53 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tgr7_2979 on replicon NC_011901
Organism: Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011901  Tgr7_2979  globin  100 
 
 		 129 aa  266  5.9999999999999995e-71  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2371  globin  57.38 
 
 		 126 aa  155  1e-37  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.868938 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0869  globin  35.29 
 
 		 132 aa  82  0.000000000000003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.523216  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0721  hypothetical protein  35.29 
 
 		 132 aa  82  0.000000000000003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2635  globin  31.03 
 
 		 151 aa  68.9  0.00000000002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0270867  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2147  globin  28.68 
 
 		 144 aa  65.9  0.0000000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.20017 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6298  hypothetical protein  36.89 
 
 		 144 aa  62.4  0.000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.689785 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1842  hypothetical protein  33.06 
 
 		 139 aa  60.1  0.000000009  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1428  putative sec-independent protein translocase protein TatC  32.17 
 
 		 146 aa  58.9  0.00000002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2518  hypothetical protein  33.63 
 
 		 128 aa  58.9  0.00000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.93992  normal  0.501492 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2305  hypothetical protein  35.65 
 
 		 151 aa  58.5  0.00000003  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2995  globin  31.3 
 
 		 133 aa  58.2  0.00000004  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0463225  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0655  globin  31.2 
 
 		 274 aa  57.8  0.00000005  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0495224  normal  0.954759 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0898  hypothetical protein  31.67 
 
 		 136 aa  54.7  0.0000004  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.135732  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0841  hypothetical protein  31.67 
 
 		 136 aa  54.7  0.0000004  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.658451  n/a   
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_5029  globin  33.33 
 
 		 165 aa  53.9  0.0000007  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3175  hypothetical protein  34.69 
 
 		 142 aa  53.1  0.000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2690  globin  33.93 
 
 		 155 aa  52.4  0.000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1025  hypothetical protein  33.33 
 
 		 138 aa  52  0.000003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.645968 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1581  globin  29.25 
 
 		 132 aa  52  0.000003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.100305  n/a   
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5297  sec-independent protein translocase protein TatC  31.97 
 
 		 127 aa  51.2  0.000004  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.30344  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1478  SEC-independent protein translocase protein TatC  31.86 
 
 		 139 aa  50.8  0.000006  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2388  hypothetical protein  30.95 
 
 		 137 aa  50.4  0.000008  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1838  globin  31.63 
 
 		 129 aa  49.7  0.00001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.342813  hitchhiker  0.000000178358 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4232  hypothetical protein  33.01 
 
 		 182 aa  48.9  0.00002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3212  globin  32.43 
 
 		 153 aa  48.1  0.00004  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00535354 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0499  sec-independent protein translocase protein TatC  31.03 
 
 		 141 aa  46.6  0.0001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4698  hypothetical protein  32.73 
 
 		 130 aa  45.4  0.0002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.100774 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0855  hypothetical protein  35.56 
 
 		 224 aa  45.8  0.0002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.102097 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1574  SEC-independent protein translocase protein TatC  33.62 
 
 		 127 aa  45.4  0.0002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.583199  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3614  hypothetical protein  30.71 
 
 		 140 aa  46.2  0.0002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.17721  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0779  globin  30.83 
 
 		 135 aa  44.7  0.0004  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.388138  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0535  hypothetical protein  35.23 
 
 		 161 aa  45.1  0.0004  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.145284  normal  0.658808 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1141  hypothetical protein  29.36 
 
 		 180 aa  44.3  0.0006  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0822886  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2391  hypothetical protein  29.36 
 
 		 180 aa  44.3  0.0006  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1869  hypothetical protein  29.36 
 
 		 180 aa  44.3  0.0006  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0027  hypothetical protein  29.36 
 
 		 180 aa  44.3  0.0006  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0995303  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2226  hypothetical protein  29.36 
 
 		 180 aa  44.3  0.0006  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.442578  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2264  hypothetical protein  29.36 
 
 		 180 aa  44.3  0.0006  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5779  globin  27.5 
 
 		 132 aa  43.9  0.0007  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00168244  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2203  hypothetical protein  29.36 
 
 		 183 aa  43.9  0.0008  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.00750024  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2513  globin family protein  30.08 
 
 		 165 aa  43.5  0.001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1030  hypothetical protein  31.25 
 
 		 132 aa  43.1  0.001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.303916 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0742  hypothetical protein  27.2 
 
 		 140 aa  43.5  0.001  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.74406  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2376  hypothetical protein  29.17 
 
 		 181 aa  42.4  0.002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.733503 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1715  hypothetical protein  26.36 
 
 		 163 aa  42  0.003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.0910498 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1570  globin-like protein  30.33 
 
 		 143 aa  41.2  0.005  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0955193  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3493  hypothetical protein  26.4 
 
 		 140 aa  41.2  0.005  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0993  hypothetical protein  33.33 
 
 		 124 aa  40.8  0.006  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1989  globin  26 
 
 		 136 aa  40.8  0.006  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5150  globin-like protein  28.81 
 
 		 186 aa  40.8  0.007  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.893313  normal  1 
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4280  SEC-independent protein translocase protein TatC  31.25 
 
 		 154 aa  40.4  0.009  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3674  globin  30.23 
 
 		 121 aa  40  0.01  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>