52 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Xaut_1109 on replicon NC_009720
Organism: Xanthobacter autotrophicus Py2



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009720  Xaut_1109  antibiotic biosynthesis monooxygenase  100 
 
 
99 aa  207  4e-53  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4862  hypothetical protein  60 
 
 
96 aa  127  4.0000000000000003e-29  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.000241601  normal  0.301328 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0408  antibiotic biosynthesis monooxygenase  55.56 
 
 
99 aa  126  1.0000000000000001e-28  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0178675  normal  0.281119 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1730  Antibiotic biosynthesis monooxygenase  56.57 
 
 
99 aa  125  2.0000000000000002e-28  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.198039  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4326  antibiotic biosynthesis monooxygenase  61.05 
 
 
114 aa  124  5e-28  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0188457  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2236  antibiotic biosynthesis monooxygenase  50 
 
 
98 aa  113  6.9999999999999995e-25  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.766751  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5978  antibiotic biosynthesis monooxygenase  52.13 
 
 
97 aa  110  9e-24  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4704  antibiotic biosynthesis monooxygenase  51.58 
 
 
108 aa  109  1.0000000000000001e-23  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6274  antibiotic biosynthesis monooxygenase  52.13 
 
 
119 aa  109  1.0000000000000001e-23  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1906  antibiotic biosynthesis monooxygenase  51.02 
 
 
100 aa  108  3e-23  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.31273 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3482  Antibiotic biosynthesis monooxygenase  50.53 
 
 
97 aa  107  5e-23  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.688617  normal  0.1473 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4554  Antibiotic biosynthesis monooxygenase  50.53 
 
 
97 aa  107  5e-23  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0967865  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2864  Antibiotic biosynthesis monooxygenase  46.32 
 
 
99 aa  104  4e-22  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2638  antibiotic biosynthesis monooxygenase  45.45 
 
 
99 aa  103  8e-22  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2699  antibiotic biosynthesis monooxygenase  56.84 
 
 
100 aa  103  9e-22  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.100231  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3109  Antibiotic biosynthesis monooxygenase  51.55 
 
 
100 aa  102  2e-21  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.852917  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2674  antibiotic biosynthesis monooxygenase  54.64 
 
 
100 aa  101  3e-21  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.468682  normal  0.123613 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4588  hypothetical protein  52.58 
 
 
100 aa  101  4e-21  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.816951  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2710  antibiotic biosynthesis monooxygenase  53.61 
 
 
100 aa  100  8e-21  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.503062 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0526  Antibiotic biosynthesis monooxygenase  48.89 
 
 
93 aa  99  2e-20  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.213803  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0539  Antibiotic biosynthesis monooxygenase  47.78 
 
 
93 aa  97.1  8e-20  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1119  antibiotic biosynthesis monooxygenase  44.44 
 
 
99 aa  93.6  8e-19  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.18496  normal  0.355474 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3136  antibiotic biosynthesis monooxygenase  48.45 
 
 
140 aa  93.2  1e-18  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2130  antibiotic biosynthesis monooxygenase  38.54 
 
 
100 aa  89  2e-17  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  hitchhiker  0.00717432  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2566  antibiotic biosynthesis monooxygenase  42.71 
 
 
100 aa  87  7e-17  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.311695  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3364  antibiotic biosynthesis monooxygenase  50.55 
 
 
134 aa  86.7  1e-16  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00625137 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2814  antibiotic biosynthesis monooxygenase  37.5 
 
 
100 aa  86.7  1e-16  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.104146  hitchhiker  0.0000016777 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3856  antibiotic biosynthesis monooxygenase  40.22 
 
 
100 aa  85.9  2e-16  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0826  antibiotic biosynthesis monooxygenase  42.27 
 
 
107 aa  85.1  3e-16  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2761  Antibiotic biosynthesis monooxygenase  44.44 
 
 
99 aa  79.7  0.00000000000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1037  Antibiotic biosynthesis monooxygenase  47.42 
 
 
99 aa  79.3  0.00000000000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.415185  normal  0.485304 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4403  antibiotic biosynthesis monooxygenase  42.39 
 
 
101 aa  78.6  0.00000000000003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.171964  normal  0.768767 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2675  Antibiotic biosynthesis monooxygenase  39.8 
 
 
101 aa  76.6  0.0000000000001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7307  antibiotic biosynthesis monooxygenase  41.49 
 
 
123 aa  75.9  0.0000000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.163924  normal  0.114263 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4517  antibiotic biosynthesis monooxygenase  39.36 
 
 
115 aa  75.1  0.0000000000003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.60105  normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_21400  Antibiotic biosynthesis monooxygenase  44.93 
 
 
105 aa  67  0.00000000009  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1129  Antibiotic biosynthesis monooxygenase  46.88 
 
 
99 aa  65.5  0.0000000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.818332 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0131  Antibiotic biosynthesis monooxygenase  47.92 
 
 
96 aa  66.2  0.0000000002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3494  antibiotic biosynthesis monooxygenase  33.68 
 
 
100 aa  64.7  0.0000000004  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0268103  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3369  Antibiotic biosynthesis monooxygenase  44.21 
 
 
110 aa  64.3  0.0000000005  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1502  antibiotic biosynthesis monooxygenase  30.77 
 
 
114 aa  55.1  0.0000003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.714841  normal  0.694761 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1866  antibiotic biosynthesis monooxygenase  31.18 
 
 
99 aa  54.3  0.0000006  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.138048  normal  0.0354103 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3498  antibiotic biosynthesis monooxygenase  30.11 
 
 
99 aa  53.5  0.0000008  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1731  antibiotic biosynthesis monooxygenase  30.3 
 
 
122 aa  53.1  0.000001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00075589 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0248  globin  37.84 
 
 
257 aa  53.5  0.000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.552337  normal  0.72518 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3336  antibiotic biosynthesis monooxygenase  35.48 
 
 
107 aa  50.1  0.00001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8342  Truncated hemoglobins-like protein  28.12 
 
 
255 aa  46.2  0.0001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.414904 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3499  antibiotic biosynthesis monooxygenase  27.78 
 
 
99 aa  43.5  0.001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1865  antibiotic biosynthesis monooxygenase  27.78 
 
 
99 aa  42.7  0.002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.237236  normal  0.0159656 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7008  hypothetical protein  31.11 
 
 
99 aa  41.2  0.004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.560667 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4181  Antibiotic biosynthesis monooxygenase  30 
 
 
99 aa  41.2  0.005  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0161  NADP oxidoreductase coenzyme F420-dependent  33.33 
 
 
316 aa  40  0.01  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0733501  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>