51 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mnod_1730 on replicon NC_011894
Organism: Methylobacterium nodulans ORS 2060



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011894  Mnod_1730  Antibiotic biosynthesis monooxygenase  100 
 
 
99 aa  204  2e-52  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.198039  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0408  antibiotic biosynthesis monooxygenase  88.89 
 
 
99 aa  186  1e-46  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0178675  normal  0.281119 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2236  antibiotic biosynthesis monooxygenase  63.44 
 
 
98 aa  134  6.0000000000000005e-31  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.766751  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3109  Antibiotic biosynthesis monooxygenase  65.22 
 
 
100 aa  125  1.0000000000000001e-28  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.852917  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1109  antibiotic biosynthesis monooxygenase  56.57 
 
 
99 aa  125  2.0000000000000002e-28  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1906  antibiotic biosynthesis monooxygenase  59.79 
 
 
100 aa  124  3e-28  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.31273 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4588  hypothetical protein  63 
 
 
100 aa  124  6e-28  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.816951  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2674  antibiotic biosynthesis monooxygenase  65 
 
 
100 aa  124  6e-28  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.468682  normal  0.123613 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2710  antibiotic biosynthesis monooxygenase  66 
 
 
100 aa  123  8.000000000000001e-28  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.503062 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1119  antibiotic biosynthesis monooxygenase  58.59 
 
 
99 aa  123  1e-27  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.18496  normal  0.355474 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2638  antibiotic biosynthesis monooxygenase  56.57 
 
 
99 aa  122  2e-27  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2699  antibiotic biosynthesis monooxygenase  64.13 
 
 
100 aa  119  9e-27  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.100231  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4862  hypothetical protein  59.14 
 
 
96 aa  118  1.9999999999999998e-26  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.000241601  normal  0.301328 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2864  Antibiotic biosynthesis monooxygenase  54.55 
 
 
99 aa  117  3.9999999999999996e-26  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4326  antibiotic biosynthesis monooxygenase  56.99 
 
 
114 aa  117  3.9999999999999996e-26  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0188457  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4704  antibiotic biosynthesis monooxygenase  47.96 
 
 
108 aa  107  6e-23  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2130  antibiotic biosynthesis monooxygenase  49.48 
 
 
100 aa  103  1e-21  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  hitchhiker  0.00717432  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2761  Antibiotic biosynthesis monooxygenase  53.54 
 
 
99 aa  99.4  1e-20  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6274  antibiotic biosynthesis monooxygenase  48.94 
 
 
119 aa  97.8  4e-20  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5978  antibiotic biosynthesis monooxygenase  48.94 
 
 
97 aa  97.8  4e-20  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4554  Antibiotic biosynthesis monooxygenase  48.96 
 
 
97 aa  97.4  6e-20  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0967865  normal 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3482  Antibiotic biosynthesis monooxygenase  48.96 
 
 
97 aa  97.4  6e-20  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.688617  normal  0.1473 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2814  antibiotic biosynthesis monooxygenase  46.74 
 
 
100 aa  96.7  1e-19  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.104146  hitchhiker  0.0000016777 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3856  antibiotic biosynthesis monooxygenase  46.39 
 
 
100 aa  95.9  1e-19  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3136  antibiotic biosynthesis monooxygenase  43.88 
 
 
140 aa  93.2  1e-18  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0826  antibiotic biosynthesis monooxygenase  48.91 
 
 
107 aa  91.3  4e-18  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0539  Antibiotic biosynthesis monooxygenase  48.89 
 
 
93 aa  90.1  9e-18  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3364  antibiotic biosynthesis monooxygenase  45.92 
 
 
134 aa  89  2e-17  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00625137 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2566  antibiotic biosynthesis monooxygenase  45.36 
 
 
100 aa  88.6  2e-17  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.311695  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0526  Antibiotic biosynthesis monooxygenase  46.67 
 
 
93 aa  87  8e-17  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.213803  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4403  antibiotic biosynthesis monooxygenase  42.86 
 
 
101 aa  79.7  0.00000000000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.171964  normal  0.768767 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1037  Antibiotic biosynthesis monooxygenase  42.71 
 
 
99 aa  80.1  0.00000000000001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.415185  normal  0.485304 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7307  antibiotic biosynthesis monooxygenase  42.22 
 
 
123 aa  79.3  0.00000000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.163924  normal  0.114263 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4517  antibiotic biosynthesis monooxygenase  37.36 
 
 
115 aa  74.3  0.0000000000006  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.60105  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2675  Antibiotic biosynthesis monooxygenase  40.22 
 
 
101 aa  73.9  0.0000000000007  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3369  Antibiotic biosynthesis monooxygenase  41.84 
 
 
110 aa  71.2  0.000000000004  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_21400  Antibiotic biosynthesis monooxygenase  52.46 
 
 
105 aa  68.9  0.00000000002  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3494  antibiotic biosynthesis monooxygenase  36.26 
 
 
100 aa  68.6  0.00000000003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0268103  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0131  Antibiotic biosynthesis monooxygenase  46.15 
 
 
96 aa  68.2  0.00000000004  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1129  Antibiotic biosynthesis monooxygenase  42.11 
 
 
99 aa  65.1  0.0000000003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.818332 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1502  antibiotic biosynthesis monooxygenase  38.46 
 
 
114 aa  62  0.000000003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.714841  normal  0.694761 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1731  antibiotic biosynthesis monooxygenase  36.26 
 
 
122 aa  58.9  0.00000002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00075589 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3336  antibiotic biosynthesis monooxygenase  34.38 
 
 
107 aa  53.9  0.0000007  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0248  globin  25 
 
 
257 aa  49.7  0.00001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.552337  normal  0.72518 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1866  antibiotic biosynthesis monooxygenase  30 
 
 
99 aa  46.2  0.0002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.138048  normal  0.0354103 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0499  antibiotic biosynthesis monooxygenase  33.78 
 
 
96 aa  42.7  0.001  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0887  Antibiotic biosynthesis monooxygenase  28.57 
 
 
96 aa  42.7  0.002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3498  antibiotic biosynthesis monooxygenase  27.78 
 
 
99 aa  42  0.003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8342  Truncated hemoglobins-like protein  27.38 
 
 
255 aa  41.2  0.004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.414904 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2170  antibiotic biosynthesis monooxygenase  32.35 
 
 
107 aa  40.4  0.009  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.290975  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3499  antibiotic biosynthesis monooxygenase  26.6 
 
 
99 aa  40  0.01  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>