70 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mmcs_5291 on replicon NC_008146
Organism: Mycobacterium sp. MCS



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008705  Mkms_5380  hypothetical protein  100 
 
 
162 aa  332  1e-90  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5291  hypothetical protein  100 
 
 
162 aa  332  1e-90  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5670  hypothetical protein  95.68 
 
 
162 aa  321  3e-87  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.534962  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3004  hypothetical protein  45.38 
 
 
147 aa  110  9e-24  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.930099  normal  0.0388859 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1030  hypothetical protein  43.8 
 
 
132 aa  107  9.000000000000001e-23  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.303916 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4054  hypothetical protein  33.61 
 
 
123 aa  98.2  4e-20  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3273  sec-independent protein translocase protein TatC  39.66 
 
 
130 aa  97.4  6e-20  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.401481  normal  0.0409465 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5779  globin  36.59 
 
 
132 aa  90.9  7e-18  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00168244  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2080  hypothetical protein  36.67 
 
 
148 aa  88.6  3e-17  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1904  hypothetical protein  31.09 
 
 
159 aa  75.5  0.0000000000003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1581  globin  31.09 
 
 
132 aa  65.5  0.0000000003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.100305  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2518  hypothetical protein  31.2 
 
 
128 aa  64.7  0.0000000006  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.93992  normal  0.501492 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2690  globin  30.77 
 
 
155 aa  64.3  0.0000000006  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6230  globin  31.54 
 
 
186 aa  62  0.000000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1359  globin  28.83 
 
 
133 aa  62  0.000000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1849  globin  31.54 
 
 
186 aa  62  0.000000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2995  globin  31.71 
 
 
133 aa  62  0.000000004  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0463225  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1873  globin  31.54 
 
 
186 aa  61.6  0.000000005  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.380705  hitchhiker  0.0000412493 
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4280  SEC-independent protein translocase protein TatC  33.85 
 
 
154 aa  59.7  0.00000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0855  hypothetical protein  29.45 
 
 
224 aa  59.3  0.00000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.102097 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1811  globin  31.25 
 
 
230 aa  59.7  0.00000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.424757  normal  0.0811306 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1759  globin  31.06 
 
 
186 aa  58.5  0.00000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.170545 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1787  globin  30.3 
 
 
186 aa  58.5  0.00000004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1838  globin  27.78 
 
 
129 aa  58.5  0.00000004  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.342813  hitchhiker  0.000000178358 
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_5029  globin  31.45 
 
 
165 aa  58.2  0.00000005  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5297  sec-independent protein translocase protein TatC  31.48 
 
 
127 aa  58.2  0.00000005  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.30344  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2376  hypothetical protein  31.25 
 
 
181 aa  58.2  0.00000005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.733503 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5150  globin-like protein  29.66 
 
 
186 aa  57.8  0.00000006  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.893313  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1424  globin  31.25 
 
 
184 aa  56.6  0.0000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0566863  hitchhiker  0.0088103 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1842  hypothetical protein  30.7 
 
 
139 aa  56.6  0.0000001  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1574  SEC-independent protein translocase protein TatC  28.83 
 
 
127 aa  57  0.0000001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.583199  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0754  hypothetical protein  29.31 
 
 
147 aa  56.2  0.0000002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.413397 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3212  globin  30.33 
 
 
153 aa  55.1  0.0000004  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00535354 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6298  hypothetical protein  28.57 
 
 
144 aa  55.1  0.0000004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.689785 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2264  hypothetical protein  28.57 
 
 
180 aa  54.3  0.0000006  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2391  hypothetical protein  28.57 
 
 
180 aa  54.3  0.0000007  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1869  hypothetical protein  28.57 
 
 
180 aa  54.3  0.0000007  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0027  hypothetical protein  28.57 
 
 
180 aa  54.3  0.0000007  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0995303  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1141  hypothetical protein  28.57 
 
 
180 aa  54.3  0.0000007  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0822886  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4263  hypothetical protein  32.41 
 
 
155 aa  54.3  0.0000007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2226  hypothetical protein  28.57 
 
 
180 aa  54.3  0.0000007  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.442578  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2203  hypothetical protein  28.57 
 
 
183 aa  53.9  0.0000008  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.00750024  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4698  hypothetical protein  30.17 
 
 
130 aa  53.5  0.000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.100774 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0936  globin  30.28 
 
 
185 aa  53.1  0.000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.879764 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1025  hypothetical protein  29.91 
 
 
138 aa  52.4  0.000003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.645968 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4528  hypothetical protein  31.48 
 
 
155 aa  51.6  0.000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.127844 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1570  globin-like protein  30.97 
 
 
143 aa  51.2  0.000007  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0955193  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3041  truncated hemoglobin-like protein  29.66 
 
 
150 aa  50.8  0.000008  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.151785 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3175  hypothetical protein  28.57 
 
 
142 aa  50.8  0.000008  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1478  SEC-independent protein translocase protein TatC  26.87 
 
 
139 aa  50.4  0.000009  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2064  hypothetical protein  28.35 
 
 
132 aa  50.4  0.00001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0993  hypothetical protein  24 
 
 
124 aa  50.1  0.00001  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2305  hypothetical protein  29.66 
 
 
151 aa  49.3  0.00002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2331  hypothetical protein  27.01 
 
 
145 aa  48.9  0.00003  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.0477128 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1428  putative sec-independent protein translocase protein TatC  28.91 
 
 
146 aa  47.8  0.00007  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5909  globin  31.03 
 
 
165 aa  47  0.0001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.94864  normal  0.233628 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0898  hypothetical protein  26.72 
 
 
136 aa  45.1  0.0004  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.135732  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0841  hypothetical protein  26.72 
 
 
136 aa  45.1  0.0004  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.658451  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4555  hypothetical protein  28.85 
 
 
130 aa  45.1  0.0005  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.298668 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4184  hypothetical protein  28.85 
 
 
130 aa  44.3  0.0007  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0742  hypothetical protein  25.64 
 
 
140 aa  44.3  0.0007  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.74406  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4232  hypothetical protein  30.95 
 
 
182 aa  43.9  0.0009  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2513  globin family protein  28.04 
 
 
165 aa  43.9  0.001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0499  sec-independent protein translocase protein TatC  27.34 
 
 
141 aa  43.9  0.001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1693  hypothetical protein  24.59 
 
 
125 aa  43.5  0.001  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3419  hypothetical protein  28.44 
 
 
132 aa  43.1  0.002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.24808 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6003  hypothetical protein  30.23 
 
 
138 aa  42.7  0.002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0188186  normal  0.0655749 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3493  hypothetical protein  26.02 
 
 
140 aa  41.2  0.006  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0535  hypothetical protein  29.46 
 
 
161 aa  40.8  0.008  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.145284  normal  0.658808 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1565  hypothetical protein  27.43 
 
 
140 aa  40.4  0.009  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.809798  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>