24 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Patl_3536 on replicon NC_008228
Organism: Pseudoalteromonas atlantica T6c



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008228  Patl_3536  antibiotic biosynthesis monooxygenase  100 
 
 		 210 aa  435  1e-121  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3761  antibiotic biosynthesis monooxygenase  52.63 
 
 		 205 aa  214  7e-55  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_39960  hypothetical protein  24.4 
 
 		 254 aa  73.9  0.000000000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.228774  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1575  Antibiotic biosynthesis monooxygenase  31.46 
 
 		 106 aa  48.5  0.00008  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4408  autoinducer-2 (AI-2) modifying protein LsrG  29.41 
 
 		 97 aa  47.4  0.0002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.884642  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4478  autoinducer-2 (AI-2) modifying protein LsrG  29.41 
 
 		 109 aa  47  0.0002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.519027  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4325  autoinducer-2 (AI-2) modifying protein LsrG  29.41 
 
 		 97 aa  47.4  0.0002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4295  autoinducer-2 (AI-2) modifying protein LsrG  29.41 
 
 		 109 aa  47  0.0002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4410  autoinducer-2 (AI-2) modifying protein LsrG  29.41 
 
 		 109 aa  47  0.0002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.266111  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3167  antibiotic biosynthesis monooxygenase  28.87 
 
 		 98 aa  46.6  0.0003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.347958  normal  0.104633 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1383  autoinducer-2 (AI-2) modifying protein LsrG  27.06 
 
 		 97 aa  44.3  0.001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3531  autoinducer-2 (AI-2) modifying protein LsrG  28.24 
 
 		 97 aa  44.7  0.001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.291132 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8673  hypothetical protein  26.09 
 
 		 107 aa  44.3  0.001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0549  antibiotic biosynthesis monooxygenase  31.82 
 
 		 96 aa  43.9  0.002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4657  antibiotic biosynthesis monooxygenase  28 
 
 		 104 aa  42.7  0.003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.494563  normal  0.992322 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0774  antibiotic biosynthesis monooxygenase  28.38 
 
 		 104 aa  43.1  0.003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.924912  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2182  Antibiotic biosynthesis monooxygenase  29.89 
 
 		 103 aa  43.1  0.003  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0519  Antibiotic biosynthesis monooxygenase  28.05 
 
 		 96 aa  43.1  0.003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2003  Antibiotic biosynthesis monooxygenase  29.41 
 
 		 98 aa  42.4  0.005  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4239  antibiotic biosynthesis monooxygenase  29.33 
 
 		 96 aa  42  0.006  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.467888 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3744  antibiotic biosynthesis monooxygenase  31.08 
 
 		 95 aa  42  0.007  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0267  hypothetical protein  19.59 
 
 		 223 aa  41.6  0.009  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1910  antibiotic biosynthesis monooxygenase  36.51 
 
 		 107 aa  41.6  0.009  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4662  antibiotic biosynthesis monooxygenase  26.67 
 
 		 104 aa  41.2  0.01  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.134123  normal  0.994103 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>