51 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Spro_4261 on replicon NC_009832
Organism: Serratia proteamaculans 568



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009832  Spro_4261  antibiotic biosynthesis monooxygenase  100 
 
 
102 aa  209  9e-54  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.899897  hitchhiker  0.000276374 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3437  hypothetical protein  48.08 
 
 
104 aa  105  2e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.368327  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3430  hypothetical protein  48.08 
 
 
104 aa  105  2e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3365  protein YgiN  48.08 
 
 
104 aa  105  2e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3361  protein YgiN  48.08 
 
 
104 aa  105  2e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.218693  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3532  hypothetical protein  48.08 
 
 
104 aa  105  2e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3317  quinol monooxygenase YgiN  47 
 
 
104 aa  101  3e-21  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.0938653 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0671  Antibiotic biosynthesis monooxygenase  46 
 
 
104 aa  100  7e-21  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0668  antibiotic biosynthesis monooxygenase  46 
 
 
104 aa  100  7e-21  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00541585 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3462  quinol monooxygenase YgiN  46 
 
 
104 aa  100  7e-21  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3493  quinol monooxygenase YgiN  46 
 
 
104 aa  100  7e-21  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3207  quinol monooxygenase YgiN  46 
 
 
104 aa  100  7e-21  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4337  quinol monooxygenase YgiN  46 
 
 
104 aa  100  7e-21  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02851  hypothetical protein  46 
 
 
104 aa  100  7e-21  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02901  quinol monooxygenase  46 
 
 
104 aa  100  7e-21  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3432  antibiotic biosynthesis monooxygenase  47 
 
 
104 aa  96.3  1e-19  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3875  Antibiotic biosynthesis monooxygenase  42.57 
 
 
101 aa  84  6e-16  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.988198 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3791  Antibiotic biosynthesis monooxygenase  42.57 
 
 
101 aa  84  7e-16  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1214  Antibiotic biosynthesis monooxygenase  37.62 
 
 
110 aa  72  0.000000000003  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.85027  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1296  antibiotic biosynthesis monooxygenase  42.16 
 
 
102 aa  72  0.000000000003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.670301 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0966  Antibiotic biosynthesis monooxygenase  38.78 
 
 
101 aa  69.3  0.00000000001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.472175  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5255  Antibiotic biosynthesis monooxygenase  41 
 
 
102 aa  68.9  0.00000000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.083215  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0437  hypothetical protein  37.76 
 
 
98 aa  62.4  0.000000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1195  antibiotic biosynthesis monooxygenase  37.18 
 
 
95 aa  50.8  0.000006  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06652  hypothetical protein  31.63 
 
 
96 aa  48.5  0.00003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001135  hypothetical protein  28.89 
 
 
96 aa  48.5  0.00003  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0997  antibiotic biosynthesis monooxygenase  32.91 
 
 
103 aa  47.8  0.00005  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.0138004  normal  0.714993 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2517  Antibiotic biosynthesis monooxygenase  33.75 
 
 
106 aa  47  0.00009  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.910218  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5647  antibiotic biosynthesis monooxygenase  32.43 
 
 
97 aa  46.2  0.0002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.447412  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3580  antibiotic biosynthesis monooxygenase  33.75 
 
 
99 aa  45.8  0.0002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2799  antibiotic biosynthesis monooxygenase  34.25 
 
 
115 aa  45.8  0.0002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.584286  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1578  hypothetical protein  32.93 
 
 
97 aa  45.4  0.0003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.594105  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_18180  hypothetical protein  32.93 
 
 
97 aa  45.4  0.0003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2756  Antibiotic biosynthesis monooxygenase  30.38 
 
 
95 aa  44.3  0.0005  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0311  antibiotic biosynthesis monooxygenase  39.24 
 
 
99 aa  44.3  0.0007  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_33910  Antibiotic biosynthesis monooxygenase protein  30.38 
 
 
98 aa  43.9  0.0008  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.11717  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2453  antibiotic biosynthesis monooxygenase  29.79 
 
 
96 aa  43.5  0.0009  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.237842  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0257  hypothetical protein  27.84 
 
 
96 aa  42.4  0.002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0405  antibiotic biosynthesis monooxygenase  30.38 
 
 
94 aa  42  0.003  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00781134 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2683  hypothetical protein  31.43 
 
 
95 aa  42  0.003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.618339  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3933  antibiotic biosynthesis monooxygenase  29.17 
 
 
94 aa  41.2  0.004  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4074  antibiotic biosynthesis monooxygenase  29.17 
 
 
94 aa  41.2  0.004  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.296978 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2446  Antibiotic biosynthesis monooxygenase  28.57 
 
 
106 aa  41.2  0.005  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0406  antibiotic biosynthesis monooxygenase  26.8 
 
 
94 aa  41.2  0.005  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1866  antibiotic biosynthesis monooxygenase  30.95 
 
 
99 aa  41.2  0.005  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.138048  normal  0.0354103 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0667  antibiotic biosynthesis monooxygenase  29.27 
 
 
97 aa  41.2  0.005  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.995231 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0400  hypothetical protein  28.87 
 
 
94 aa  41.2  0.006  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3881  Antibiotic biosynthesis monooxygenase  31.65 
 
 
94 aa  40.8  0.007  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000774997 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3619  antibiotic biosynthesis monooxygenase  26.8 
 
 
94 aa  40.4  0.008  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_12430  hypothetical protein  27.47 
 
 
106 aa  40.4  0.008  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1743  antibiotic biosynthesis monooxygenase  29.29 
 
 
107 aa  40.4  0.008  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.969748 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>