27 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hoch_0180 on replicon NC_013440
Organism: Haliangium ochraceum DSM 14365



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013440  Hoch_0180  globin  100 
 
 
133 aa  269  8.000000000000001e-72  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11575  hemoglobin glbN  36.21 
 
 
136 aa  64.7  0.0000000004  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2981  globin  35.54 
 
 
124 aa  64.3  0.0000000005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.175312  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4508  globin  41.24 
 
 
121 aa  63.5  0.0000000008  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.374683  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4595  globin  41.24 
 
 
121 aa  63.5  0.0000000008  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.676061 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4891  globin  41.24 
 
 
121 aa  63.5  0.0000000008  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.299663 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2015  globin  33.05 
 
 
121 aa  62.4  0.000000002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2581  globin  36.21 
 
 
119 aa  60.8  0.000000007  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.257068  normal  0.85949 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4165  globin  33.91 
 
 
128 aa  59.3  0.00000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1552  globin  34.21 
 
 
121 aa  57.4  0.00000007  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3674  globin  35.92 
 
 
121 aa  54.3  0.0000005  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0645  globin  33.71 
 
 
125 aa  53.5  0.0000008  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3264  globin  34.31 
 
 
124 aa  51.2  0.000004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3681  globin  29.31 
 
 
141 aa  47  0.00009  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.18078  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1573  globin  30.77 
 
 
144 aa  46.2  0.0001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal  0.732575 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2507  hypothetical protein  31.15 
 
 
134 aa  45.8  0.0002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.98006  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0182  globin  31.37 
 
 
124 aa  46.2  0.0002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.96445  normal  0.330337 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0187  globin  31.37 
 
 
124 aa  46.2  0.0002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2690  globin  33.73 
 
 
155 aa  45.4  0.0002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3685  globin  34.94 
 
 
124 aa  45.1  0.0004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013746  Htur_4821  globin  26.17 
 
 
108 aa  43.5  0.0008  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0576  globin  33.64 
 
 
121 aa  43.5  0.001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5169  globin  26.92 
 
 
124 aa  42.7  0.002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00113339 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3212  globin  33.71 
 
 
153 aa  41.6  0.003  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00535354 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1894  globin  38.57 
 
 
122 aa  41.6  0.004  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00177457  normal  0.142555 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1359  globin  26.97 
 
 
133 aa  40.8  0.006  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3575  hemoglobin-like protein  34.67 
 
 
125 aa  40.4  0.008  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>