103 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tpau_3001 on replicon NC_014158
Organism: Tsukamurella paurometabola DSM 20162



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014158  Tpau_3001  Antibiotic biosynthesis monooxygenase  100 
 
 		 93 aa  188  2e-47  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.107557  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0454  Antibiotic biosynthesis monooxygenase  39.33 
 
 		 106 aa  67.4  0.00000000007  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3995  antibiotic biosynthesis monooxygenase  41.25 
 
 		 104 aa  64.7  0.0000000004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.261121 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2120  antibiotic biosynthesis monooxygenase  41.25 
 
 		 104 aa  62  0.000000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2166  antibiotic biosynthesis monooxygenase  41.25 
 
 		 104 aa  62  0.000000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0310747  normal  0.139966 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2107  antibiotic biosynthesis monooxygenase  41.25 
 
 		 104 aa  62  0.000000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.253753  normal  0.0667442 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2392  antibiotic biosynthesis monooxygenase  42.86 
 
 		 104 aa  62  0.000000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0294565 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12762  hypothetical protein  41.25 
 
 		 104 aa  60.8  0.000000006  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.21885 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0846  Antibiotic biosynthesis monooxygenase  43.84 
 
 		 103 aa  58.9  0.00000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2683  hypothetical protein  44.83 
 
 		 95 aa  55.8  0.0000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.618339  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1880  antibiotic biosynthesis monooxygenase  35.29 
 
 		 117 aa  53.1  0.000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4776  Antibiotic biosynthesis monooxygenase  31.11 
 
 		 110 aa  51.6  0.000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.831592  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0640  antibiotic biosynthesis monooxygenase  33.33 
 
 		 96 aa  51.2  0.000005  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.83774  hitchhiker  0.00200112 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3019  antibiotic biosynthesis monooxygenase  29.55 
 
 		 99 aa  48.5  0.00003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.149454  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0519  Antibiotic biosynthesis monooxygenase  36.36 
 
 		 96 aa  48.5  0.00003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1842  antibiotic biosynthesis monooxygenase  38.46 
 
 		 96 aa  48.1  0.00004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0851122  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1684  antibiotic biosynthesis monooxygenase  36.11 
 
 		 80 aa  47.8  0.00005  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4239  antibiotic biosynthesis monooxygenase  29.41 
 
 		 96 aa  47.8  0.00006  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.467888 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2003  Antibiotic biosynthesis monooxygenase  36.11 
 
 		 98 aa  47.4  0.00006  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2481  hypothetical protein  32.1 
 
 		 112 aa  47.4  0.00007  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2760  hypothetical protein  27.27 
 
 		 97 aa  47.4  0.00007  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2446  hypothetical protein  33.85 
 
 		 96 aa  47.4  0.00007  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2833  hypothetical protein  33.33 
 
 		 96 aa  46.6  0.0001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.152682  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3067  antibiotic biosynthesis monooxygenase  36.23 
 
 		 92 aa  46.6  0.0001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.299855  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0257  hypothetical protein  35.9 
 
 		 96 aa  46.2  0.0002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2825  hypothetical protein  27.27 
 
 		 97 aa  46.2  0.0002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.106743  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3039  hypothetical protein  27.27 
 
 		 97 aa  46.2  0.0002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.843525  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0389  antibiotic biosynthesis monooxygenase  31.46 
 
 		 96 aa  45.8  0.0002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1866  antibiotic biosynthesis monooxygenase  32.91 
 
 		 99 aa  45.8  0.0002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.138048  normal  0.0354103 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3607  antibiotic biosynthesis monooxygenase  33.33 
 
 		 103 aa  46.2  0.0002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1568  antibiotic biosynthesis monooxygenase domain-containing protein  29.67 
 
 		 95 aa  45.8  0.0002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00171921  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0401  antibiotic biosynthesis monooxygenase domain-containing protein  29.67 
 
