50 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rmet_4862 on replicon NC_007974
Organism: Cupriavidus metallidurans CH34



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007974  Rmet_4862  hypothetical protein  100 
 
 		 96 aa  202  1e-51  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.000241601  normal  0.301328 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4326  antibiotic biosynthesis monooxygenase  71.88 
 
 		 114 aa  153  8e-37  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0188457  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1109  antibiotic biosynthesis monooxygenase  60 
 
 		 99 aa  127  4.0000000000000003e-29  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0408  antibiotic biosynthesis monooxygenase  61.05 
 
 		 99 aa  124  4.0000000000000003e-28  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0178675  normal  0.281119 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2236  antibiotic biosynthesis monooxygenase  58.33 
 
 		 98 aa  122  2e-27  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.766751  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1730  Antibiotic biosynthesis monooxygenase  59.14 
 
 		 99 aa  118  1.9999999999999998e-26  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.198039  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1906  antibiotic biosynthesis monooxygenase  55.79 
 
 		 100 aa  115  1.9999999999999998e-25  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.31273 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3109  Antibiotic biosynthesis monooxygenase  55.21 
 
 		 100 aa  114  3.9999999999999997e-25  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.852917  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6274  antibiotic biosynthesis monooxygenase  56.25 
 
 		 119 aa  114  5e-25  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5978  antibiotic biosynthesis monooxygenase  56.25 
 
 		 97 aa  114  6e-25  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2710  antibiotic biosynthesis monooxygenase  58.33 
 
 		 100 aa  111  4.0000000000000004e-24  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.503062 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3482  Antibiotic biosynthesis monooxygenase  54.17 
 
 		 97 aa  110  6e-24  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.688617  normal  0.1473 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4554  Antibiotic biosynthesis monooxygenase  54.17 
 
 		 97 aa  110  6e-24  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0967865  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4704  antibiotic biosynthesis monooxygenase  50 
 
 		 108 aa  110  7.000000000000001e-24  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2674  antibiotic biosynthesis monooxygenase  57.29 
 
 		 100 aa  109  1.0000000000000001e-23  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.468682  normal  0.123613 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4588  hypothetical protein  57.29 
 
 		 100 aa  108  3e-23  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.816951  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2699  antibiotic biosynthesis monooxygenase  55.21 
 
 		 100 aa  107  6e-23  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.100231  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0526  Antibiotic biosynthesis monooxygenase  54.35 
 
 		 93 aa  106  1e-22  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.213803  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0539  Antibiotic biosynthesis monooxygenase  54.35 
 
 		 93 aa  105  2e-22  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2638  antibiotic biosynthesis monooxygenase  46.88 
 
 		 99 aa  97.8  4e-20  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1119  antibiotic biosynthesis monooxygenase  46.88 
 
 		 99 aa  97.4  6e-20  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.18496  normal  0.355474 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2864  Antibiotic biosynthesis monooxygenase  44.79 
 
 		 99 aa  93.6  9e-19  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2814  antibiotic biosynthesis monooxygenase  40.21 
 
 		 100 aa  87  8e-17  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.104146  hitchhiker  0.0000016777 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3856  antibiotic biosynthesis monooxygenase  41.3 
 
 		 100 aa  84  7e-16  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3136  antibiotic biosynthesis monooxygenase  41.05 
 
 		 140 aa  83.2  0.000000000000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0826  antibiotic biosynthesis monooxygenase  44.79 
 
 		 107 aa  83.2  0.000000000000001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2130  antibiotic biosynthesis monooxygenase  39.58 
 
 		 100 aa  82  0.000000000000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  hitchhiker  0.00717432  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2566  antibiotic biosynthesis monooxygenase  42.71 
 
 		 100 aa  80.1  0.00000000000001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.311695  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1037  Antibiotic biosynthesis monooxygenase  37.5 
 
 		 99 aa  74.3  0.0000000000006  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.415185  normal  0.485304 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3364  antibiotic biosynthesis monooxygenase  41.05 
 
 		 134 aa  73.2  0.000000000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00625137 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4403  antibiotic biosynthesis monooxygenase  40.22 
 
 		 101 aa  71.6  0.000000000003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.171964  normal  0.768767 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2761  Antibiotic biosynthesis monooxygenase  44.79 
 
 		 99 aa  71.6  0.000000000003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4517  antibiotic biosynthesis monooxygenase  34.04 
 
 		 115 aa  70.1  0.00000000001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.60105  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7307  antibiotic biosynthesis monooxygenase  34.83 
 
 		 123 aa  68.2  0.00000000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.163924  normal  0.114263 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2675  Antibiotic biosynthesis monooxygenase  35.79 
 
 		 101 aa  67.8  0.00000000005  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3494  antibiotic biosynthesis monooxygenase  35.42 
 
 		 100 aa  67.8  0.00000000005  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0268103  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1502  antibiotic biosynthesis monooxygenase  36.56 
 
 		 114 aa  66.2  0.0000000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.714841  normal  0.694761 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0131  Antibiotic biosynthesis monooxygenase  46.32 
 
 		 96 aa  65.5  0.0000000002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_21400  Antibiotic biosynthesis monooxygenase  44.93 
 
 		 105 aa  64.3  0.0000000006  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1129  Antibiotic biosynthesis monooxygenase  38.54 
 
 		 99 aa  62.4  0.000000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.818332 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3369  Antibiotic biosynthesis monooxygenase  42.11 
 
 		 110 aa  62  0.000000003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1731  antibiotic biosynthesis monooxygenase  33.7 
 
 		 122 aa  59.7  0.00000001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00075589 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3336  antibiotic biosynthesis monooxygenase  32.61 
 
 		 107 aa  54.7  0.0000005  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4181  Antibiotic biosynthesis monooxygenase  30.43 
 
 		 99 aa  48.5  0.00003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3499  antibiotic biosynthesis monooxygenase  25.84 
 
 		 99 aa  47.8  0.00005  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1865  antibiotic biosynthesis monooxygenase  25.84 
 
 		 99 aa  47.4  0.00007  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.237236  normal  0.0159656 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7008  hypothetical protein  29.21 
 
 		 99 aa  46.2  0.0001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.560667 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0248  globin  28.4 
 
 		 257 aa  43.5  0.001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.552337  normal  0.72518 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5004  antibiotic biosynthesis monooxygenase  28.42 
 
 		 93 aa  41.6  0.003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.610336  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8342  Truncated hemoglobins-like protein  31.94 
 
 		 255 aa  40.8  0.007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.414904 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>