52 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shew185_3176 on replicon NC_009665
Organism: Shewanella baltica OS185



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009665  Shew185_3176  globin  100 
 
 		 158 aa  326  7e-89  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3320  globin  99.37 
 
 		 158 aa  323  6e-88  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.808625 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1194  globin  97.47 
 
 		 158 aa  318  1.9999999999999998e-86  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3177  globin  94.94 
 
 		 158 aa  311  2.9999999999999996e-84  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1079  globin  70.13 
 
 		 163 aa  220  4.9999999999999996e-57  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3117  globin  66.26 
 
 		 158 aa  218  1.9999999999999999e-56  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.746376  normal  0.148151 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0373  globin  57.14 
 
 		 159 aa  177  4e-44  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00000584442  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3911  globin  58.33 
 
 		 143 aa  156  1e-37  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3940  hypothetical protein  39.35 
 
 		 142 aa  117  6e-26  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0304408  hitchhiker  0.00309089 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4206  protozoan/cyanobacterial globin family protein  38.71 
 
 		 140 aa  117  7e-26  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1232  globin protein  41.22 
 
 		 147 aa  117  7.999999999999999e-26  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.142664  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1229  globin  46.43 
 
 		 139 aa  111  5e-24  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.435049  normal  0.149006 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01283  cyanoglobin  44.63 
 
 		 131 aa  109  2.0000000000000002e-23  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.678014  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1242  globin family protein  42.74 
 
 		 145 aa  108  4.0000000000000004e-23  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.954597  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1809  globin  33.77 
 
 		 143 aa  97.1  1e-19  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3162  globin  38.71 
 
 		 147 aa  94  7e-19  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.408316  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0254  globin  35 
 
 		 144 aa  94  8e-19  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2350  globin  39.82 
 
 		 144 aa  93.2  1e-18  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3674  globin  33.33 
 
 		 121 aa  78.2  0.00000000000004  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03174  globin family protein  33.33 
 
 		 143 aa  78.2  0.00000000000005  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1425  globin  32.2 
 
 		 146 aa  74.7  0.0000000000005  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1963  globin  30.14 
 
 		 175 aa  72  0.000000000003  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.230814  normal  0.0183414 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4165  globin  30.51 
 
 		 128 aa  69.7  0.00000000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3681  globin  34.21 
 
 		 141 aa  68.9  0.00000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.18078  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2581  globin  30.97 
 
 		 119 aa  68.2  0.00000000005  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.257068  normal  0.85949 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1894  globin  33.93 
 
 		 122 aa  65.1  0.0000000004  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00177457  normal  0.142555 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2015  globin  29.91 
 
 		 121 aa  62  0.000000003  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4595  globin  27.43 
 
 		 121 aa  60.5  0.00000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.676061 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4508  globin  27.43 
 
 		 121 aa  60.5  0.00000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.374683  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4891  globin  27.43 
 
 		 121 aa  60.5  0.00000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.299663 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11575  hemoglobin glbN  26.32 
 
 		 136 aa  59.7  0.00000002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1552  globin  22.03 
 
 		 121 aa  58.2  0.00000004  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0724  globin  31.46 
 
 		 116 aa  57.4  0.00000007  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2507  hypothetical protein  33.33 
 
 		 134 aa  57.4  0.00000008  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.98006  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5169  globin  27.35 
 
 		 124 aa  55.5  0.0000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00113339 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2228  globin  27.19 
 
 		 153 aa  54.3  0.0000006  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.134976  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2981  globin  25.44 
 
 		 124 aa  53.5  0.000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.175312  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0052  globin  26.67 
 
 		 122 aa  52.4  0.000002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0187  globin  31.75 
 
 		 124 aa  51.2  0.000005  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0182  globin  31.75 
 
 		 124 aa  51.2  0.000005  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.96445  normal  0.330337 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3548  globin  22.81 
 
 		 119 aa  50.4  0.000009  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.209186  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1609  globin  30.19 
 
 		 132 aa  48.9  0.00003  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.650446  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2328  globin  24.53 
 
 		 120 aa  47.8  0.00006  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.313085 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1225  globin  27.43 
 
 		 125 aa  47  0.00009  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0341074  normal  1 
 
 
-
 
NC_013746  Htur_4821  globin  26.04 
 
 		 108 aa  47  0.0001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0576  globin  32.67 
 
 		 121 aa  46.2  0.0002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2252  globin  25.45 
 
 		 120 aa  46.2  0.0002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.457276  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3264  globin  25.81 
 
 		 124 aa  45.4  0.0003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3685  globin  28.42 
 
 		 124 aa  44.3  0.0007  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2726  globin  22.69 
 
 		 174 aa  42  0.003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3538  globin  24.39 
 
 		 142 aa  40.8  0.007  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.637564  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1243  globin  26.09 
 
 		 133 aa  40.4  0.009  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>