 		 95 aa  45.8  0.0002  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.0712142 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1676  antibiotic biosynthesis monooxygenase  29.67 
 
 		 95 aa  45.8  0.0002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.510049  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3030  hypothetical protein  27.27 
 
 		 97 aa  46.2  0.0002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2766  Antibiotic biosynthesis monooxygenase  31.31 
 
 		 95 aa  45.8  0.0002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.593447 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2769  Antibiotic biosynthesis monooxygenase  36.23 
 
 		 92 aa  45.8  0.0002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000542689 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2501  antibiotic biosynthesis monooxygenase  36.71 
 
 		 96 aa  45.1  0.0003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.180823  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1871  Antibiotic biosynthesis monooxygenase  41.38 
 
 		 99 aa  45.4  0.0003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3687  Antibiotic biosynthesis monooxygenase  45.65 
 
 		 99 aa  45.4  0.0003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2332  antibiotic biosynthesis monooxygenase  38.75 
 
 		 97 aa  44.7  0.0004  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.0741444 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1768  antibiotic biosynthesis monooxygenase  34.74 
 
 		 96 aa  44.7  0.0005  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.523558  normal  0.107409 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2826  antibiotic biosynthesis monooxygenase  28.41 
 
 		 97 aa  44.3  0.0005  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.220348  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2512  Antibiotic biosynthesis monooxygenase  31.58 
 
 		 95 aa  44.7  0.0005  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.344542  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6672  Antibiotic biosynthesis monooxygenase  29.07 
 
 		 95 aa  44.7  0.0005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1865  antibiotic biosynthesis monooxygenase  33.33 
 
 		 99 aa  44.3  0.0006  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.237236  normal  0.0159656 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3499  antibiotic biosynthesis monooxygenase  34.83 
 
 		 99 aa  44.3  0.0006  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1869  antibiotic biosynthesis monooxygenase  34.78 
 
 		 95 aa  44.3  0.0006  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.460757  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1619  Antibiotic biosynthesis monooxygenase  31.58 
 
 		 96 aa  44.3  0.0006  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.445975 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0311  antibiotic biosynthesis monooxygenase  30.34 
 
 		 99 aa  43.9  0.0007  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2207  hypothetical protein  28.41 
 
 		 97 aa  43.9  0.0007  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000589169  hitchhiker  6.1187300000000004e-18 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3074  hypothetical protein  36.36 
 
 		 97 aa  43.9  0.0008  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.126641  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2797  hypothetical protein  26.14 
 
 		 97 aa  43.1  0.001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.361189  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1006  antibiotic biosynthesis monooxygenase  32.29 
 
 		 96 aa  43.5  0.001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1406  antibiotic biosynthesis monooxygenase  29.73 
 
 		 96 aa  43.1  0.001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1487  antibiotic biosynthesis monooxygenase  32.29 
 
 		 96 aa  43.5  0.001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4618  hypothetical protein  25.61 
 
 		 92 aa  43.5  0.001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.131861  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1463  antibiotic biosynthesis monooxygenase  32.29 
 
 		 96 aa  43.1  0.001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3069  hypothetical protein  28.74 
 
 		 97 aa  43.5  0.001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.216709  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3043  hypothetical protein  27.27 
 
 		 97 aa  43.1  0.001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4628  antibiotic biosynthesis monooxygenase  32.29 
 
 		 96 aa  42.7  0.002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.156354  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3498  antibiotic biosynthesis monooxygenase  33.82 
 
 		 99 aa  42.4  0.002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3869  antibiotic biosynthesis monooxygenase  42.55 
 
 		 95 aa  42.7  0.002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.346738  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0666  antibiotic biosynthesis monooxygenase  29.73 
 
 		 96 aa  42.4  0.002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3619  antibiotic biosynthesis monooxygenase  30.77 
 
 		 94 aa  42  0.003  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0763  hypothetical protein  33.33 
 
 		 95 aa  42  0.003  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  0.101689 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7008  hypothetical protein  37.31 
 
