89 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Plav_2690 on replicon NC_009719
Organism: Parvibaculum lavamentivorans DS-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009719  Plav_2690  globin  100 
 
 		 155 aa  320  4e-87  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_5029  globin  55.12 
 
 		 165 aa  138  1.9999999999999998e-32  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5297  sec-independent protein translocase protein TatC  59.32 
 
 		 127 aa  137  4.999999999999999e-32  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.30344  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3212  globin  55.75 
 
 		 153 aa  135  1e-31  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00535354 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0742  hypothetical protein  53.91 
 
 		 140 aa  132  1.9999999999999998e-30  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.74406  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3493  hypothetical protein  53.85 
 
 		 140 aa  130  5e-30  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1574  SEC-independent protein translocase protein TatC  54.7 
 
 		 127 aa  129  1.0000000000000001e-29  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.583199  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3175  hypothetical protein  53.04 
 
 		 142 aa  126  1.0000000000000001e-28  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2518  hypothetical protein  53.15 
 
 		 128 aa  124  4.0000000000000003e-28  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.93992  normal  0.501492 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2064  hypothetical protein  49.57 
 
 		 132 aa  122  2e-27  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2305  hypothetical protein  53.57 
 
 		 151 aa  121  3e-27  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2995  globin  50 
 
 		 133 aa  118  3e-26  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0463225  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0754  hypothetical protein  50.88 
 
 		 147 aa  118  3e-26  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.413397 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6298  hypothetical protein  50 
 
 		 144 aa  118  3e-26  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.689785 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4555  hypothetical protein  49.53 
 
 		 130 aa  116  9.999999999999999e-26  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.298668 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4184  hypothetical protein  49.53 
 
 		 130 aa  116  9.999999999999999e-26  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3419  hypothetical protein  45.3 
 
 		 132 aa  115  1.9999999999999998e-25  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.24808 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4698  hypothetical protein  45.9 
 
 		 130 aa  115  1.9999999999999998e-25  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.100774 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1424  globin  50 
 
 		 184 aa  115  3e-25  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0566863  hitchhiker  0.0088103 
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4280  SEC-independent protein translocase protein TatC  47.41 
 
 		 154 aa  115  3e-25  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5779  globin  48.18 
 
 		 132 aa  114  6.9999999999999995e-25  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00168244  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4263  hypothetical protein  42.86 
 
 		 155 aa  113  1.0000000000000001e-24  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6003  hypothetical protein  45.38 
 
 		 138 aa  112  2.0000000000000002e-24  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0188186  normal  0.0655749 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1849  globin  49.11 
 
 		 186 aa  110  6e-24  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6230  globin  49.11 
 
 		 186 aa  110  6e-24  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1873  globin  49.11 
 
 		 186 aa  110  7.000000000000001e-24  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.380705  hitchhiker  0.0000412493 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0855  hypothetical protein  50 
 
 		 224 aa  110  1.0000000000000001e-23  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.102097 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5150  globin-like protein  48.21 
 
 		 186 aa  109  1.0000000000000001e-23  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.893313  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4528  hypothetical protein  42.06 
 
 		 155 aa  109  2.0000000000000002e-23  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.127844 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1842  hypothetical protein  49.11 
 
 		 139 aa  108  2.0000000000000002e-23  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1478  SEC-independent protein translocase protein TatC  47.37 
 
 		 139 aa  108  3e-23  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2376  hypothetical protein  46.43 
 
 		 181 aa  108  4.0000000000000004e-23  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.733503 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0841  hypothetical protein  48.15 
 
 		 136 aa  107  5e-23  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.658451  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1759  globin  47.32 
 
 		 186 aa  107  5e-23  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.170545 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0898  hypothetical protein  48.15 
 
 		 136 aa  107  5e-23  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.135732  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1787  globin  47.32 
 
 		 186 aa  107  7.000000000000001e-23  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4232  hypothetical protein  49.14 
 
 		 182 aa  105  2e-22  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5909  globin  43.75 
 
 		 165 aa  106  2e-22  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.94864  normal  0.233628 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3041  truncated hemoglobin-like protein  45.52 
 
 		 150 aa  104  4e-22  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.151785 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0027  hypothetical protein  46.85 
 
 		 180 aa  102  1e-21  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0995303  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2391  hypothetical protein  46.85 
 
 		 180 aa  102  1e-21  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1141  hypothetical protein  46.85 
 
 		 180 aa  102  1e-21  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0822886  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2264  hypothetical protein  46.85 
 
 		 180 aa  103  1e-21  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2226  hypothetical protein  46.85 
 
