93 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mflv_3264 on replicon NC_009338
Organism: Mycobacterium gilvum PYR-GCK



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009338  Mflv_3264  globin  100 
 
 
124 aa  248  2e-65  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2981  globin  78.05 
 
 
124 aa  191  3e-48  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.175312  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3681  globin  55.65 
 
 
141 aa  126  1.0000000000000001e-28  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.18078  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2581  globin  54.78 
 
 
119 aa  124  4.0000000000000003e-28  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.257068  normal  0.85949 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0576  globin  47.62 
 
 
121 aa  107  4.0000000000000004e-23  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5169  globin  44.44 
 
 
124 aa  103  8e-22  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00113339 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2507  hypothetical protein  45.19 
 
 
134 aa  102  3e-21  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.98006  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4165  globin  47.37 
 
 
128 aa  100  6e-21  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4508  globin  44.25 
 
 
121 aa  100  7e-21  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.374683  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11575  hemoglobin glbN  41.67 
 
 
136 aa  100  7e-21  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4891  globin  44.25 
 
 
121 aa  100  7e-21  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.299663 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4595  globin  44.25 
 
 
121 aa  100  7e-21  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.676061 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0187  globin  40.57 
 
 
124 aa  94.7  3e-19  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0182  globin  40.57 
 
 
124 aa  94.7  3e-19  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.96445  normal  0.330337 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3685  globin  42.45 
 
 
124 aa  94.4  5e-19  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2015  globin  38.94 
 
 
121 aa  93.6  7e-19  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2601  hypothetical protein  40.95 
 
 
124 aa  92.8  1e-18  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3674  globin  38.6 
 
 
121 aa  92  2e-18  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2457  hypothetical protein  35.59 
 
 
124 aa  92  2e-18  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1894  globin  38.6 
 
 
122 aa  86.7  1e-16  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00177457  normal  0.142555 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1552  globin  37.93 
 
 
121 aa  84.7  3e-16  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013746  Htur_4821  globin  32.04 
 
 
108 aa  72  0.000000000003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03174  globin family protein  31.58 
 
 
143 aa  68.9  0.00000000002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0645  globin  39.33 
 
 
125 aa  68.6  0.00000000003  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0724  globin  32.94 
 
 
116 aa  67.4  0.00000000007  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0578  globin  31.93 
 
 
127 aa  65.9  0.0000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1079  globin  28.07 
 
 
163 aa  65.1  0.0000000003  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3911  globin  30.7 
 
 
143 aa  63.9  0.0000000006  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0180  globin  35.04 
 
 
133 aa  61.6  0.000000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3117  globin  27.19 
 
 
158 aa  61.2  0.000000005  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.746376  normal  0.148151 
 
 
-
 
NC_011682  PHATRDRAFT_37957  predicted protein  32.17 
 
 
194 aa  60.8  0.000000005  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.961244  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3177  globin  26.55 
 
 
158 aa  60.5  0.000000008  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1194  globin  26.55 
 
 
158 aa  60.1  0.00000001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3320  globin  26.32 
 
 
158 aa  58.5  0.00000003  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.808625 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3176  globin  26.32 
 
 
158 aa  58.5  0.00000003  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011675  PHATRDRAFT_19954  predicted protein  29.41 
 
 
176 aa  57.8  0.00000005  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.127434  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1225  globin  33.64 
 
 
125 aa  57  0.00000009  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0341074  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2228  globin  29.57 
 
 
153 aa  56.6  0.0000001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.134976  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1809  globin  25.44 
 
 
143 aa  56.6  0.0000001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1232  globin protein  26.32 
 
 
147 aa  56.6  0.0000001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.142664  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4206  protozoan/cyanobacterial globin family protein  23.48 
 
 
140 aa  54.7  0.0000004  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3940  hypothetical protein  25.22 
 
 
142 aa  54.3  0.0000006  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0304408  hitchhiker  0.00309089 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1242  globin family protein  24.56 
 
 
145 aa  53.5  0.0000008  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.954597  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0254  globin  23.68 
 
 
144 aa  53.5  0.000001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2215  hypothetical protein  28.83 
 
 
188 aa  51.6  0.000003  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.307711  n/a   
 
