85 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TM1040_2388 on replicon NC_008044
Organism: Ruegeria sp. TM1040



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008044  TM1040_2388  hypothetical protein  100 
 
 		 137 aa  278  1e-74  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3614  hypothetical protein  53.91 
 
 		 140 aa  142  2e-33  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.17721  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6298  hypothetical protein  37.01 
 
 		 144 aa  79.7  0.00000000000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.689785 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0535  hypothetical protein  38.89 
 
 		 161 aa  78.2  0.00000000000003  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.145284  normal  0.658808 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2995  globin  35.25 
 
 		 133 aa  78.2  0.00000000000004  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0463225  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0222  truncated hemoglobin  32.17 
 
 		 124 aa  77.8  0.00000000000004  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000508679  n/a   
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4280  SEC-independent protein translocase protein TatC  37.61 
 
 		 154 aa  77.8  0.00000000000005  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2331  hypothetical protein  36.21 
 
 		 145 aa  77  0.00000000000008  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.0477128 
 
 
-
 
NC_003912  CJE0515  hypothetical protein  39.33 
 
 		 127 aa  75.9  0.0000000000002  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.382779  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0841  hypothetical protein  36.13 
 
 		 136 aa  75.9  0.0000000000002  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.658451  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0898  hypothetical protein  36.13 
 
 		 136 aa  75.9  0.0000000000002  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.135732  n/a   
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6003  hypothetical protein  34.55 
 
 		 138 aa  75.9  0.0000000000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0188186  normal  0.0655749 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0742  hypothetical protein  33.63 
 
 		 140 aa  74.7  0.0000000000004  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.74406  normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5909  globin  33.33 
 
 		 165 aa  74.3  0.0000000000005  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.94864  normal  0.233628 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2513  globin family protein  36.45 
 
 		 165 aa  73.2  0.000000000001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2690  globin  36.7 
 
 		 155 aa  72.8  0.000000000001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4528  hypothetical protein  35.45 
 
 		 155 aa  72.4  0.000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.127844 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3493  hypothetical protein  33.63 
 
 		 140 aa  72  0.000000000002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2064  hypothetical protein  34.55 
 
 		 132 aa  72  0.000000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1478  SEC-independent protein translocase protein TatC  35.45 
 
 		 139 aa  72.4  0.000000000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1574  SEC-independent protein translocase protein TatC  32.5 
 
 		 127 aa  71.6  0.000000000003  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.583199  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0490  hypothetical protein  37.08 
 
 		 127 aa  71.6  0.000000000004  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.0856682  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2518  hypothetical protein  31.71 
 
 		 128 aa  71.2  0.000000000004  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.93992  normal  0.501492 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5779  globin  37.61 
 
 		 132 aa  70.9  0.000000000005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00168244  normal  1 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1475  hypothetical protein  37.08 
 
 		 127 aa  70.9  0.000000000006  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.0660231  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1715  hypothetical protein  37.5 
 
 		 163 aa  70.1  0.000000000009  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.0910498 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_4025  globin family protein  34.82 
 
 		 128 aa  70.1  0.000000000009  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3041  truncated hemoglobin-like protein  33.94 
 
 		 150 aa  70.1  0.00000000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.151785 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1842  hypothetical protein  35.51 
 
 		 139 aa  68.9  0.00000000002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0499  sec-independent protein translocase protein TatC  33.02 
 
 		 141 aa  69.3  0.00000000002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0149  hypothetical protein  37.78 
 
 		 127 aa  68.6  0.00000000003  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4698  hypothetical protein  33.33 
 
 		 130 aa  67.8  0.00000000004  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.100774 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3419  hypothetical protein  32.73 
 
 		 132 aa  67.8  0.00000000005  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.24808 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1025  hypothetical protein  32.79 
 
 		 138 aa  67.4  0.00000000005  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.645968 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4263  hypothetical protein  33.03 
 
 		 155 aa  67  0.00000000009  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4555  hypothetical protein  35.64 
 
 		 130 aa  66.6  0.0000000001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.298668 
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_5029  globin  33.04 
 
 		 165 aa  66.6  0.0000000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1359  globin  32.5 
 
 		 133 aa  65.1  0.0000000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1787  globin  33.03 
 
 		 186 aa  65.1  0.0000000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4184  hypothetical protein  34.65 
 
 		 130 aa  64.7  0.0000000004  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1428  putative sec-independent protein translocase protein TatC  30.3 
 
