47 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PHATRDRAFT_8324 on replicon NC_011693
Organism: Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011693  PHATRDRAFT_8324  predicted protein  100 
 
 
68 aa  143  6e-34  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.817984  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3531  autoinducer-2 (AI-2) modifying protein LsrG  43.28 
 
 
97 aa  63.9  0.0000000007  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.291132 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3619  Antibiotic biosynthesis monooxygenase  45.59 
 
 
103 aa  62.8  0.000000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2128  Antibiotic biosynthesis monooxygenase  36.76 
 
 
96 aa  55.8  0.0000002  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.254894  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01486  hypothetical protein  36.76 
 
 
96 aa  55.8  0.0000002  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2131  autoinducer-2 (AI-2) modifying protein LsrG  36.76 
 
 
96 aa  55.8  0.0000002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.840351  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1654  autoinducer-2 (AI-2) modifying protein LsrG  36.76 
 
 
96 aa  55.8  0.0000002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.282836  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2140  autoinducer-2 (AI-2) modifying protein LsrG  36.76 
 
 
96 aa  55.8  0.0000002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1600  autoinducer-2 (AI-2) modifying protein LsrG  36.76 
 
 
96 aa  56.2  0.0000002  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.895383  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01475  autoinducer-2 (AI-2) modifying protein LsrG  36.76 
 
 
96 aa  55.8  0.0000002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0056  autoinducer-2 (AI-2) modifying protein LsrG  35.29 
 
 
100 aa  55.8  0.0000002  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.140027  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1383  autoinducer-2 (AI-2) modifying protein LsrG  34.33 
 
 
97 aa  54.3  0.0000006  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4478  autoinducer-2 (AI-2) modifying protein LsrG  35.29 
 
 
109 aa  52.8  0.000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.519027  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4325  autoinducer-2 (AI-2) modifying protein LsrG  35.29 
 
 
97 aa  52.8  0.000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4295  autoinducer-2 (AI-2) modifying protein LsrG  35.29 
 
 
109 aa  52.8  0.000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4410  autoinducer-2 (AI-2) modifying protein LsrG  35.29 
 
 
109 aa  52.8  0.000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.266111  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4408  autoinducer-2 (AI-2) modifying protein LsrG  35.29 
 
 
97 aa  52.8  0.000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.884642  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3526  autoinducer-2 (AI-2) modifying protein LsrG  34.33 
 
 
96 aa  52  0.000003  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3655  autoinducer-2 (AI-2) modifying protein LsrG  34.33 
 
 
96 aa  52  0.000003  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0863  autoinducer-2 (AI-2) modifying protein LsrG  34.33 
 
 
96 aa  52  0.000003  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6277  Antibiotic biosynthesis monooxygenase  39.71 
 
 
97 aa  51.2  0.000005  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  hitchhiker  0.000255974  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3507  hypothetical protein  30.88 
 
 
102 aa  50.1  0.00001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0491  Antibiotic biosynthesis monooxygenase  36.36 
 
 
110 aa  49.7  0.00001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3152  antibiotic biosynthesis monooxygenase  30.88 
 
 
102 aa  50.1  0.00001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.756738  normal  0.106564 
 
 
-
 
NC_009357  OSTLU_92362  predicted protein  32.35 
 
 
272 aa  45.1  0.0003  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.038448  normal  0.165435 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0727  antibiotic biosynthesis monooxygenase  30.88 
 
 
100 aa  44.3  0.0006  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.235106  normal  0.0173261 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1575  Antibiotic biosynthesis monooxygenase  30.88 
 
 
106 aa  43.5  0.0009  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3167  antibiotic biosynthesis monooxygenase  26.47 
 
 
98 aa  43.5  0.001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.347958  normal  0.104633 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1703  antibiotic biosynthesis monooxygenase  27.94 
 
 
100 aa  43.5  0.001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.12592 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7008  hypothetical protein  30.88 
 
 
99 aa  43.5  0.001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.560667 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0774  antibiotic biosynthesis monooxygenase  25.76 
 
 
104 aa  43.1  0.001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.924912  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0538  antibiotic biosynthesis monooxygenase  29.41 
 
 
106 aa  42.4  0.002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.894063  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3392  hypothetical protein  31.88 
 
 
96 aa  42.7  0.002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1741  hypothetical protein  30.88 
 
 
100 aa  42.7  0.002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0717  antibiotic biosynthesis monooxygenase  28.79 
 
 
104 aa  42.7  0.002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011683  PHATRDRAFT_38325  predicted protein  38.3 
 
 
117 aa  42.7  0.002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.910141  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4657  antibiotic biosynthesis monooxygenase  24.24 
 
 
104 aa  41.6  0.003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.494563  normal  0.992322 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4705  antibiotic biosynthesis monooxygenase  29.41 
 
 
97 aa  41.6  0.003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.190187  normal  0.040711 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4662  antibiotic biosynthesis monooxygenase  25.76 
 
 
104 aa  42  0.003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.134123  normal  0.994103 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4524  antibiotic biosynthesis monooxygenase  25.76 
 
 
104 aa  42  0.003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.451369  normal  0.693828 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0252  antibiotic biosynthesis monooxygenase  32.79 
 
 
101 aa  42  0.003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4706  antibiotic biosynthesis monooxygenase  29.41 
 
 
100 aa  41.6  0.004  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00216246 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4571  antibiotic biosynthesis monooxygenase  29.41 
 
 
100 aa  41.6  0.004  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.683113  normal  0.464576 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_39960  hypothetical protein  28.57 
 
 
254 aa  41.2  0.005  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.228774  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_20250  hypothetical protein  35.71 
 
 
100 aa  41.2  0.005  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.25525  normal  0.833496 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4798  Antibiotic biosynthesis monooxygenase  29.41 
 
 
96 aa  40.8  0.007  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0786747  hitchhiker  0.00170038 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_36280  putative antibiotic biosynthesis monooxygenase  32.2 
 
 
114 aa  40  0.01  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.0215754 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>