32 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tfu_2777 on replicon NC_007333
Organism: Thermobifida fusca YX



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007333  Tfu_2777  hypothetical protein  100 
 
 
102 aa  208  2e-53  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1527  antibiotic biosynthesis monooxygenase  70.71 
 
 
111 aa  144  6e-34  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4371  Antibiotic biosynthesis monooxygenase  64.36 
 
 
103 aa  136  7.999999999999999e-32  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0875  antibiotic biosynthesis monooxygenase  48.51 
 
 
106 aa  94  7e-19  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.524457 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0102  Antibiotic biosynthesis monooxygenase  47.92 
 
 
98 aa  90.5  7e-18  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.146325  normal  0.027185 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0545  hypothetical protein  46.94 
 
 
598 aa  89.4  2e-17  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.226286 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0258  hypothetical protein  45 
 
 
485 aa  79.3  0.00000000000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4443  Antibiotic biosynthesis monooxygenase  44.9 
 
 
442 aa  73.9  0.0000000000007  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2721  hypothetical protein  43.04 
 
 
415 aa  73.6  0.0000000000009  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.632989  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4354  hypothetical protein  36.84 
 
 
380 aa  67.4  0.00000000006  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.501601  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0840  antibiotic biosynthesis monooxygenase  32 
 
 
129 aa  50.4  0.000008  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.0327839 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2817  Antibiotic biosynthesis monooxygenase  34.78 
 
 
95 aa  50.4  0.000009  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.201503  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4524  antibiotic biosynthesis monooxygenase  30.61 
 
 
104 aa  49.3  0.00002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.451369  normal  0.693828 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4662  antibiotic biosynthesis monooxygenase  30.61 
 
 
104 aa  48.5  0.00003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.134123  normal  0.994103 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0774  antibiotic biosynthesis monooxygenase  30.3 
 
 
104 aa  48.5  0.00003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.924912  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4657  antibiotic biosynthesis monooxygenase  30.61 
 
 
104 aa  48.9  0.00003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.494563  normal  0.992322 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5035  antibiotic biosynthesis monooxygenase  30.26 
 
 
96 aa  45.4  0.0002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1703  antibiotic biosynthesis monooxygenase  30.69 
 
 
100 aa  45.1  0.0003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.12592 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6899  Antibiotic biosynthesis monooxygenase  46.51 
 
 
109 aa  44.7  0.0004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3619  Antibiotic biosynthesis monooxygenase  34.72 
 
 
103 aa  44.3  0.0005  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2120  antibiotic biosynthesis monooxygenase  38.89 
 
 
104 aa  42.4  0.002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2107  antibiotic biosynthesis monooxygenase  38.89 
 
 
104 aa  42.4  0.002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.253753  normal  0.0667442 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2166  antibiotic biosynthesis monooxygenase  38.89 
 
 
104 aa  42.4  0.002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0310747  normal  0.139966 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0564  antibiotic biosynthesis monooxygenase  44.19 
 
 
110 aa  41.6  0.003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0547682  normal  0.294784 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1575  Antibiotic biosynthesis monooxygenase  26.74 
 
 
106 aa  41.2  0.005  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2795  antibiotic biosynthesis monooxygenase  26.98 
 
 
100 aa  41.2  0.005  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2512  Antibiotic biosynthesis monooxygenase  31.11 
 
 
95 aa  40.8  0.006  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.344542  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0717  antibiotic biosynthesis monooxygenase  27.27 
 
 
104 aa  40.8  0.006  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0535  Antibiotic biosynthesis monooxygenase  31.17 
 
 
101 aa  40.4  0.008  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.494763  normal  0.309514 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6821  antibiotic biosynthesis monooxygenase  31.17 
 
 
96 aa  40.4  0.008  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3369  antibiotic biosynthesis monooxygenase  28.87 
 
 
96 aa  40.4  0.008  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.226825  normal  0.261907 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2501  antibiotic biosynthesis monooxygenase  30.49 
 
 
96 aa  40.4  0.008  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.180823  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>