 		 180 aa  102  1e-21  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.442578  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1869  hypothetical protein  46.85 
 
 		 180 aa  102  1e-21  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2203  hypothetical protein  45.95 
 
 		 183 aa  102  3e-21  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.00750024  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1811  globin  43.75 
 
 		 230 aa  101  3e-21  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.424757  normal  0.0811306 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2513  globin family protein  42.22 
 
 		 165 aa  101  3e-21  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0936  globin  43.75 
 
 		 185 aa  100  1e-20  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.879764 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0535  hypothetical protein  43.33 
 
 		 161 aa  97.4  7e-20  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.145284  normal  0.658808 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1025  hypothetical protein  44.17 
 
 		 138 aa  97.1  9e-20  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.645968 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1570  globin-like protein  37.6 
 
 		 143 aa  95.9  2e-19  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0955193  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1715  hypothetical protein  37.31 
 
 		 163 aa  94  7e-19  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.0910498 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1565  hypothetical protein  39.85 
 
 		 140 aa  92  3e-18  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.809798  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2331  hypothetical protein  42.86 
 
 		 145 aa  91.7  3e-18  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.0477128 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0993  hypothetical protein  40.35 
 
 		 124 aa  91.7  3e-18  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1428  putative sec-independent protein translocase protein TatC  43.93 
 
 		 146 aa  91.3  5e-18  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1693  hypothetical protein  38.53 
 
 		 125 aa  90.1  1e-17  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1475  hypothetical protein  35.9 
 
 		 127 aa  88.6  3e-17  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.0660231  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0490  hypothetical protein  35.9 
 
 		 127 aa  87.8  5e-17  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.0856682  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0515  hypothetical protein  35.9 
 
 		 127 aa  86.7  1e-16  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.382779  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0149  hypothetical protein  37.19 
 
 		 127 aa  86.3  1e-16  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1838  globin  39.09 
 
 		 129 aa  86.3  2e-16  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.342813  hitchhiker  0.000000178358 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1359  globin  40.38 
 
 		 133 aa  84.7  5e-16  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1904  hypothetical protein  36.79 
 
 		 159 aa  84  7e-16  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4054  hypothetical protein  35.14 
 
 		 123 aa  83.6  8e-16  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0499  sec-independent protein translocase protein TatC  43.53 
 
 		 141 aa  83.2  0.000000000000001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3273  sec-independent protein translocase protein TatC  37.82 
 
 		 130 aa  83.2  0.000000000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.401481  normal  0.0409465 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0222  truncated hemoglobin  33.06 
 
 		 124 aa  82.8  0.000000000000002  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000508679  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3614  hypothetical protein  36.36 
 
 		 140 aa  80.1  0.000000000000009  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.17721  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1030  hypothetical protein  41.28 
 
 		 132 aa  78.6  0.00000000000003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.303916 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_4025  globin family protein  39.67 
 
 		 128 aa  76.3  0.0000000000001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3004  hypothetical protein  38.53 
 
 		 147 aa  74.3  0.0000000000005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.930099  normal  0.0388859 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1581  globin  30.08 
 
 		 132 aa  72.8  0.000000000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.100305  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2388  hypothetical protein  36.7 
 
 		 137 aa  72.4  0.000000000002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0779  globin  35.71 
 
 		 135 aa  70.9  0.000000000006  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.388138  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2147  globin  37.5 
 
 		 144 aa  69.3  0.00000000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.20017 
 
 
-
 
NC_007959  Nham_4300  hypothetical protein  39.84 
 
 		 131 aa  68.6  0.00000000003  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.130175  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0655  globin  31.78 
 
 		 274 aa  68.6  0.00000000003  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0495224  normal  0.954759 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2080  hypothetical protein  37.04 
 
 		 148 aa  68.2  0.00000000004  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5670  hypothetical protein  31.62 
 
 		 162 aa  67.4  0.00000000007  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.534962  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5291  hypothetical protein  30.77 
 
 		 162 aa  65.1  0.0000000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5380  hypothetical protein  30.77 
 
 		 162 aa  65.1  0.0000000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2979  globin  33.93 
 
 		 129 aa  51.6  0.000004  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4128  hypothetical protein  44.07 
 
 		 86 aa  51.6  0.000004  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2635  globin  30.51 
 
 		 151 aa  45.4  0.0003  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0270867  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0180  globin  33.73 
 
 		 133 aa  45.1  0.0004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0783  globin  29.7 
 
 		 133 aa  42.7  0.002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.259249 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2507  hypothetical protein  31.19 
 
 		 134 aa  40.4  0.01  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.98006  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>