89 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cla_0149 on replicon NC_012039
Organism: Campylobacter lari RM2100



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012039  Cla_0149  hypothetical protein  100 
 
 
127 aa  261  2e-69  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0490  hypothetical protein  60.48 
 
 
127 aa  169  1e-41  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.0856682  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0515  hypothetical protein  59.68 
 
 
127 aa  168  2e-41  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.382779  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1475  hypothetical protein  59.68 
 
 
127 aa  168  2e-41  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.0660231  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0993  hypothetical protein  52.03 
 
 
124 aa  144  5e-34  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0222  truncated hemoglobin  50 
 
 
124 aa  133  7.000000000000001e-31  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000508679  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3493  hypothetical protein  38.02 
 
 
140 aa  97.1  7e-20  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0742  hypothetical protein  35.54 
 
 
140 aa  95.9  2e-19  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.74406  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2690  globin  37.19 
 
 
155 aa  86.7  1e-16  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0841  hypothetical protein  36.75 
 
 
136 aa  85.1  3e-16  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.658451  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0898  hypothetical protein  36.75 
 
 
136 aa  85.1  3e-16  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.135732  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6298  hypothetical protein  36.67 
 
 
144 aa  84.7  4e-16  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.689785 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3175  hypothetical protein  34.45 
 
 
142 aa  82.4  0.000000000000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1693  hypothetical protein  35.96 
 
 
125 aa  82  0.000000000000003  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1478  SEC-independent protein translocase protein TatC  37.61 
 
 
139 aa  81.6  0.000000000000003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2305  hypothetical protein  35.77 
 
 
151 aa  80.5  0.000000000000007  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5779  globin  38.05 
 
 
132 aa  80.1  0.000000000000009  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00168244  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3212  globin  34.17 
 
 
153 aa  79.3  0.00000000000002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00535354 
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_5029  globin  37.07 
 
 
165 aa  78.2  0.00000000000004  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4698  hypothetical protein  34.43 
 
 
130 aa  77.8  0.00000000000004  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.100774 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2995  globin  37.29 
 
 
133 aa  77.4  0.00000000000006  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0463225  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2331  hypothetical protein  37.72 
 
 
145 aa  75.9  0.0000000000002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.0477128 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3419  hypothetical protein  30.33 
 
 
132 aa  75.1  0.0000000000003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.24808 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6003  hypothetical protein  28.81 
 
 
138 aa  74.7  0.0000000000004  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0188186  normal  0.0655749 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2064  hypothetical protein  30.33 
 
 
132 aa  73.9  0.0000000000006  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5909  globin  32.52 
 
 
165 aa  73.9  0.0000000000007  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.94864  normal  0.233628 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0535  hypothetical protein  34.4 
 
 
161 aa  72.8  0.000000000002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.145284  normal  0.658808 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2518  hypothetical protein  37.84 
 
 
128 aa  72.8  0.000000000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.93992  normal  0.501492 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4184  hypothetical protein  35.58 
 
 
130 aa  71.2  0.000000000005  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4263  hypothetical protein  31.86 
 
 
155 aa  70.5  0.000000000008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5297  sec-independent protein translocase protein TatC  35.43 
 
 
127 aa  70.1  0.000000000009  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.30344  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1581  globin  33.59 
 
 
132 aa  70.1  0.000000000009  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.100305  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1574  SEC-independent protein translocase protein TatC  34.15 
 
 
127 aa  69.7  0.00000000001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.583199  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0855  hypothetical protein  31.58 
 
 
224 aa  69.7  0.00000000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.102097 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1904  hypothetical protein  35.85 
 
 
159 aa  69.7  0.00000000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4555  hypothetical protein  34.62 
 
 
130 aa  69.3  0.00000000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.298668 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2388  hypothetical protein  37.78 
 
 
137 aa  68.6  0.00000000003  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2203  hypothetical protein  35.14 
 
 
183 aa  67.8  0.00000000006  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.00750024  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1359  globin  33.94 
 
 
133 aa  67.4  0.00000000006  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0754  hypothetical protein  34.71 
 
 
147 aa  67.4  0.00000000006  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.413397 
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4280  SEC-independent protein translocase protein TatC  30.51 
 
 
154 aa  66.6  0.00000000009  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2264  hypothetical protein  34.23 
 
 
180 aa  66.2  0.0000000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2226  hypothetical protein  34.23 
 
