48 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shewmr4_1079 on replicon NC_008321
Organism: Shewanella sp. MR-4



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008321  Shewmr4_1079  globin  100 
 
 		 163 aa  337  5.9999999999999996e-92  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3117  globin  78.66 
 
 		 158 aa  259  8.999999999999999e-69  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.746376  normal  0.148151 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3320  globin  70.78 
 
 		 158 aa  223  8e-58  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.808625 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3176  globin  70.13 
 
 		 158 aa  220  4.9999999999999996e-57  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1194  globin  68.83 
 
 		 158 aa  218  3e-56  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3177  globin  68.18 
 
 		 158 aa  215  2e-55  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0373  globin  57.33 
 
 		 159 aa  174  3e-43  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00000584442  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3911  globin  59.84 
 
 		 143 aa  164  4e-40  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4206  protozoan/cyanobacterial globin family protein  45.19 
 
 		 140 aa  125  3e-28  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3940  hypothetical protein  43.14 
 
 		 142 aa  125  3e-28  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0304408  hitchhiker  0.00309089 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1229  globin  50 
 
 		 139 aa  120  9.999999999999999e-27  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.435049  normal  0.149006 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1242  globin family protein  41.55 
 
 		 145 aa  113  8.999999999999998e-25  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.954597  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1232  globin protein  37.06 
 
 		 147 aa  107  1e-22  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.142664  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1809  globin  34.9 
 
 		 143 aa  99  2e-20  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0254  globin  37.7 
 
 		 144 aa  94.4  6e-19  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01283  cyanoglobin  36.03 
 
 		 131 aa  92  3e-18  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.678014  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2350  globin  39.34 
 
 		 144 aa  89.4  2e-17  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3162  globin  37.5 
 
 		 147 aa  87  1e-16  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.408316  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1425  globin  32.5 
 
 		 146 aa  79  0.00000000000002  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03174  globin family protein  31.45 
 
 		 143 aa  75.5  0.0000000000003  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3674  globin  31.58 
 
 		 121 aa  72.8  0.000000000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1963  globin  32.5 
 
 		 175 aa  72  0.000000000004  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.230814  normal  0.0183414 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1894  globin  32.77 
 
 		 122 aa  70.1  0.00000000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00177457  normal  0.142555 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3681  globin  32.23 
 
 		 141 aa  68.6  0.00000000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.18078  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2581  globin  32.74 
 
 		 119 aa  66.2  0.0000000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.257068  normal  0.85949 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2015  globin  30.19 
 
 		 121 aa  61.2  0.000000006  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5169  globin  31.37 
 
 		 124 aa  59.7  0.00000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00113339 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2981  globin  27.19 
 
 		 124 aa  59.7  0.00000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.175312  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4165  globin  26.32 
 
 		 128 aa  59.3  0.00000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4508  globin  24.56 
 
 		 121 aa  56.2  0.0000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.374683  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2228  globin  27.83 
 
 		 153 aa  56.2  0.0000002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.134976  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4595  globin  24.56 
 
 		 121 aa  56.2  0.0000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.676061 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4891  globin  24.56 
 
 		 121 aa  56.2  0.0000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.299663 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11575  hemoglobin glbN  24.14 
 
 		 136 aa  55.8  0.0000003  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0724  globin  31.87 
 
 		 116 aa  55.5  0.0000003  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3264  globin  29.03 
 
 		 124 aa  55.5  0.0000003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013746  Htur_4821  globin  29.17 
 
 		 108 aa  53.9  0.0000008  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3548  globin  23.28 
 
 		 119 aa  53.5  0.000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.209186  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1552  globin  22.41 
 
 		 121 aa  53.1  0.000002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2252  globin  27.27 
 
 		 120 aa  52.8  0.000002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.457276  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2507  hypothetical protein  32.54 
 
 		 134 aa  51.2  0.000006  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.98006  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2328  globin  23.58 
 
 		 120 aa  49.3  0.00002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.313085 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0052  globin  23.28 
 
 		 122 aa  48.1  0.00005  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0576  globin  29.7 
 
 		 121 aa  47.4  0.00009  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1609  globin  27.27 
 
 		 132 aa  44.7  0.0005  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.650446  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0187  globin  27.56 
 
 		 124 aa  42  0.003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3685  globin  27 
 
 		 124 aa  42  0.003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0182  globin  27.56 
 
 		 124 aa  42  0.003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.96445  normal  0.330337 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>