50 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pnap_3162 on replicon NC_008781
Organism: Polaromonas naphthalenivorans CJ2



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008781  Pnap_3162  globin  100 
 
 		 147 aa  303  6e-82  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.408316  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1232  globin protein  56.45 
 
 		 147 aa  154  5.0000000000000005e-37  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.142664  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1963  globin  47.97 
 
 		 175 aa  126  9.000000000000001e-29  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.230814  normal  0.0183414 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1229  globin  43.8 
 
 		 139 aa  110  4.0000000000000004e-24  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.435049  normal  0.149006 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3940  hypothetical protein  35.42 
 
 		 142 aa  101  3e-21  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0304408  hitchhiker  0.00309089 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4206  protozoan/cyanobacterial globin family protein  34.72 
 
 		 140 aa  98.2  3e-20  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01283  cyanoglobin  38.1 
 
 		 131 aa  94.4  5e-19  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.678014  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3176  globin  37.4 
 
 		 158 aa  94  6e-19  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3320  globin  37.4 
 
 		 158 aa  93.6  7e-19  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.808625 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3117  globin  35.86 
 
 		 158 aa  93.2  1e-18  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.746376  normal  0.148151 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03174  globin family protein  35.56 
 
 		 143 aa  93.2  1e-18  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3177  globin  37.5 
 
 		 158 aa  92  2e-18  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3911  globin  38.05 
 
 		 143 aa  91.7  3e-18  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1194  globin  36.64 
 
 		 158 aa  90.5  7e-18  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1242  globin family protein  37.12 
 
 		 145 aa  89.4  2e-17  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.954597  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1079  globin  33.55 
 
 		 163 aa  87.8  4e-17  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1425  globin  36.28 
 
 		 146 aa  87.4  5e-17  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2350  globin  38.94 
 
 		 144 aa  87.8  5e-17  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0254  globin  30.56 
 
 		 144 aa  77  0.00000000000007  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1809  globin  27.94 
 
 		 143 aa  77  0.00000000000009  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0373  globin  31.97 
 
 		 159 aa  74.7  0.0000000000004  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00000584442  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2581  globin  32.76 
 
 		 119 aa  73.6  0.0000000000008  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.257068  normal  0.85949 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4165  globin  33.62 
 
 		 128 aa  72.8  0.000000000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3681  globin  29.06 
 
 		 141 aa  68.6  0.00000000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.18078  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11575  hemoglobin glbN  31.3 
 
 		 136 aa  62.8  0.000000001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3674  globin  25.42 
 
 		 121 aa  62.4  0.000000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0724  globin  33.94 
 
 		 116 aa  61.2  0.000000005  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3548  globin  26.55 
 
 		 119 aa  60.5  0.000000007  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.209186  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0645  globin  29.55 
 
 		 125 aa  60.1  0.00000001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2228  globin  27.87 
 
 		 153 aa  58.9  0.00000002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.134976  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2252  globin  24.14 
 
 		 120 aa  58.9  0.00000002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.457276  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4891  globin  29.31 
 
 		 121 aa  58.2  0.00000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.299663 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4508  globin  29.31 
 
 		 121 aa  58.2  0.00000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.374683  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4595  globin  29.31 
 
 		 121 aa  58.2  0.00000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.676061 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0052  globin  27.05 
 
 		 122 aa  57.8  0.00000005  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2981  globin  26.96 
 
 		 124 aa  57.8  0.00000005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.175312  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1552  globin  23.89 
 
 		 121 aa  55.8  0.0000002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1894  globin  29.46 
 
 		 122 aa  55.8  0.0000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00177457  normal  0.142555 
 
 
-
 
NC_013746  Htur_4821  globin  31.43 
 
 		 108 aa  54.3  0.0000005  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2086  globin  22.56 
 
 		 133 aa  53.5  0.000001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1754  globin like protein  22.56 
 
 		 133 aa  53.1  0.000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4496  hypothetical protein  26.8 
 
 		 193 aa  53.1  0.000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.172585  normal  0.0197975 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4363  hypothetical protein  26.8 
 
 		 193 aa  53.1  0.000001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2180  globin  21.8 
 
 		 133 aa  50.8  0.000006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2328  globin  23.48 
 
 		 120 aa  48.9  0.00002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.313085 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2015  globin  26.19 
 
 		 121 aa  48.9  0.00002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2507  hypothetical protein  30.3 
 
 		 134 aa  44.3  0.0005  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.98006  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3264  globin  27.08 
 
 		 124 aa  42.4  0.002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0187  globin  28.23 
 
 		 124 aa  41.2  0.005  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0182  globin  28.23 
 
 		 124 aa  41.2  0.005  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.96445  normal  0.330337 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>