 
180 aa  66.6  0.0000000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.442578  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1141  hypothetical protein  34.23 
 
 
180 aa  66.6  0.0000000001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0822886  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0027  hypothetical protein  34.23 
 
 
180 aa  66.6  0.0000000001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0995303  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1869  hypothetical protein  34.23 
 
 
180 aa  66.6  0.0000000001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2391  hypothetical protein  34.23 
 
 
180 aa  66.6  0.0000000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3041  truncated hemoglobin-like protein  33.64 
 
 
150 aa  66.2  0.0000000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.151785 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3273  sec-independent protein translocase protein TatC  31.03 
 
 
130 aa  65.9  0.0000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.401481  normal  0.0409465 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2376  hypothetical protein  33.03 
 
 
181 aa  65.1  0.0000000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.733503 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1838  globin  34.19 
 
 
129 aa  64.7  0.0000000004  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.342813  hitchhiker  0.000000178358 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1759  globin  32.74 
 
 
186 aa  64.3  0.0000000006  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.170545 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1565  hypothetical protein  34.15 
 
 
140 aa  63.9  0.0000000007  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.809798  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4528  hypothetical protein  29.9 
 
 
155 aa  62.8  0.000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.127844 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1842  hypothetical protein  28.8 
 
 
139 aa  63.2  0.000000001  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3614  hypothetical protein  30 
 
 
140 aa  63.2  0.000000001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.17721  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1025  hypothetical protein  31.36 
 
 
138 aa  63.2  0.000000001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.645968 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5150  globin-like protein  31.86 
 
 
186 aa  63.2  0.000000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.893313  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0779  globin  31.82 
 
 
135 aa  62.8  0.000000002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.388138  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1424  globin  31.86 
 
 
184 aa  62.4  0.000000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0566863  hitchhiker  0.0088103 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1787  globin  31.86 
 
 
186 aa  62.4  0.000000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6230  globin  30.97 
 
 
186 aa  61.6  0.000000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1873  globin  30.97 
 
 
186 aa  61.6  0.000000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.380705  hitchhiker  0.0000412493 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1849  globin  30.97 
 
 
186 aa  61.6  0.000000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2513  globin family protein  30.7 
 
 
165 aa  61.6  0.000000004  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0936  globin  29.66 
 
 
185 aa  60.8  0.000000006  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.879764 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1811  globin  31.19 
 
 
230 aa  60.5  0.000000008  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.424757  normal  0.0811306 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4232  hypothetical protein  31.09 
 
 
182 aa  60.1  0.000000009  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1715  hypothetical protein  29.06 
 
 
163 aa  58.5  0.00000003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.0910498 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4054  hypothetical protein  30.51 
 
 
123 aa  57.4  0.00000007  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1570  globin-like protein  28.57 
 
 
143 aa  57  0.00000009  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0955193  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0655  globin  25.86 
 
 
274 aa  56.2  0.0000001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0495224  normal  0.954759 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1428  putative sec-independent protein translocase protein TatC  27.27 
 
 
146 aa  55.8  0.0000002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_4025  globin family protein  28.21 
 
 
128 aa  56.2  0.0000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2147  globin  29.91 
 
 
144 aa  54.3  0.0000005  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.20017 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0499  sec-independent protein translocase protein TatC  34.09 
 
 
141 aa  54.3  0.0000006  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0911  globin  29.66 
 
 
132 aa  45.1  0.0003  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3004  hypothetical protein  28.83 
 
 
147 aa  45.1  0.0004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.930099  normal  0.0388859 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4091  globin family protein  28.81 
 
 
132 aa  42  0.003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2635  globin  30.17 
 
 
151 aa  42  0.003  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0270867  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1355  globin family protein  28.81 
 
 
132 aa  41.2  0.004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1105  globin  27.5 
 
 
132 aa  41.6  0.004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1116  hypothetical protein  27.97 
 
 
132 aa  40.8  0.006  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1209  hypothetical protein  27.97 
 
 
132 aa  40.8  0.006  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1250  globin family protein  27.5 
 
 
132 aa  40.8  0.007  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1279  globin family protein  27.97 
 
 
132 aa  40.8  0.007  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1098  globin family protein  27.97 
 
 
132 aa  40.8  0.007  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1092  globin family protein  27.97 
 
 
132 aa  40.8  0.007  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.720422  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1317  hypothetical protein  27.97 
 
 
132 aa  40.8  0.007  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.997153  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>