53 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ssed_2252 on replicon NC_009831
Organism: Shewanella sediminis HAW-EB3



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009831  Ssed_2252  globin  100 
 
 		 120 aa  246  1e-64  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.457276  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2328  globin  60.83 
 
 		 120 aa  164  2.9999999999999998e-40  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.313085 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3548  globin  49.12 
 
 		 119 aa  127  4.0000000000000003e-29  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.209186  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2228  globin  50.85 
 
 		 153 aa  126  1.0000000000000001e-28  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.134976  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0052  globin  48.74 
 
 		 122 aa  123  9e-28  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1754  globin like protein  42.64 
 
 		 133 aa  118  3e-26  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2086  globin  41.86 
 
 		 133 aa  116  9.999999999999999e-26  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2180  globin  41.09 
 
 		 133 aa  114  5e-25  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1894  globin  30 
 
 		 122 aa  65.1  0.0000000003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00177457  normal  0.142555 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1809  globin  27.19 
 
 		 143 aa  62  0.000000003  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0254  globin  28.21 
 
 		 144 aa  61.2  0.000000005  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3940  hypothetical protein  28.21 
 
 		 142 aa  59.3  0.00000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0304408  hitchhiker  0.00309089 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1552  globin  26.67 
 
 		 121 aa  58.9  0.00000002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3162  globin  24.14 
 
 		 147 aa  58.9  0.00000003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.408316  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1963  globin  29.17 
 
 		 175 aa  58.5  0.00000003  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.230814  normal  0.0183414 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1229  globin  28.45 
 
 		 139 aa  58.2  0.00000004  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.435049  normal  0.149006 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1425  globin  28.57 
 
 		 146 aa  57.4  0.00000006  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2015  globin  30.51 
 
 		 121 aa  56.2  0.0000001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4206  protozoan/cyanobacterial globin family protein  26.5 
 
 		 140 aa  55.5  0.0000003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3674  globin  28.04 
 
 		 121 aa  54.7  0.0000004  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3117  globin  28.18 
 
 		 158 aa  54.7  0.0000004  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.746376  normal  0.148151 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0724  globin  29.76 
 
 		 116 aa  53.9  0.0000007  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4165  globin  27.64 
 
 		 128 aa  53.5  0.0000009  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0373  globin  27.83 
 
 		 159 aa  52.4  0.000002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00000584442  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3911  globin  25.22 
 
 		 143 aa  52  0.000002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1079  globin  27.27 
 
 		 163 aa  52.8  0.000002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1232  globin protein  26.8 
 
 		 147 aa  51.6  0.000004  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.142664  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0576  globin  26.45 
 
 		 121 aa  51.6  0.000004  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2601  hypothetical protein  30.25 
 
 		 124 aa  50.8  0.000006  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2581  globin  21.55 
 
 		 119 aa  50.1  0.00001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.257068  normal  0.85949 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0645  globin  31.94 
 
 		 125 aa  50.1  0.00001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03174  globin family protein  25 
 
 		 143 aa  50.1  0.00001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2507  hypothetical protein  28.69 
 
 		 134 aa  48.9  0.00002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.98006  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2457  hypothetical protein  29.41 
 
 		 124 aa  48.5  0.00003  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1194  globin  24.53 
 
 		 158 aa  48.1  0.00004  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11575  hemoglobin glbN  25.24 
 
 		 136 aa  48.1  0.00004  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2726  globin  27.12 
 
 		 174 aa  47.8  0.00006  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3177  globin  25.45 
 
 		 158 aa  47  0.00009  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4891  globin  23.68 
 
 		 121 aa  47  0.00009  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.299663 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4508  globin  23.68 
 
 		 121 aa  47  0.00009  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.374683  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4595  globin  23.68 
 
 		 121 aa  47  0.00009  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.676061 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3681  globin  25.53 
 
 		 141 aa  46.6  0.0001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.18078  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3176  globin  25.45 
 
 		 158 aa  46.2  0.0001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3320  globin  25.45 
 
 		 158 aa  46.2  0.0002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.808625 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2981  globin  24.47 
 
 		 124 aa  45.4  0.0002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.175312  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0182  globin  27.66 
 
 		 124 aa  45.4  0.0003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.96445  normal  0.330337 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0187  globin  27.66 
 
 		 124 aa  45.4  0.0003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3685  globin  23.42 
 
 		 124 aa  43.9  0.0007  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1242  globin family protein  21.9 
 
 		 145 aa  42.4  0.002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.954597  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5169  globin  22.77 
 
 		 124 aa  42.4  0.002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00113339 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2419  globin  28.83 
 
 		 123 aa  42  0.003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01283  cyanoglobin  21.93 
 
 		 131 aa  42  0.003  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.678014  n/a   
 
 
-
 
NC_013746  Htur_4821  globin  27.18 
 
 		 108 aa  41.6  0.004  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>