87 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rpal_2995 on replicon NC_011004
Organism: Rhodopseudomonas palustris TIE-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011004  Rpal_2995  globin  100 
 
 		 133 aa  275  1e-73  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0463225  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2518  hypothetical protein  80.65 
 
 		 128 aa  212  9.999999999999999e-55  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.93992  normal  0.501492 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6298  hypothetical protein  71.2 
 
 		 144 aa  184  3e-46  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.689785 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1478  SEC-independent protein translocase protein TatC  73.33 
 
 		 139 aa  183  5e-46  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0898  hypothetical protein  67.5 
 
 		 136 aa  173  8e-43  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.135732  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0841  hypothetical protein  67.5 
 
 		 136 aa  173  8e-43  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.658451  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3212  globin  48.31 
 
 		 153 aa  128  3e-29  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00535354 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2064  hypothetical protein  50.41 
 
 		 132 aa  122  1e-27  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_5029  globin  47.41 
 
 		 165 aa  119  9.999999999999999e-27  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2690  globin  50 
 
 		 155 aa  118  1.9999999999999998e-26  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4698  hypothetical protein  50.88 
 
 		 130 aa  119  1.9999999999999998e-26  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.100774 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2305  hypothetical protein  46.55 
 
 		 151 aa  112  1.0000000000000001e-24  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1842  hypothetical protein  44.07 
 
 		 139 aa  112  2.0000000000000002e-24  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2331  hypothetical protein  47.06 
 
 		 145 aa  112  2.0000000000000002e-24  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.0477128 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2513  globin family protein  46.55 
 
 		 165 aa  110  6e-24  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3419  hypothetical protein  43.2 
 
 		 132 aa  110  7.000000000000001e-24  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.24808 
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4280  SEC-independent protein translocase protein TatC  45.45 
 
 		 154 aa  108  2.0000000000000002e-23  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5297  sec-independent protein translocase protein TatC  45.13 
 
 		 127 aa  107  4.0000000000000004e-23  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.30344  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4555  hypothetical protein  52.48 
 
 		 130 aa  106  9.000000000000001e-23  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.298668 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6003  hypothetical protein  47.37 
 
 		 138 aa  106  9.000000000000001e-23  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0188186  normal  0.0655749 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4184  hypothetical protein  52.48 
 
 		 130 aa  106  1e-22  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1715  hypothetical protein  42.34 
 
 		 163 aa  106  1e-22  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.0910498 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3175  hypothetical protein  44.25 
 
 		 142 aa  106  1e-22  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5779  globin  45.37 
 
 		 132 aa  104  3e-22  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00168244  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1428  putative sec-independent protein translocase protein TatC  40.87 
 
 		 146 aa  103  9e-22  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1574  SEC-independent protein translocase protein TatC  41.59 
 
 		 127 aa  101  3e-21  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.583199  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4232  hypothetical protein  43.09 
 
 		 182 aa  100  6e-21  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1565  hypothetical protein  45.45 
 
 		 140 aa  100  7e-21  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.809798  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3493  hypothetical protein  39.67 
 
 		 140 aa  99.8  1e-20  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0754  hypothetical protein  45.79 
 
 		 147 aa  97.1  7e-20  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.413397 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3041  truncated hemoglobin-like protein  39.34 
 
 		 150 aa  97.1  8e-20  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.151785 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1025  hypothetical protein  41.13 
 
 		 138 aa  95.5  2e-19  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.645968 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0742  hypothetical protein  39.13 
 
 		 140 aa  95.5  2e-19  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.74406  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0855  hypothetical protein  43.52 
 
 		 224 aa  92.8  1e-18  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.102097 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1359  globin  44.55 
 
 		 133 aa  92  2e-18  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1475  hypothetical protein  38.26 
 
 		 127 aa  90.5  7e-18  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.0660231  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_4025  globin family protein  42.02 
 
 		 128 aa  89.7  1e-17  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0490  hypothetical protein  38.26 
 
 		 127 aa  89.4  1e-17  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.0856682  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0499  sec-independent protein translocase protein TatC  41.12 
 
 		 141 aa  88.6  3e-17  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0515  hypothetical protein  37.39 
 
 		 127 aa  88.2  4e-17  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.382779  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0535  hypothetical protein  44.44 
 
 		 161 aa  85.5  2e-16  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.145284  normal  0.658808 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4054  hypothetical protein  40.18 
 
 		 123 aa  85.1  3e-16  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0936  globin  39.64 
 
 		 185 aa  83.2  0.000000000000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.879764 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1424  globin  39.09 
 
