29 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tbis_1527 on replicon NC_014165
Organism: Thermobispora bispora DSM 43833



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014165  Tbis_1527  antibiotic biosynthesis monooxygenase  100 
 
 
111 aa  229  7.000000000000001e-60  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4371  Antibiotic biosynthesis monooxygenase  69.31 
 
 
103 aa  150  5.9999999999999996e-36  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2777  hypothetical protein  70.71 
 
 
102 aa  144  6e-34  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0875  antibiotic biosynthesis monooxygenase  52.48 
 
 
106 aa  101  3e-21  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.524457 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0545  hypothetical protein  50 
 
 
598 aa  95.9  2e-19  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.226286 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0258  hypothetical protein  44 
 
 
485 aa  89.7  1e-17  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0102  Antibiotic biosynthesis monooxygenase  48.39 
 
 
98 aa  89.4  2e-17  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.146325  normal  0.027185 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4443  Antibiotic biosynthesis monooxygenase  47.47 
 
 
442 aa  76.3  0.0000000000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2721  hypothetical protein  37.93 
 
 
415 aa  65.1  0.0000000003  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.632989  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4354  hypothetical protein  36.78 
 
 
380 aa  59.3  0.00000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.501601  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6899  Antibiotic biosynthesis monooxygenase  44.26 
 
 
109 aa  50.1  0.00001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4662  antibiotic biosynthesis monooxygenase  29.89 
 
 
104 aa  47.4  0.00006  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.134123  normal  0.994103 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4524  antibiotic biosynthesis monooxygenase  29.89 
 
 
104 aa  47.4  0.00007  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.451369  normal  0.693828 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4657  antibiotic biosynthesis monooxygenase  29.89 
 
 
104 aa  46.2  0.0002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.494563  normal  0.992322 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3167  antibiotic biosynthesis monooxygenase  38.55 
 
 
98 aa  46.2  0.0002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.347958  normal  0.104633 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0564  antibiotic biosynthesis monooxygenase  41.1 
 
 
110 aa  45.1  0.0003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0547682  normal  0.294784 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0717  antibiotic biosynthesis monooxygenase  32.98 
 
 
104 aa  45.4  0.0003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0774  antibiotic biosynthesis monooxygenase  28.74 
 
 
104 aa  44.3  0.0005  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.924912  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3619  Antibiotic biosynthesis monooxygenase  36.25 
 
 
103 aa  44.3  0.0005  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3392  hypothetical protein  35.23 
 
 
96 aa  44.3  0.0006  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0840  antibiotic biosynthesis monooxygenase  37.74 
 
 
129 aa  43.9  0.0007  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.0327839 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2501  antibiotic biosynthesis monooxygenase  31.08 
 
 
96 aa  43.5  0.001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.180823  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1910  antibiotic biosynthesis monooxygenase  32.99 
 
 
107 aa  43.5  0.001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2817  Antibiotic biosynthesis monooxygenase  41.3 
 
 
95 aa  42.7  0.002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.201503  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2512  Antibiotic biosynthesis monooxygenase  28.89 
 
 
95 aa  42  0.003  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.344542  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0535  Antibiotic biosynthesis monooxygenase  30.67 
 
 
101 aa  42  0.003  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.494763  normal  0.309514 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4798  Antibiotic biosynthesis monooxygenase  33.78 
 
 
96 aa  40.4  0.007  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0786747  hitchhiker  0.00170038 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3869  antibiotic biosynthesis monooxygenase  38.03 
 
 
95 aa  40.4  0.008  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.346738  normal 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6277  Antibiotic biosynthesis monooxygenase  34.78 
 
 
97 aa  40  0.01  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  hitchhiker  0.000255974  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>