70 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Plim_3237 on replicon NC_014148
Organism: Planctomyces limnophilus DSM 3776



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014148  Plim_3237  Antibiotic biosynthesis monooxygenase  100 
 
 
95 aa  197  5e-50  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  decreased coverage  0.0000082945  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4776  Antibiotic biosynthesis monooxygenase  45.1 
 
 
110 aa  55.1  0.0000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.831592  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03061  hypothetical protein  32.86 
 
 
94 aa  51.2  0.000005  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_22850  hypothetical protein  61.54 
 
 
103 aa  49.7  0.00001  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.81234  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4798  Antibiotic biosynthesis monooxygenase  36.49 
 
 
96 aa  49.7  0.00001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0786747  hitchhiker  0.00170038 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2683  hypothetical protein  32.84 
 
 
95 aa  47  0.00008  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.618339  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3014  antibiotic biosynthesis monooxygenase  45.95 
 
 
148 aa  47  0.00008  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.704493 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0717  antibiotic biosynthesis monooxygenase  51.28 
 
 
104 aa  46.6  0.0001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1481  antibiotic biosynthesis monooxygenase  35.09 
 
 
95 aa  47  0.0001  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.0336514  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0311  antibiotic biosynthesis monooxygenase  48.65 
 
 
99 aa  46.6  0.0001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0824  Antibiotic biosynthesis monooxygenase  43.75 
 
 
97 aa  45.8  0.0002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.841443  normal  0.172785 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3239  antibiotic biosynthesis monooxygenase domain-containing protein  39.62 
 
 
98 aa  45.4  0.0002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3695  GCN5-related N-acetyltransferase  38.81 
 
 
269 aa  45.8  0.0002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.304884  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0674  antibiotic biosynthesis monooxygenase  30.95 
 
 
107 aa  45.1  0.0003  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.495419  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1578  hypothetical protein  39.53 
 
 
97 aa  44.7  0.0004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.594105  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3881  Antibiotic biosynthesis monooxygenase  31.75 
 
 
94 aa  44.7  0.0004  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000774997 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_18180  hypothetical protein  39.53 
 
 
97 aa  44.7  0.0004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2380  antibiotic biosynthesis monooxygenase  30.3 
 
 
98 aa  44.7  0.0005  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.96646  normal  0.159549 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4657  antibiotic biosynthesis monooxygenase  34.78 
 
 
104 aa  44.3  0.0006  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.494563  normal  0.992322 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4181  Antibiotic biosynthesis monooxygenase  34.18 
 
 
99 aa  44.3  0.0006  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1871  Antibiotic biosynthesis monooxygenase  40 
 
 
99 aa  44.3  0.0006  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4074  antibiotic biosynthesis monooxygenase  30.51 
 
 
94 aa  43.9  0.0008  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.296978 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2608  Antibiotic biosynthesis monooxygenase  40.82 
 
 
103 aa  43.9  0.0008  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0123227  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3933  antibiotic biosynthesis monooxygenase  30.51 
 
 
94 aa  43.9  0.0008  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3744  antibiotic biosynthesis monooxygenase  32.2 
 
 
95 aa  43.5  0.0009  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1869  antibiotic biosynthesis monooxygenase  37.25 
 
 
95 aa  43.1  0.001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.460757  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1684  antibiotic biosynthesis monooxygenase  44.44 
 
 
80 aa  43.1  0.001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2003  Antibiotic biosynthesis monooxygenase  44.44 
 
 
98 aa  43.1  0.001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1910  antibiotic biosynthesis monooxygenase  36.21 
 
 
107 aa  43.1  0.001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3869  antibiotic biosynthesis monooxygenase  31.03 
 
 
95 aa  43.1  0.001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.346738  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2182  Antibiotic biosynthesis monooxygenase  40.82 
 
 
103 aa  43.1  0.001  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3507  hypothetical protein  42.22 
 
 
102 aa  42.4  0.002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1439  antibiotic biosynthesis monooxygenase  30.56 
 
 
98 aa  42.7  0.002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1866  antibiotic biosynthesis monooxygenase  32.88 
 
 
99 aa  42.7  0.002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.138048  normal  0.0354103 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3152  antibiotic biosynthesis monooxygenase  42.22 
 
