13 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CPS_1390 on replicon NC_003910
Organism: Colwellia psychrerythraea 34H



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_003910  CPS_1390  hypothetical protein  100 
 
 		 41 aa  85.5  2e-16  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.391611  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0666  antibiotic biosynthesis monooxygenase  73.17 
 
 		 96 aa  65.5  0.0000000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0640  antibiotic biosynthesis monooxygenase  70.73 
 
 		 96 aa  65.1  0.0000000003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.83774  hitchhiker  0.00200112 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2795  antibiotic biosynthesis monooxygenase  73.17 
 
 		 100 aa  63.9  0.0000000007  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1406  antibiotic biosynthesis monooxygenase  65.85 
 
 		 96 aa  58.9  0.00000002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0852  lipoprotein  51.22 
 
 		 96 aa  49.3  0.00002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2453  antibiotic biosynthesis monooxygenase  56.1 
 
 		 96 aa  49.3  0.00002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.237842  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2954  antibiotic biosynthesis monooxygenase  55.56 
 
 		 112 aa  47  0.00009  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0569  antibiotic biosynthesis monooxygenase  53.85 
 
 		 95 aa  45.8  0.0002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1588  hypothetical protein  57.89 
 
 		 96 aa  46.2  0.0002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.113304  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4239  antibiotic biosynthesis monooxygenase  41.46 
 
 		 96 aa  45.4  0.0003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.467888 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0257  hypothetical protein  40 
 
 		 96 aa  43.5  0.001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0519  Antibiotic biosynthesis monooxygenase  45 
 
 		 96 aa  41.6  0.004  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>