48 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Franean1_7307 on replicon NC_009921
Organism: Frankia sp. EAN1pec



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009921  Franean1_7307  antibiotic biosynthesis monooxygenase  100 
 
 
123 aa  240  3.9999999999999997e-63  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.163924  normal  0.114263 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4517  antibiotic biosynthesis monooxygenase  65.18 
 
 
115 aa  142  1e-33  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.60105  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3136  antibiotic biosynthesis monooxygenase  62.77 
 
 
140 aa  121  3e-27  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3364  antibiotic biosynthesis monooxygenase  62.77 
 
 
134 aa  110  7.000000000000001e-24  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00625137 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2638  antibiotic biosynthesis monooxygenase  45.56 
 
 
99 aa  87.8  5e-17  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1906  antibiotic biosynthesis monooxygenase  42.11 
 
 
100 aa  85.9  2e-16  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.31273 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2864  Antibiotic biosynthesis monooxygenase  44.44 
 
 
99 aa  84.7  4e-16  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3109  Antibiotic biosynthesis monooxygenase  40.43 
 
 
100 aa  81.6  0.000000000000003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.852917  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4588  hypothetical protein  39.36 
 
 
100 aa  81.6  0.000000000000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.816951  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2674  antibiotic biosynthesis monooxygenase  39.81 
 
 
100 aa  80.9  0.000000000000005  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.468682  normal  0.123613 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2710  antibiotic biosynthesis monooxygenase  41.75 
 
 
100 aa  80.5  0.000000000000006  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.503062 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1730  Antibiotic biosynthesis monooxygenase  42.22 
 
 
99 aa  79.3  0.00000000000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.198039  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3369  Antibiotic biosynthesis monooxygenase  44.76 
 
 
110 aa  79.3  0.00000000000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2236  antibiotic biosynthesis monooxygenase  40 
 
 
98 aa  79.3  0.00000000000002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.766751  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2699  antibiotic biosynthesis monooxygenase  40.43 
 
 
100 aa  78.2  0.00000000000004  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.100231  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2761  Antibiotic biosynthesis monooxygenase  45.56 
 
 
99 aa  77.8  0.00000000000005  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1109  antibiotic biosynthesis monooxygenase  41.49 
 
 
99 aa  75.9  0.0000000000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4554  Antibiotic biosynthesis monooxygenase  41.11 
 
 
97 aa  75.9  0.0000000000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0967865  normal 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3482  Antibiotic biosynthesis monooxygenase  41.11 
 
 
97 aa  75.9  0.0000000000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.688617  normal  0.1473 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2675  Antibiotic biosynthesis monooxygenase  36.67 
 
 
101 aa  75.5  0.0000000000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4704  antibiotic biosynthesis monooxygenase  34.38 
 
 
108 aa  75.9  0.0000000000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2566  antibiotic biosynthesis monooxygenase  42.55 
 
 
100 aa  75.5  0.0000000000002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.311695  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0526  Antibiotic biosynthesis monooxygenase  41.38 
 
 
93 aa  74.7  0.0000000000004  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.213803  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4326  antibiotic biosynthesis monooxygenase  35.71 
 
 
114 aa  74.7  0.0000000000004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0188457  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3856  antibiotic biosynthesis monooxygenase  40.66 
 
 
100 aa  74.7  0.0000000000004  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0131  Antibiotic biosynthesis monooxygenase  45.26 
 
 
96 aa  73.9  0.0000000000007  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4403  antibiotic biosynthesis monooxygenase  41.94 
 
 
101 aa  73.6  0.000000000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.171964  normal  0.768767 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0539  Antibiotic biosynthesis monooxygenase  40.23 
 
 
93 aa  72.8  0.000000000001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1037  Antibiotic biosynthesis monooxygenase  38.54 
 
 
99 aa  71.6  0.000000000003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.415185  normal  0.485304 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2814  antibiotic biosynthesis monooxygenase  36.26 
 
 
100 aa  71.2  0.000000000004  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.104146  hitchhiker  0.0000016777 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2130  antibiotic biosynthesis monooxygenase  36.26 
 
 
100 aa  70.1  0.00000000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  hitchhiker  0.00717432  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0408  antibiotic biosynthesis monooxygenase  38.14 
 
 
99 aa  68.9  0.00000000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0178675  normal  0.281119 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1119  antibiotic biosynthesis monooxygenase  36.67 
 
 
99 aa  68.9  0.00000000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.18496  normal  0.355474 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4862  hypothetical protein  34.83 
 
 
96 aa  68.2  0.00000000004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.000241601  normal  0.301328 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0826  antibiotic biosynthesis monooxygenase  34.65 
 
 
107 aa  64.3  0.0000000005  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5978  antibiotic biosynthesis monooxygenase  34.44 
 
 
97 aa  64.3  0.0000000005  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6274  antibiotic biosynthesis monooxygenase  34.44 
 
 
119 aa  63.9  0.0000000008  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1129  Antibiotic biosynthesis monooxygenase  40.62 
 
 
99 aa  63.2  0.000000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.818332 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3494  antibiotic biosynthesis monooxygenase  30 
 
 
100 aa  57  0.00000008  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0268103  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8342  Truncated hemoglobins-like protein  33.33 
 
 
255 aa  55.8  0.0000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.414904 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_21400  Antibiotic biosynthesis monooxygenase  41.94 
 
 
105 aa  54.3  0.0000005  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1502  antibiotic biosynthesis monooxygenase  31.87 
 
 
114 aa  54.3  0.0000005  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.714841  normal  0.694761 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1731  antibiotic biosynthesis monooxygenase  32.97 
 
 
122 aa  52.8  0.000002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00075589 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1450  Antibiotic biosynthesis monooxygenase  30 
 
 
252 aa  50.8  0.000006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0248  globin  28.89 
 
 
257 aa  49.7  0.00001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.552337  normal  0.72518 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3336  antibiotic biosynthesis monooxygenase  32.97 
 
 
107 aa  48.5  0.00003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0161  NADP oxidoreductase coenzyme F420-dependent  29.35 
 
 
316 aa  47.8  0.00005  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0733501  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3850  Antibiotic biosynthesis monooxygenase  28.57 
 
 
263 aa  42  0.003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  hitchhiker  0.000122426  normal  0.0184241 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>