43 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sde_1242 on replicon NC_007912
Organism: Saccharophagus degradans 2-40



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007912  Sde_1242  globin family protein  100 
 
 		 145 aa  296  4e-80  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.954597  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3117  globin  43.66 
 
 		 158 aa  121  3e-27  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.746376  normal  0.148151 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1079  globin  41.55 
 
 		 163 aa  113  6.9999999999999995e-25  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3940  hypothetical protein  39.72 
 
 		 142 aa  111  4.0000000000000004e-24  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0304408  hitchhiker  0.00309089 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4206  protozoan/cyanobacterial globin family protein  39.57 
 
 		 140 aa  110  4.0000000000000004e-24  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1194  globin  42.74 
 
 		 158 aa  109  1.0000000000000001e-23  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3911  globin  42.19 
 
 		 143 aa  108  2.0000000000000002e-23  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3177  globin  41.88 
 
 		 158 aa  108  3e-23  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3320  globin  42.74 
 
 		 158 aa  107  4.0000000000000004e-23  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.808625 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3176  globin  42.74 
 
 		 158 aa  108  4.0000000000000004e-23  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0373  globin  41.13 
 
 		 159 aa  106  1e-22  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00000584442  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1229  globin  40.17 
 
 		 139 aa  97.4  5e-20  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.435049  normal  0.149006 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01283  cyanoglobin  40.32 
 
 		 131 aa  93.6  7e-19  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.678014  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1232  globin protein  36.21 
 
 		 147 aa  91.7  3e-18  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.142664  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0254  globin  33.33 
 
 		 144 aa  85.9  1e-16  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3162  globin  36.21 
 
 		 147 aa  85.1  3e-16  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.408316  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1963  globin  36.28 
 
 		 175 aa  82.4  0.000000000000002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.230814  normal  0.0183414 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2350  globin  39.29 
 
 		 144 aa  79.7  0.00000000000001  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1425  globin  30.43 
 
 		 146 aa  78.6  0.00000000000003  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1809  globin  28.87 
 
 		 143 aa  78.2  0.00000000000004  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3681  globin  32.46 
 
 		 141 aa  76.3  0.0000000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.18078  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2581  globin  28.95 
 
 		 119 aa  65.5  0.0000000003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.257068  normal  0.85949 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03174  globin family protein  27.01 
 
 		 143 aa  62.4  0.000000002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3674  globin  24.14 
 
 		 121 aa  58.2  0.00000004  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2015  globin  25.22 
 
 		 121 aa  55.8  0.0000002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11575  hemoglobin glbN  23.01 
 
 		 136 aa  55.1  0.0000003  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2981  globin  24.56 
 
 		 124 aa  53.9  0.0000007  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.175312  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4595  globin  23.15 
 
 		 121 aa  51.6  0.000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.676061 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4508  globin  23.15 
 
 		 121 aa  51.6  0.000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.374683  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3548  globin  28.07 
 
 		 119 aa  52  0.000003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.209186  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4891  globin  23.15 
 
 		 121 aa  51.6  0.000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.299663 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0724  globin  32.63 
 
 		 116 aa  50.4  0.000009  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0052  globin  26.27 
 
 		 122 aa  46.6  0.0001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3264  globin  25.81 
 
 		 124 aa  46.2  0.0002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2215  hypothetical protein  21.37 
 
 		 188 aa  44.3  0.0005  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.307711  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1552  globin  22.88 
 
 		 121 aa  44.7  0.0005  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2228  globin  26.17 
 
 		 153 aa  43.9  0.0007  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.134976  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2328  globin  22.86 
 
 		 120 aa  43.9  0.0007  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.313085 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4165  globin  22.41 
 
 		 128 aa  43.1  0.001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013746  Htur_4821  globin  22.33 
 
 		 108 aa  43.5  0.001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5169  globin  23 
 
 		 124 aa  42.7  0.002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00113339 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2252  globin  21.9 
 
 		 120 aa  42.4  0.002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.457276  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0645  globin  22.73 
 
 		 125 aa  40  0.01  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>