 
-
 
NC_011689  PHATRDRAFT_39797  predicted protein  30.83 
 
 
164 aa  50.8  0.000006  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3162  globin  25.44 
 
 
147 aa  49.7  0.00001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.408316  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3548  globin  23.68 
 
 
119 aa  49.7  0.00001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.209186  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0373  globin  27.66 
 
 
159 aa  48.9  0.00002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00000584442  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2252  globin  24.72 
 
 
120 aa  48.1  0.00003  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.457276  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1425  globin  23.21 
 
 
146 aa  48.1  0.00004  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1609  globin  27.45 
 
 
132 aa  48.1  0.00004  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.650446  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01283  cyanoglobin  24.56 
 
 
131 aa  48.1  0.00004  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.678014  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2180  globin  28.12 
 
 
133 aa  48.1  0.00004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2328  globin  29.91 
 
 
120 aa  47.8  0.00005  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.313085 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1243  globin  35.79 
 
 
133 aa  47.8  0.00005  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1229  globin  25.84 
 
 
139 aa  47.4  0.00008  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.435049  normal  0.149006 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2350  globin  23.68 
 
 
144 aa  47  0.00009  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1754  globin like protein  26.56 
 
 
133 aa  47  0.00009  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1626  globin  27.05 
 
 
137 aa  46.6  0.0001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0697  globin  27.27 
 
 
142 aa  46.6  0.0001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.462727 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0783  globin  35.42 
 
 
133 aa  46.2  0.0001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.259249 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0771  globin  25.41 
 
 
137 aa  45.8  0.0002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2086  globin  25.78 
 
 
133 aa  45.1  0.0003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4636  globin  26.47 
 
 
150 aa  44.3  0.0005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0856308  normal  0.0106718 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1105  globin  28.23 
 
 
132 aa  44.7  0.0005  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1250  globin family protein  28.23 
 
 
132 aa  44.3  0.0006  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0052  globin  25.64 
 
 
122 aa  44.3  0.0006  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1355  globin family protein  28.46 
 
 
132 aa  43.9  0.0007  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1116  hypothetical protein  28.23 
 
 
132 aa  43.9  0.0007  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1209  hypothetical protein  28.23 
 
 
132 aa  43.9  0.0007  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4091  globin family protein  28.23 
 
 
132 aa  43.9  0.0008  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1279  globin family protein  28.23 
 
 
132 aa  43.9  0.0008  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1317  hypothetical protein  28.23 
 
 
132 aa  43.9  0.0008  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.997153  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1092  globin family protein  28.23 
 
 
132 aa  43.9  0.0008  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.720422  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1098  globin family protein  28.23 
 
 
132 aa  43.9  0.0008  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1256  globin  27.68 
 
 
137 aa  43.1  0.001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.331075 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1963  globin  24.78 
 
 
175 aa  42.4  0.002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.230814  normal  0.0183414 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0582  hypothetical protein  30.26 
 
 
147 aa  42.4  0.002  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.709558  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4496  hypothetical protein  28.57 
 
 
193 aa  42.4  0.002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.172585  normal  0.0197975 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0410  globin  34.94 
 
 
144 aa  42.7  0.002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.236118 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4363  hypothetical protein  28.57 
 
 
193 aa  42.4  0.002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3425  globin  24.32 
 
 
173 aa  42  0.003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.646541 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2637  globin  28.43 
 
 
153 aa  42  0.003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.4032 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1823  globin  29.49 
 
 
145 aa  41.2  0.004  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000381812  normal  0.0630387 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1767  globin  32.14 
 
 
137 aa  41.6  0.004  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2419  globin  35.59 
 
 
123 aa  41.2  0.005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3538  globin  26.47 
 
 
142 aa  40.8  0.006  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.637564  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5890  putative hemoglobin protein (truncated hemoglobin)  28.04 
 
 
152 aa  40.4  0.008  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.429127  normal  0.556027 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1333  globin  22.76 
 
 
127 aa  40.4  0.008  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.143229  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1001  globin  33.33 
 
 
121 aa  40  0.01  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.621706  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1020  globin  33.33 
 
 
121 aa  40  0.01  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.0280188  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1114  globin  27.97 
 
 
151 aa  40  0.01  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>