 
102 aa  42.4  0.002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.756738  normal  0.106564 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2756  Antibiotic biosynthesis monooxygenase  28.38 
 
 
95 aa  42.7  0.002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002899  hypothetical protein  29.31 
 
 
94 aa  42.4  0.002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3437  antibiotic biosynthesis monooxygenase  30.16 
 
 
94 aa  42.4  0.002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3001  Antibiotic biosynthesis monooxygenase  35.09 
 
 
93 aa  42  0.003  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.107557  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0389  antibiotic biosynthesis monooxygenase  34.38 
 
 
96 aa  41.6  0.003  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0774  antibiotic biosynthesis monooxygenase  37.78 
 
 
104 aa  42  0.003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.924912  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_08371  hypothetical protein  20 
 
 
98 aa  42  0.003  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  decreased coverage  0.00286255  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_38020  putative ntibiotic biosynthesis monooxygenase  32.65 
 
 
135 aa  42  0.003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0109734  hitchhiker  0.00690857 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0569  antibiotic biosynthesis monooxygenase  33.93 
 
 
95 aa  41.6  0.003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2802  antibiotic biosynthesis monooxygenase  38.89 
 
 
99 aa  42  0.003  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.200278 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1842  antibiotic biosynthesis monooxygenase  32.14 
 
 
96 aa  42  0.003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0851122  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3958  antibiotic biosynthesis monooxygenase  30.16 
 
 
94 aa  42  0.003  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3167  antibiotic biosynthesis monooxygenase  40.43 
 
 
98 aa  41.6  0.004  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.347958  normal  0.104633 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5778  Antibiotic biosynthesis monooxygenase  29.58 
 
 
110 aa  41.6  0.004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0405  antibiotic biosynthesis monooxygenase  50 
 
 
94 aa  41.6  0.004  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00781134 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1827  antibiotic biosynthesis monooxygenase  36.84 
 
 
99 aa  41.6  0.004  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.758954 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3498  antibiotic biosynthesis monooxygenase  34.78 
 
 
99 aa  41.2  0.005  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06652  hypothetical protein  29.69 
 
 
96 aa  41.2  0.005  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2292  Antibiotic biosynthesis monooxygenase  38.89 
 
 
99 aa  41.2  0.005  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.613637  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_36280  putative antibiotic biosynthesis monooxygenase  32.43 
 
 
114 aa  41.2  0.005  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.0215754 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3619  antibiotic biosynthesis monooxygenase  34.78 
 
 
94 aa  40.8  0.006  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1295  antibiotic biosynthesis monooxygenase  30.65 
 
 
95 aa  40.8  0.006  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.124781  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1865  antibiotic biosynthesis monooxygenase  32.89 
 
 
99 aa  40.8  0.006  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.237236  normal  0.0159656 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3687  Antibiotic biosynthesis monooxygenase  33.85 
 
 
99 aa  40.8  0.006  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1662  antibiotic biosynthesis monooxygenase  34.55 
 
 
94 aa  40.8  0.006  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.339758  normal  0.855445 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1064  antibiotic biosynthesis monooxygenase  27.03 
 
 
98 aa  40.8  0.007  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2501  antibiotic biosynthesis monooxygenase  32.14 
 
 
96 aa  40.8  0.007  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.180823  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0640  antibiotic biosynthesis monooxygenase  27.38 
 
 
96 aa  40.8  0.007  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.83774  hitchhiker  0.00200112 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2446  hypothetical protein  35.9 
 
 
96 aa  40.4  0.007  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4524  antibiotic biosynthesis monooxygenase  36.36 
 
 
104 aa  40.4  0.008  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.451369  normal  0.693828 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3580  antibiotic biosynthesis monooxygenase  33.33 
 
 
99 aa  40.4  0.008  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4662  antibiotic biosynthesis monooxygenase  36.36 
 
 
104 aa  40.4  0.008  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.134123  normal  0.994103 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0852  lipoprotein  33.87 
 
 
96 aa  40.4  0.008  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4266  antibiotic biosynthesis monooxygenase  33.85 
 
 
99 aa  40  0.009  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.326536  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0454  Antibiotic biosynthesis monooxygenase  38.1 
 
 
106 aa  40  0.01  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>