 		 146 aa  64.3  0.0000000005  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1759  globin  32.11 
 
 		 186 aa  63.9  0.0000000007  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.170545 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4232  hypothetical protein  32.14 
 
 		 182 aa  63.9  0.0000000008  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1904  hypothetical protein  27.27 
 
 		 159 aa  62.8  0.000000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1565  hypothetical protein  31.45 
 
 		 140 aa  63.2  0.000000001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.809798  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2147  globin  34.62 
 
 		 144 aa  62.4  0.000000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.20017 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1838  globin  29.37 
 
 		 129 aa  62.8  0.000000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.342813  hitchhiker  0.000000178358 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3212  globin  31.78 
 
 		 153 aa  62.4  0.000000002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00535354 
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5297  sec-independent protein translocase protein TatC  27.73 
 
 		 127 aa  62.4  0.000000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.30344  normal  1 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0993  hypothetical protein  30.3 
 
 		 124 aa  62.8  0.000000002  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6230  globin  32.11 
 
 		 186 aa  61.6  0.000000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1849  globin  32.11 
 
 		 186 aa  61.6  0.000000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5150  globin-like protein  31.19 
 
 		 186 aa  61.6  0.000000004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.893313  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1873  globin  32.11 
 
 		 186 aa  61.6  0.000000004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.380705  hitchhiker  0.0000412493 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3175  hypothetical protein  27.97 
 
 		 142 aa  59.7  0.00000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1424  globin  28.1 
 
 		 184 aa  59.3  0.00000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0566863  hitchhiker  0.0088103 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2305  hypothetical protein  30.28 
 
 		 151 aa  58.5  0.00000003  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1570  globin-like protein  34.44 
 
 		 143 aa  57.8  0.00000005  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0955193  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0855  hypothetical protein  33.66 
 
 		 224 aa  57  0.00000008  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.102097 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0754  hypothetical protein  32.46 
 
 		 147 aa  57  0.00000009  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.413397 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0721  hypothetical protein  30.16 
 
 		 132 aa  56.2  0.0000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0869  globin  30.16 
 
 		 132 aa  56.2  0.0000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.523216  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2376  hypothetical protein  30.19 
 
 		 181 aa  54.7  0.0000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.733503 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1869  hypothetical protein  29.36 
 
 		 180 aa  54.7  0.0000004  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0027  hypothetical protein  29.36 
 
 		 180 aa  54.7  0.0000004  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0995303  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2226  hypothetical protein  29.36 
 
 		 180 aa  54.7  0.0000004  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.442578  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2264  hypothetical protein  29.36 
 
 		 180 aa  54.7  0.0000004  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1141  hypothetical protein  29.36 
 
 		 180 aa  54.7  0.0000004  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0822886  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2391  hypothetical protein  29.36 
 
 		 180 aa  54.7  0.0000004  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2203  hypothetical protein  29.36 
 
 		 183 aa  54.3  0.0000006  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.00750024  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0936  globin  30.28 
 
 		 185 aa  53.9  0.0000008  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.879764 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1693  hypothetical protein  30.34 
 
 		 125 aa  53.1  0.000001  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3004  hypothetical protein  28.69 
 
 		 147 aa  52  0.000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.930099  normal  0.0388859 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2635  globin  32.54 
 
 		 151 aa  52.8  0.000002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0270867  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1811  globin  30.19 
 
 		 230 aa  52.4  0.000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.424757  normal  0.0811306 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2979  globin  30.95 
 
 		 129 aa  50.4  0.000008  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3273  sec-independent protein translocase protein TatC  28.09 
 
 		 130 aa  50.1  0.000009  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.401481  normal  0.0409465 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1030  hypothetical protein  29.82 
 
 		 132 aa  50.1  0.00001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.303916 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0655  globin  30.34 
 
 		 274 aa  48.9  0.00002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0495224  normal  0.954759 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0779  globin  28.18 
 
 		 135 aa  47  0.0001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.388138  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4128  hypothetical protein  30.26 
 
 		 86 aa  45.8  0.0002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2080  hypothetical protein  28.23 
 
 		 148 aa  43.9  0.0008  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1581  globin  25.26 
 
 		 132 aa  42  0.003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.100305  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4054  hypothetical protein  25.77 
 
 		 123 aa  41.2  0.005  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2371  globin  28.79 
 
 		 126 aa  40  0.009  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.868938 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>