29 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sala_0828 on replicon NC_008048
Organism: Sphingopyxis alaskensis RB2256



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008048  Sala_0828  antibiotic biosynthesis monooxygenase  100 
 
 
102 aa  205  1e-52  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.0989333  normal  0.0109928 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3638  Antibiotic biosynthesis monooxygenase  42.71 
 
 
99 aa  84.3  6e-16  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2446  hypothetical protein  32.26 
 
 
96 aa  51.2  0.000005  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4776  Antibiotic biosynthesis monooxygenase  28.41 
 
 
110 aa  48.9  0.00002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.831592  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2182  Antibiotic biosynthesis monooxygenase  26.14 
 
 
103 aa  48.1  0.00004  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1865  antibiotic biosynthesis monooxygenase  30.21 
 
 
99 aa  46.2  0.0001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.237236  normal  0.0159656 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3499  antibiotic biosynthesis monooxygenase  29.17 
 
 
99 aa  45.4  0.0003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1866  antibiotic biosynthesis monooxygenase  31.11 
 
 
99 aa  45.1  0.0004  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.138048  normal  0.0354103 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1880  antibiotic biosynthesis monooxygenase  26.32 
 
 
117 aa  45.1  0.0004  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4181  Antibiotic biosynthesis monooxygenase  33.85 
 
 
99 aa  44.3  0.0006  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7008  hypothetical protein  33.78 
 
 
99 aa  43.9  0.0007  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.560667 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3201  Antibiotic biosynthesis monooxygenase  26.6 
 
 
98 aa  43.1  0.001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0130262  unclonable  0.0000000000117168 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5647  antibiotic biosynthesis monooxygenase  32.88 
 
 
97 aa  42.4  0.002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.447412  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3498  antibiotic biosynthesis monooxygenase  28.89 
 
 
99 aa  42  0.003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2608  Antibiotic biosynthesis monooxygenase  27.4 
 
 
103 aa  41.6  0.003  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0123227  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0519  Antibiotic biosynthesis monooxygenase  31.15 
 
 
96 aa  41.6  0.004  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1195  antibiotic biosynthesis monooxygenase  29.87 
 
 
95 aa  41.6  0.004  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1401  Antibiotic biosynthesis monooxygenase  39.06 
 
 
105 aa  41.2  0.005  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4628  antibiotic biosynthesis monooxygenase  35.94 
 
 
96 aa  41.2  0.005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.156354  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2766  Antibiotic biosynthesis monooxygenase  26.37 
 
 
95 aa  41.2  0.005  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.593447 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1006  antibiotic biosynthesis monooxygenase  51.35 
 
 
96 aa  40.8  0.006  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1463  antibiotic biosynthesis monooxygenase  51.35 
 
 
96 aa  40.8  0.006  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1487  antibiotic biosynthesis monooxygenase  51.35 
 
 
96 aa  40.8  0.006  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3167  antibiotic biosynthesis monooxygenase  35.14 
 
 
98 aa  40.8  0.006  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.347958  normal  0.104633 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0437  hypothetical protein  30.43 
 
 
98 aa  40.8  0.007  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2954  antibiotic biosynthesis monooxygenase  32.76 
 
 
112 aa  40.4  0.008  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2380  antibiotic biosynthesis monooxygenase  34.67 
 
 
98 aa  40.4  0.008  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.96646  normal  0.159549 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0666  antibiotic biosynthesis monooxygenase  35.42 
 
 
96 aa  40.4  0.009  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1256  Antibiotic biosynthesis monooxygenase  29.29 
 
 
101 aa  40.4  0.009  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>