50 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Strop_3136 on replicon NC_009380
Organism: Salinispora tropica CNB-440



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009380  Strop_3136  antibiotic biosynthesis monooxygenase  100 
 
 
140 aa  283  5e-76  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3364  antibiotic biosynthesis monooxygenase  88.29 
 
 
134 aa  184  4e-46  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00625137 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4517  antibiotic biosynthesis monooxygenase  62.24 
 
 
115 aa  124  5e-28  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.60105  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7307  antibiotic biosynthesis monooxygenase  62.77 
 
 
123 aa  121  3e-27  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.163924  normal  0.114263 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4704  antibiotic biosynthesis monooxygenase  42.42 
 
 
108 aa  93.6  9e-19  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2236  antibiotic biosynthesis monooxygenase  43.16 
 
 
98 aa  93.6  9e-19  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.766751  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1730  Antibiotic biosynthesis monooxygenase  43.88 
 
 
99 aa  93.2  1e-18  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.198039  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1109  antibiotic biosynthesis monooxygenase  48.45 
 
 
99 aa  93.2  1e-18  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0408  antibiotic biosynthesis monooxygenase  42.86 
 
 
99 aa  92.4  2e-18  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0178675  normal  0.281119 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1906  antibiotic biosynthesis monooxygenase  43.96 
 
 
100 aa  90.1  9e-18  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.31273 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2638  antibiotic biosynthesis monooxygenase  42.86 
 
 
99 aa  89.7  1e-17  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3856  antibiotic biosynthesis monooxygenase  45.16 
 
 
100 aa  88.6  3e-17  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2864  Antibiotic biosynthesis monooxygenase  40.66 
 
 
99 aa  85.5  2e-16  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4326  antibiotic biosynthesis monooxygenase  41.05 
 
 
114 aa  84.7  3e-16  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0188457  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2814  antibiotic biosynthesis monooxygenase  41.49 
 
 
100 aa  84.7  4e-16  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.104146  hitchhiker  0.0000016777 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2130  antibiotic biosynthesis monooxygenase  41.94 
 
 
100 aa  83.2  0.000000000000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  hitchhiker  0.00717432  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0131  Antibiotic biosynthesis monooxygenase  53.12 
 
 
96 aa  82.8  0.000000000000001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4862  hypothetical protein  41.05 
 
 
96 aa  83.2  0.000000000000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.000241601  normal  0.301328 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2675  Antibiotic biosynthesis monooxygenase  37.37 
 
 
101 aa  82  0.000000000000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4588  hypothetical protein  40.66 
 
 
100 aa  80.9  0.000000000000005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.816951  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3109  Antibiotic biosynthesis monooxygenase  40.66 
 
 
100 aa  80.5  0.000000000000007  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.852917  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3482  Antibiotic biosynthesis monooxygenase  42.86 
 
 
97 aa  79.3  0.00000000000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.688617  normal  0.1473 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2761  Antibiotic biosynthesis monooxygenase  45.05 
 
 
99 aa  79  0.00000000000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4554  Antibiotic biosynthesis monooxygenase  42.86 
 
 
97 aa  79.3  0.00000000000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0967865  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2699  antibiotic biosynthesis monooxygenase  41.76 
 
 
100 aa  78.6  0.00000000000003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.100231  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2566  antibiotic biosynthesis monooxygenase  42.71 
 
 
100 aa  77.8  0.00000000000005  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.311695  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6274  antibiotic biosynthesis monooxygenase  38.71 
 
 
119 aa  75.1  0.0000000000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0826  antibiotic biosynthesis monooxygenase  41.94 
 
 
107 aa  75.1  0.0000000000003  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2710  antibiotic biosynthesis monooxygenase  41.05 
 
 
100 aa  75.1  0.0000000000003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.503062 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2674  antibiotic biosynthesis monooxygenase  39.56 
 
 
100 aa  74.7  0.0000000000004  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.468682  normal  0.123613 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0526  Antibiotic biosynthesis monooxygenase  42.53 
 
 
93 aa  74.3  0.0000000000005  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.213803  normal 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5978  antibiotic biosynthesis monooxygenase  38.46 
 
 
97 aa  73.9  0.0000000000007  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0539  Antibiotic biosynthesis monooxygenase  41.38 
 
 
93 aa  73.2  0.000000000001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1119  antibiotic biosynthesis monooxygenase  35.79 
 
 
99 aa  71.6  0.000000000003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.18496  normal  0.355474 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1037  Antibiotic biosynthesis monooxygenase  41.67 
 
 
99 aa  71.2  0.000000000004  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.415185  normal  0.485304 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3369  Antibiotic biosynthesis monooxygenase  37.37 
 
 
110 aa  71.2  0.000000000005  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4403  antibiotic biosynthesis monooxygenase  37.23 
 
 
101 aa  68.2  0.00000000004  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.171964  normal  0.768767 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3494  antibiotic biosynthesis monooxygenase  29.29 
 
 
100 aa  67.8  0.00000000005  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0268103  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_21400  Antibiotic biosynthesis monooxygenase  41.94 
 
 
105 aa  58.9  0.00000002  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1129  Antibiotic biosynthesis monooxygenase  41.67 
 
 
99 aa  58.2  0.00000004  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.818332 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1731  antibiotic biosynthesis monooxygenase  30.77 
 
 
122 aa  52  0.000002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00075589 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1502  antibiotic biosynthesis monooxygenase  30.85 
 
 
114 aa  51.2  0.000004  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.714841  normal  0.694761 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0248  globin  27.96 
 
 
257 aa  49.7  0.00001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.552337  normal  0.72518 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3336  antibiotic biosynthesis monooxygenase  32.97 
 
 
107 aa  50.1  0.00001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8342  Truncated hemoglobins-like protein  29.35 
 
 
255 aa  43.1  0.001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.414904 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0161  NADP oxidoreductase coenzyme F420-dependent  30.77 
 
 
316 aa  42.4  0.002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0733501  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1450  Antibiotic biosynthesis monooxygenase  26.09 
 
 
252 aa  42  0.003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4321  hypothetical protein  36.84 
 
 
107 aa  41.6  0.004  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2683  hypothetical protein  33.33 
 
 
95 aa  41.2  0.005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.618339  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1420  antibiotic biosynthesis monooxygenase  34 
 
 
95 aa  40.4  0.008  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.307712  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>