 		 184 aa  82.8  0.000000000000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0566863  hitchhiker  0.0088103 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4263  hypothetical protein  38.53 
 
 		 155 aa  82.4  0.000000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1759  globin  39.09 
 
 		 186 aa  82  0.000000000000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.170545 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1787  globin  39.09 
 
 		 186 aa  82.4  0.000000000000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1838  globin  32.77 
 
 		 129 aa  82.8  0.000000000000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.342813  hitchhiker  0.000000178358 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4528  hypothetical protein  39.45 
 
 		 155 aa  81.6  0.000000000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.127844 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0779  globin  34.4 
 
 		 135 aa  80.9  0.000000000000005  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.388138  normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1869  hypothetical protein  39.81 
 
 		 180 aa  80.9  0.000000000000006  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2391  hypothetical protein  39.81 
 
 		 180 aa  80.9  0.000000000000006  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1141  hypothetical protein  39.81 
 
 		 180 aa  80.9  0.000000000000006  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0822886  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2226  hypothetical protein  39.81 
 
 		 180 aa  80.9  0.000000000000006  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.442578  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2264  hypothetical protein  39.81 
 
 		 180 aa  80.9  0.000000000000006  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0027  hypothetical protein  39.81 
 
 		 180 aa  80.9  0.000000000000006  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0995303  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1873  globin  39.09 
 
 		 186 aa  80.5  0.000000000000007  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.380705  hitchhiker  0.0000412493 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1904  hypothetical protein  34.78 
 
 		 159 aa  80.5  0.000000000000007  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6230  globin  39.09 
 
 		 186 aa  80.5  0.000000000000007  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1849  globin  39.09 
 
 		 186 aa  80.5  0.000000000000007  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2203  hypothetical protein  38.89 
 
 		 183 aa  79.3  0.00000000000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.00750024  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5150  globin-like protein  36.94 
 
 		 186 aa  79  0.00000000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.893313  normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5909  globin  37.72 
 
 		 165 aa  78.6  0.00000000000003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.94864  normal  0.233628 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2388  hypothetical protein  35.25 
 
 		 137 aa  78.2  0.00000000000004  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0222  truncated hemoglobin  36.52 
 
 		 124 aa  77.4  0.00000000000005  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000508679  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2376  hypothetical protein  37.38 
 
 		 181 aa  77.4  0.00000000000005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.733503 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0149  hypothetical protein  37.29 
 
 		 127 aa  77.4  0.00000000000006  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3004  hypothetical protein  38.58 
 
 		 147 aa  77.4  0.00000000000006  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.930099  normal  0.0388859 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3614  hypothetical protein  34.43 
 
 		 140 aa  77  0.00000000000008  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.17721  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1811  globin  36.36 
 
 		 230 aa  76.3  0.0000000000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.424757  normal  0.0811306 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2147  globin  34.78 
 
 		 144 aa  75.1  0.0000000000003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.20017 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0655  globin  32.77 
 
 		 274 aa  73.9  0.0000000000007  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0495224  normal  0.954759 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0993  hypothetical protein  32.17 
 
 		 124 aa  72.8  0.000000000001  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1693  hypothetical protein  32.43 
 
 		 125 aa  70.1  0.000000000009  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3273  sec-independent protein translocase protein TatC  35.64 
 
 		 130 aa  69.7  0.00000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.401481  normal  0.0409465 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2080  hypothetical protein  42 
 
 		 148 aa  69.7  0.00000000001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1030  hypothetical protein  37.5 
 
 		 132 aa  67.4  0.00000000007  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.303916 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1581  globin  31.36 
 
 		 132 aa  66.2  0.0000000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.100305  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1570  globin-like protein  32.11 
 
 		 143 aa  64.7  0.0000000004  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0955193  normal  1 
 
 
-
 
NC_007959  Nham_4300  hypothetical protein  37.5 
 
 		 131 aa  63.5  0.0000000009  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.130175  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5670  hypothetical protein  30.89 
 
 		 162 aa  63.5  0.000000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.534962  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5291  hypothetical protein  31.71 
 
 		 162 aa  62  0.000000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5380  hypothetical protein  31.71 
 
 		 162 aa  62  0.000000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2635  globin  38.79 
 
 		 151 aa  61.2  0.000000005  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0270867  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4128  hypothetical protein  40.91 
 
 		 86 aa  59.7  0.00000001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2979  globin  31.3 
 
 		 129 aa  58.2  0.00000004  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2371  globin  28.97 
 
 		 126 aa  42.4  0.002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.868938 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>