43 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Smed_0841 on replicon NC_009636
Organism: Sinorhizobium medicae WSM419



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009636  Smed_0841  antibiotic biosynthesis monooxygenase  100 
 
 		 137 aa  285  1e-76  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.0327839 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3087  antibiotic biosynthesis monooxygenase  37.65 
 
 		 128 aa  79.3  0.00000000000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.804464  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0840  antibiotic biosynthesis monooxygenase  34.48 
 
 		 129 aa  67.8  0.00000000005  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.0327839 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1276  Antibiotic biosynthesis monooxygenase  28.71 
 
 		 148 aa  67  0.00000000008  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.484559 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1816  Antibiotic biosynthesis monooxygenase  31.76 
 
 		 104 aa  63.9  0.0000000007  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.148462  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0385  Antibiotic biosynthesis monooxygenase  30.39 
 
 		 104 aa  63.5  0.0000000008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.0306824 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4706  antibiotic biosynthesis monooxygenase  35.06 
 
 		 100 aa  58.9  0.00000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00216246 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1741  hypothetical protein  36.36 
 
 		 100 aa  58.9  0.00000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4571  antibiotic biosynthesis monooxygenase  33.77 
 
 		 100 aa  58.9  0.00000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.683113  normal  0.464576 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_20250  hypothetical protein  36.36 
 
 		 100 aa  58.9  0.00000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.25525  normal  0.833496 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1875  antibiotic biosynthesis monooxygenase  34.78 
 
 		 252 aa  58.5  0.00000003  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0418  Antibiotic biosynthesis monooxygenase  27.45 
 
 		 104 aa  58.5  0.00000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.324945  hitchhiker  0.00133248 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1805  Antibiotic biosynthesis monooxygenase  32.94 
 
 		 153 aa  58.2  0.00000003  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.874842  normal  0.0169557 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4705  antibiotic biosynthesis monooxygenase  44.07 
 
 		 97 aa  58.9  0.00000003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.190187  normal  0.040711 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1703  antibiotic biosynthesis monooxygenase  37.66 
 
 		 100 aa  58.2  0.00000004  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.12592 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1905  antibiotic biosynthesis monooxygenase domain-containing protein  34.18 
 
 		 226 aa  56.2  0.0000001  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.0647203  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0727  antibiotic biosynthesis monooxygenase  40.68 
 
 		 100 aa  55.8  0.0000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.235106  normal  0.0173261 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3392  hypothetical protein  29.27 
 
 		 96 aa  52.8  0.000002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2430  antibiotic biosynthesis monooxygenase  32.26 
 
 		 150 aa  50.1  0.00001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.343798 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_55140  hypothetical protein  40 
 
 		 98 aa  50.1  0.00001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000000000327578 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_2026  antibiotic biosynthesis monooxygenase domain-containing protein  40 
 
 		 97 aa  49.3  0.00002  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0545  hypothetical protein  30.68 
 
 		 598 aa  49.3  0.00002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.226286 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0564  antibiotic biosynthesis monooxygenase  30.95 
 
 		 110 aa  48.5  0.00003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0547682  normal  0.294784 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6899  Antibiotic biosynthesis monooxygenase  28.24 
 
 		 109 aa  47.4  0.00006  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3499  antibiotic biosynthesis monooxygenase  34.33 
 
 		 99 aa  46.6  0.0001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6277  Antibiotic biosynthesis monooxygenase  32.53 
 
 		 97 aa  46.2  0.0001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  hitchhiker  0.000255974  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0491  Antibiotic biosynthesis monooxygenase  34.48 
 
 		 110 aa  45.4  0.0003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3619  Antibiotic biosynthesis monooxygenase  36.84 
 
 		 103 aa  45.1  0.0003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1865  antibiotic biosynthesis monooxygenase  32.84 
 
 		 99 aa  45.1  0.0003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.237236  normal  0.0159656 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03061  hypothetical protein  30 
 
 		 94 aa  44.3  0.0005  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0252  antibiotic biosynthesis monooxygenase  40 
 
 		 101 aa  43.9  0.0008  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2766  Antibiotic biosynthesis monooxygenase  36.76 
 
 		 95 aa  42.4  0.002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.593447 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4295  autoinducer-2 (AI-2) modifying protein LsrG  30 
 
 		 109 aa  42.4  0.002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4410  autoinducer-2 (AI-2) modifying protein LsrG  30 
 
 		 109 aa  42.4  0.002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.266111  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4478  autoinducer-2 (AI-2) modifying protein LsrG  30 
 
 		 109 aa  42  0.003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.519027  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1383  autoinducer-2 (AI-2) modifying protein LsrG  26.92 
 
 		 97 aa  41.6  0.003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2236  antibiotic biosynthesis monooxygenase  37.78 
 
 		 97 aa  41.2  0.004  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011683  PHATRDRAFT_38325  predicted protein  32.81 
 
 		 117 aa  41.2  0.005  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.910141  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4798  Antibiotic biosynthesis monooxygenase  38.89 
 
 		 96 aa  41.2  0.005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0786747  hitchhiker  0.00170038 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4325  autoinducer-2 (AI-2) modifying protein LsrG  30.99 
 
 		 97 aa  40.8  0.007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4408  autoinducer-2 (AI-2) modifying protein LsrG  30.99 
 
 		 97 aa  40.8  0.007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.884642  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0258  hypothetical protein  26.61 
 
 		 485 aa  40.8  0.007  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4239  antibiotic biosynthesis monooxygenase  31.75 
 
 		 96 aa  40  0.01  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.467888 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>