89 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dshi_2305 on replicon NC_009952
Organism: Dinoroseobacter shibae DFL 12



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009952  Dshi_2305  hypothetical protein  100 
 
 		 151 aa  312  9e-85  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_5029  globin  52.31 
 
 		 165 aa  146  1.0000000000000001e-34  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3212  globin  48.82 
 
 		 153 aa  138  3e-32  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00535354 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1842  hypothetical protein  49.61 
 
 		 139 aa  126  8.000000000000001e-29  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2690  globin  53.57 
 
 		 155 aa  121  3e-27  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6298  hypothetical protein  49.14 
 
 		 144 aa  120  7e-27  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.689785 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2995  globin  46.55 
 
 		 133 aa  112  1.0000000000000001e-24  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0463225  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1478  SEC-independent protein translocase protein TatC  47.32 
 
 		 139 aa  112  2.0000000000000002e-24  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2518  hypothetical protein  45.3 
 
 		 128 aa  110  6e-24  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.93992  normal  0.501492 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0898  hypothetical protein  49.51 
 
 		 136 aa  110  7.000000000000001e-24  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.135732  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0841  hypothetical protein  49.51 
 
 		 136 aa  110  7.000000000000001e-24  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.658451  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4232  hypothetical protein  51.3 
 
 		 182 aa  104  5e-22  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4698  hypothetical protein  46.22 
 
 		 130 aa  102  2e-21  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.100774 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3175  hypothetical protein  44.25 
 
 		 142 aa  101  3e-21  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4280  SEC-independent protein translocase protein TatC  43.7 
 
 		 154 aa  100  6e-21  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0742  hypothetical protein  47.75 
 
 		 140 aa  100  7e-21  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.74406  normal  1 
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5297  sec-independent protein translocase protein TatC  42.86 
 
 		 127 aa  100  1e-20  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.30344  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5779  globin  42.11 
 
 		 132 aa  99.4  1e-20  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00168244  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2513  globin family protein  35.33 
 
 		 165 aa  98.6  2e-20  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1565  hypothetical protein  48.57 
 
 		 140 aa  98.2  3e-20  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.809798  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2064  hypothetical protein  47.06 
 
 		 132 aa  98.2  3e-20  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1574  SEC-independent protein translocase protein TatC  42.86 
 
 		 127 aa  96.7  9e-20  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.583199  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1025  hypothetical protein  42.61 
 
 		 138 aa  95.9  2e-19  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.645968 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3493  hypothetical protein  43.9 
 
 		 140 aa  95.1  3e-19  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2331  hypothetical protein  36.59 
 
 		 145 aa  92.8  1e-18  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.0477128 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0855  hypothetical protein  43.24 
 
 		 224 aa  92.8  2e-18  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.102097 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4555  hypothetical protein  48.51 
 
 		 130 aa  92.4  2e-18  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.298668 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4263  hypothetical protein  40.44 
 
 		 155 aa  91.7  3e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3041  truncated hemoglobin-like protein  42.61 
 
 		 150 aa  92  3e-18  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.151785 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0535  hypothetical protein  43.64 
 
 		 161 aa  92  3e-18  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.145284  normal  0.658808 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4184  hypothetical protein  50.52 
 
 		 130 aa  90.9  5e-18  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1424  globin  40.94 
 
 		 184 aa  90.5  7e-18  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0566863  hitchhiker  0.0088103 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0754  hypothetical protein  41.44 
 
 		 147 aa  88.6  2e-17  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.413397 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4528  hypothetical protein  40.8 
 
 		 155 aa  87.8  4e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.127844 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6003  hypothetical protein  39.06 
 
 		 138 aa  85.5  3e-16  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0188186  normal  0.0655749 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5150  globin-like protein  39.68 
 
 		 186 aa  84.3  4e-16  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.893313  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1428  putative sec-independent protein translocase protein TatC  37.14 
 
 		 146 aa  84.3  5e-16  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1787  globin  40.46 
 
 		 186 aa  84.3  5e-16  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1759  globin  40.46 
 
 		 186 aa  84.3  5e-16  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.170545 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0499  sec-independent protein translocase protein TatC  46.59 
 
 		 141 aa  84.3  6e-16  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1849  globin  41.41 
 
 		 186 aa  83.6  8e-16  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6230  globin  41.41 
 
 		 186 aa  83.6  8e-16  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1873  globin  40.62 
 
 		 186 aa  82.8  0.000000000000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.380705  hitchhiker  0.0000412493 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1904  hypothetical protein  40.51 
 
 		 159 aa  82  0.000000000000003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1838  globin  31.48 
 
