82 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hlac_1552 on replicon NC_012029
Organism: Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012029  Hlac_1552  globin  100 
 
 		 121 aa  239  1e-62  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3674  globin  45.69 
 
 		 121 aa  101  3e-21  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4165  globin  42.37 
 
 		 128 aa  99  2e-20  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2015  globin  42.74 
 
 		 121 aa  94.7  4e-19  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11575  hemoglobin glbN  44.25 
 
 		 136 aa  92.4  2e-18  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4508  globin  44.25 
 
 		 121 aa  90.9  5e-18  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.374683  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4891  globin  44.25 
 
 		 121 aa  90.9  5e-18  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.299663 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4595  globin  44.25 
 
 		 121 aa  90.9  5e-18  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.676061 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2981  globin  43.86 
 
 		 124 aa  90.1  8e-18  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.175312  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2581  globin  46.09 
 
 		 119 aa  87  7e-17  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.257068  normal  0.85949 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3681  globin  42.11 
 
 		 141 aa  82.4  0.000000000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.18078  normal  1 
 
 
-
 
NC_013746  Htur_4821  globin  39.81 
 
 		 108 aa  81.3  0.000000000000004  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1894  globin  35 
 
 		 122 aa  77  0.00000000000008  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00177457  normal  0.142555 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5169  globin  34.91 
 
 		 124 aa  73.2  0.000000000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00113339 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3264  globin  37.93 
 
 		 124 aa  70.5  0.000000000008  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2507  hypothetical protein  38.14 
 
 		 134 aa  69.7  0.00000000001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.98006  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0724  globin  32.14 
 
 		 116 aa  68.9  0.00000000002  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2328  globin  31.09 
 
 		 120 aa  68.6  0.00000000003  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.313085 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03174  globin family protein  28.81 
 
 		 143 aa  67.8  0.00000000005  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3548  globin  27.19 
 
 		 119 aa  67.4  0.00000000007  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.209186  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2601  hypothetical protein  29.75 
 
 		 124 aa  66.6  0.0000000001  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2457  hypothetical protein  28.93 
 
 		 124 aa  64.7  0.0000000004  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0576  globin  28.81 
 
 		 121 aa  64.7  0.0000000005  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2350  globin  29.66 
 
 		 144 aa  63.5  0.000000001  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3685  globin  30.33 
 
 		 124 aa  62.8  0.000000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3911  globin  27.12 
 
 		 143 aa  63.2  0.000000001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0645  globin  42.65 
 
 		 125 aa  62  0.000000003  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0052  globin  26.05 
 
 		 122 aa  61.2  0.000000004  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0578  globin  31.97 
 
 		 127 aa  60.1  0.000000009  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2228  globin  26.5 
 
 		 153 aa  59.7  0.00000001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.134976  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3177  globin  22.88 
 
 		 158 aa  58.9  0.00000002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2252  globin  26.67 
 
 		 120 aa  58.9  0.00000002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.457276  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0254  globin  37.65 
 
 		 144 aa  58.5  0.00000003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3176  globin  22.03 
 
 		 158 aa  58.2  0.00000004  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3320  globin  22.03 
 
 		 158 aa  57.8  0.00000005  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.808625 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0180  globin  34.21 
 
 		 133 aa  57.4  0.00000007  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1809  globin  25.23 
 
 		 143 aa  57  0.00000009  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3117  globin  25.86 
 
 		 158 aa  56.6  0.0000001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.746376  normal  0.148151 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1194  globin  22.22 
 
 		 158 aa  56.2  0.0000001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0187  globin  27.43 
 
 		 124 aa  56.6  0.0000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0182  globin  27.43 
 
 		 124 aa  56.6  0.0000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.96445  normal  0.330337 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3162  globin  23.89 
 
 		 147 aa  56.2  0.0000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.408316  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1963  globin  26.55 
 
 		 175 aa  53.9  0.0000008  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.230814  normal  0.0183414 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1079  globin  22.41 
 
 		 163 aa  53.1  0.000001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2086  globin  30.56 
 
 		 133 aa  52.8  0.000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2414  globin  33.33 
 
 		 146 aa  52  0.000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.76431  normal  0.163683 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2478  globin  31.13 
 
 		 153 aa  51.6  0.000004  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000576201  hitchhiker  0.00350075 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01283  cyanoglobin  25.64 
 
 		 131 aa  51.2  0.000005  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.678014  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1232  globin protein  22.61 
 
 		 147 aa  51.2  0.000005  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.142664  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1754  globin like protein  29.63 
 
 		 133 aa  51.2  0.000005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2370  globin  30.43 
 
 		 130 aa  50.8  0.000006  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.16985  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1243  globin  38.96 
 
 		 133 aa  50.4  0.000007  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2180  globin  28.7 
 
 		 133 aa  49.7  0.00001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011682  PHATRDRAFT_37957  predicted protein  31.25 
 
 		 194 aa  48.9  0.00002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.961244  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0248  globin  32.04 
 
 		 257 aa  48.5  0.00003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.552337  normal  0.72518 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1425  globin  24.56 
 
 		 146 aa  48.9  0.00003  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0783  globin  33.04 
 
 		 133 aa  48.9  0.00003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.259249 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1450  Antibiotic biosynthesis monooxygenase  32.67 
 
 		 252 aa  48.1  0.00004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0936  globin  26.61 
 
 		 135 aa  47.4  0.00007  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2903  globin  31.53 
 
 		 161 aa  46.6  0.0001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0373  globin  20.35 
 
 		 159 aa  46.2  0.0002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00000584442  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2419  globin  31.33 
 
 		 123 aa  45.4  0.0003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1229  globin  23.01 
 
 		 139 aa  45.1  0.0003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.435049  normal  0.149006 
 
 
-
 
NC_011689  PHATRDRAFT_39797  predicted protein  25.64 
 
 		 164 aa  45.1  0.0003  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2168  globin  28.42 
 
 		 149 aa  44.7  0.0004  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000874397 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1242  globin family protein  22.88 
 
 		 145 aa  44.7  0.0005  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.954597  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1626  globin  34.07 
 
 		 137 aa  44.3  0.0006  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1376  globin  33.33 
 
 		 124 aa  43.9  0.0007  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.510666  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3533  globin  26.36 
 
 		 149 aa  43.5  0.001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.841697 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1359  globin  27.27 
 
 		 127 aa  42.7  0.001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.267788  decreased coverage  0.00000213655 
 
 
-
 
NC_011675  PHATRDRAFT_19954  predicted protein  30.23 
 
 		 176 aa  43.5  0.001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.127434  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2414  globin  27.37 
 
 		 137 aa  43.1  0.001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0149997  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3610  globin  32.79 
 
 		 131 aa  42.4  0.002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.459104  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3615  globin  32.79 
 
 		 131 aa  42.4  0.002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.404542 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0771  globin  34.18 
 
 		 137 aa  42.4  0.002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4066  globin  33.33 
 
 		 136 aa  42.7  0.002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.667271 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3683  globin  32.79 
 
 		 131 aa  42.4  0.002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.88101  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2726  globin  23.08 
 
 		 174 aa  41.6  0.004  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4206  protozoan/cyanobacterial globin family protein  25.49 
 
 		 140 aa  41.2  0.005  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3940  hypothetical protein  22.41 
 
 		 142 aa  40.8  0.006  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0304408  hitchhiker  0.00309089 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_24650  truncated hemoglobin  24.77 
 
 		 133 aa  40.8  0.007  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0487801  normal  0.249418 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2550  globin  26.36 
 
 		 129 aa  40.4  0.009  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.881272 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>