 		 99 aa  42  0.003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.560667 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10809  hypothetical protein  32.56 
 
 		 101 aa  42  0.003  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.000000694209  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1827  antibiotic biosynthesis monooxygenase  30.14 
 
 		 99 aa  42  0.003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.758954 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_33910  Antibiotic biosynthesis monooxygenase protein  32.47 
 
 		 98 aa  42  0.003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.11717  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3237  Antibiotic biosynthesis monooxygenase  35.09 
 
 		 95 aa  42  0.003  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  decreased coverage  0.0000082945  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0407  antibiotic biosynthesis monooxygenase  36.07 
 
 		 97 aa  41.6  0.004  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1398  antibiotic biosynthesis monooxygenase  32.86 
 
 		 96 aa  41.6  0.004  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00323232  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2446  Antibiotic biosynthesis monooxygenase  29.21 
 
 		 106 aa  41.6  0.004  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1575  Antibiotic biosynthesis monooxygenase  31.91 
 
 		 106 aa  41.6  0.004  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_36280  putative antibiotic biosynthesis monooxygenase  33.82 
 
 		 114 aa  41.2  0.005  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.0215754 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2453  antibiotic biosynthesis monooxygenase  32.86 
 
 		 96 aa  41.2  0.005  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.237842  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4181  Antibiotic biosynthesis monooxygenase  37.31 
 
 		 99 aa  41.2  0.005  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3437  hypothetical protein  32.26 
 
 		 104 aa  41.2  0.005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.368327  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3430  hypothetical protein  32.26 
 
 		 104 aa  41.2  0.005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3365  protein YgiN  32.26 
 
 		 104 aa  41.2  0.005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3361  protein YgiN  32.26 
 
 		 104 aa  41.2  0.005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.218693  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3532  hypothetical protein  32.26 
 
 		 104 aa  41.2  0.005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1588  hypothetical protein  40.43 
 
 		 96 aa  41.2  0.005  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.113304  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5647  antibiotic biosynthesis monooxygenase  28.24 
 
 		 97 aa  40.8  0.006  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.447412  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4657  antibiotic biosynthesis monooxygenase  34.85 
 
 		 104 aa  40.8  0.006  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.494563  normal  0.992322 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2817  Antibiotic biosynthesis monooxygenase  28.75 
 
 		 95 aa  40.8  0.006  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.201503  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02901  quinol monooxygenase  32.26 
 
 		 104 aa  40.8  0.007  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0671  Antibiotic biosynthesis monooxygenase  32.26 
 
 		 104 aa  40.8  0.007  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0569  antibiotic biosynthesis monooxygenase  29.11 
 
 		 95 aa  40.8  0.007  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3207  quinol monooxygenase YgiN  32.26 
 
 		 104 aa  40.8  0.007  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3493  quinol monooxygenase YgiN  32.26 
 
 		 104 aa  40.8  0.007  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0668  antibiotic biosynthesis monooxygenase  32.26 
 
 		 104 aa  40.8  0.007  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00541585 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3462  quinol monooxygenase YgiN  32.26 
 
 		 104 aa  40.8  0.007  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4337  quinol monooxygenase YgiN  32.26 
 
 		 104 aa  40.8  0.007  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2608  Antibiotic biosynthesis monooxygenase  33.33 
 
 		 103 aa  40.4  0.007  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0123227  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02851  hypothetical protein  32.26 
 
 		 104 aa  40.8  0.007  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3317  quinol monooxygenase YgiN  32.26 
 
 		 104 aa  40.4  0.008  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.0938653 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1296  antibiotic biosynthesis monooxygenase  32.93 
 
 		 102 aa  40.4  0.008  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.670301 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1743  antibiotic biosynthesis monooxygenase  34.62 
 
 		 107 aa  40.4  0.008  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.969748 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1578  Antibiotic biosynthesis monooxygenase  27.63 
 
 		 100 aa  40.4  0.008  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.126729  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>