067  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0478  cell-surface large adhesin  32.79 
 
 		 2851 aa  43.9  0.01  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>