17 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Amir_1263 on replicon NC_013093
Organism: Actinosynnema mirum DSM 43827



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013093  Amir_1263  Antibiotic biosynthesis monooxygenase  100 
 
 
127 aa  247  4e-65  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1939  hypothetical protein  40.7 
 
 
106 aa  66.2  0.0000000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.21696  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1181  antibiotic biosynthesis monooxygenase  40.86 
 
 
107 aa  63.9  0.0000000007  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.470172  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2056  hypothetical protein  39.58 
 
 
121 aa  62.4  0.000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.37981 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3435  antibiotic biosynthesis monooxygenase  42.86 
 
 
113 aa  61.2  0.000000005  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.170555 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1925  hypothetical protein  40.26 
 
 
109 aa  59.7  0.00000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000698289  decreased coverage  0.0001884 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3812  antibiotic biosynthesis monooxygenase  42.86 
 
 
113 aa  59.3  0.00000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.044204 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0739  Antibiotic biosynthesis monooxygenase  32.99 
 
 
113 aa  58.2  0.00000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.600892  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0860  hypothetical protein  34.88 
 
 
122 aa  57.4  0.00000007  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.511399  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3225  Antibiotic biosynthesis monooxygenase  32.22 
 
 
94 aa  55.8  0.0000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0744518  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2345  hypothetical protein  34.88 
 
 
92 aa  52.8  0.000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0269669  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2120  antibiotic biosynthesis monooxygenase  36.96 
 
 
132 aa  53.1  0.000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1665  Antibiotic biosynthesis monooxygenase  38.46 
 
 
97 aa  50.8  0.000007  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0475725  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1274  antibiotic biosynthesis monooxygenase  35.96 
 
 
190 aa  48.5  0.00003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.294501  normal  0.143096 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1600  Antibiotic biosynthesis monooxygenase  25.77 
 
 
112 aa  40.8  0.006  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.372361  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1509  antibiotic biosynthesis monooxygenase  34.55 
 
 
110 aa  40.8  0.006  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0675  Antibiotic biosynthesis monooxygenase  33.33 
 
 
106 aa  40  0.01  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>