 		 129 aa  81.6  0.000000000000003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.342813  hitchhiker  0.000000178358 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1715  hypothetical protein  36.84 
 
 		 163 aa  81.6  0.000000000000003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.0910498 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0149  hypothetical protein  35.77 
 
 		 127 aa  80.5  0.000000000000008  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2376  hypothetical protein  39.09 
 
 		 181 aa  80.1  0.000000000000009  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.733503 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5909  globin  39.5 
 
 		 165 aa  79.7  0.00000000000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.94864  normal  0.233628 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_4025  globin family protein  44.32 
 
 		 128 aa  80.1  0.00000000000001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3419  hypothetical protein  40.35 
 
 		 132 aa  79  0.00000000000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.24808 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1869  hypothetical protein  38.79 
 
 		 180 aa  79.3  0.00000000000002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2391  hypothetical protein  38.79 
 
 		 180 aa  79.3  0.00000000000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0027  hypothetical protein  38.79 
 
 		 180 aa  79.3  0.00000000000002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0995303  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2226  hypothetical protein  38.79 
 
 		 180 aa  79.3  0.00000000000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.442578  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2203  hypothetical protein  37.82 
 
 		 183 aa  78.6  0.00000000000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.00750024  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2264  hypothetical protein  38.79 
 
 		 180 aa  79.3  0.00000000000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1141  hypothetical protein  38.79 
 
 		 180 aa  79.3  0.00000000000002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0822886  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1475  hypothetical protein  34.21 
 
 		 127 aa  77.8  0.00000000000004  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.0660231  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0490  hypothetical protein  34.21 
 
 		 127 aa  77.8  0.00000000000005  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.0856682  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2147  globin  39.82 
 
 		 144 aa  77  0.00000000000007  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.20017 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0993  hypothetical protein  32.5 
 
 		 124 aa  76.3  0.0000000000001  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1811  globin  36.97 
 
 		 230 aa  76.3  0.0000000000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.424757  normal  0.0811306 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1570  globin-like protein  39.13 
 
 		 143 aa  76.3  0.0000000000001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0955193  normal  1 
 
 
-
 
NC_003912  CJE0515  hypothetical protein  34.21 
 
 		 127 aa  76.3  0.0000000000002  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.382779  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1693  hypothetical protein  31.09 
 
 		 125 aa  75.5  0.0000000000002  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4054  hypothetical protein  31.62 
 
 		 123 aa  75.5  0.0000000000003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0655  globin  31.54 
 
 		 274 aa  75.1  0.0000000000003  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0495224  normal  0.954759 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0936  globin  37.04 
 
 		 185 aa  73.9  0.0000000000008  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.879764 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1359  globin  39.42 
 
 		 133 aa  70.5  0.000000000008  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3614  hypothetical protein  35.45 
 
 		 140 aa  69.7  0.00000000001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.17721  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0779  globin  35.4 
 
 		 135 aa  70.1  0.00000000001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.388138  normal  1 
 
 
-
 
NC_007959  Nham_4300  hypothetical protein  39.47 
 
 		 131 aa  68.9  0.00000000002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.130175  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3273  sec-independent protein translocase protein TatC  36.11 
 
 		 130 aa  68.6  0.00000000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.401481  normal  0.0409465 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1581  globin  31.19 
 
 		 132 aa  67.4  0.00000000006  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.100305  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0222  truncated hemoglobin  30.77 
 
 		 124 aa  67  0.00000000009  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000508679  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2979  globin  35.65 
 
 		 129 aa  58.5  0.00000003  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2388  hypothetical protein  30.28 
 
 		 137 aa  58.5  0.00000003  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4128  hypothetical protein  42.25 
 
 		 86 aa  57.8  0.00000005  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1030  hypothetical protein  31.9 
 
 		 132 aa  56.2  0.0000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.303916 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3004  hypothetical protein  29.57 
 
 		 147 aa  55.1  0.0000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.930099  normal  0.0388859 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2080  hypothetical protein  29.92 
 
 		 148 aa  53.1  0.000001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5670  hypothetical protein  30.51 
 
 		 162 aa  52.8  0.000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.534962  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5291  hypothetical protein  29.66 
 
 		 162 aa  49.3  0.00002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2635  globin  34.26 
 
 		 151 aa  49.3  0.00002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0270867  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5380  hypothetical protein  29.66 
 
 		 162 aa  49.3  0.00002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0721  hypothetical protein  33.75 
 
 		 132 aa  42  0.003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0869  globin  33.75 
 
 		 132 aa  42  0.003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.523216  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1989  globin  28.69 
 
 		 136 aa  40.8  0.007  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>