60 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rfer_4128 on replicon NC_007908
Organism: Rhodoferax ferrireducens T118



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007908  Rfer_4128  hypothetical protein  100 
 
 		 86 aa  181  4.0000000000000006e-45  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1025  hypothetical protein  68 
 
 		 138 aa  105  2e-22  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.645968 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0499  sec-independent protein translocase protein TatC  56.76 
 
 		 141 aa  84  7e-16  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1428  putative sec-independent protein translocase protein TatC  51.56 
 
 		 146 aa  73.6  0.0000000000008  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2995  globin  40.91 
 
 		 133 aa  59.7  0.00000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0463225  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2518  hypothetical protein  46.67 
 
 		 128 aa  59.3  0.00000001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.93992  normal  0.501492 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2305  hypothetical protein  42.25 
 
 		 151 aa  57.8  0.00000005  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1904  hypothetical protein  41.67 
 
 		 159 aa  57  0.00000009  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1565  hypothetical protein  41.1 
 
 		 140 aa  56.2  0.0000001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.809798  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1574  SEC-independent protein translocase protein TatC  46.67 
 
 		 127 aa  56.6  0.0000001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.583199  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_4025  globin family protein  39.47 
 
 		 128 aa  56.6  0.0000001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5779  globin  39.73 
 
 		 132 aa  56.2  0.0000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00168244  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3273  sec-independent protein translocase protein TatC  39.19 
 
 		 130 aa  55.8  0.0000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.401481  normal  0.0409465 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2513  globin family protein  39.71 
 
 		 165 aa  54.7  0.0000004  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3175  hypothetical protein  44.44 
 
 		 142 aa  54.3  0.0000005  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5297  sec-independent protein translocase protein TatC  44.07 
 
 		 127 aa  53.5  0.000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.30344  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4232  hypothetical protein  40.74 
 
 		 182 aa  53.5  0.000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_5029  globin  41.33 
 
 		 165 aa  52.4  0.000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0898  hypothetical protein  43.28 
 
 		 136 aa  52.4  0.000002  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.135732  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0841  hypothetical protein  43.28 
 
 		 136 aa  52.4  0.000002  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.658451  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0855  hypothetical protein  41.54 
 
 		 224 aa  52.8  0.000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.102097 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2690  globin  44.07 
 
 		 155 aa  52  0.000003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1838  globin  37.1 
 
 		 129 aa  51.6  0.000004  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.342813  hitchhiker  0.000000178358 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3041  truncated hemoglobin-like protein  45.45 
 
 		 150 aa  51.6  0.000004  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.151785 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2331  hypothetical protein  38.24 
 
 		 145 aa  51.2  0.000005  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.0477128 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6298  hypothetical protein  44.23 
 
 		 144 aa  50.8  0.000006  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.689785 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2147  globin  38.33 
 
 		 144 aa  50.4  0.000008  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.20017 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3212  globin  40.3 
 
 		 153 aa  49.3  0.00002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00535354 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0535  hypothetical protein  34.29 
 
 		 161 aa  48.5  0.00003  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.145284  normal  0.658808 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0742  hypothetical protein  37.66 
 
 		 140 aa  48.5  0.00003  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.74406  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3493  hypothetical protein  37.5 
 
 		 140 aa  48.5  0.00003  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3614  hypothetical protein  36.67 
 
 		 140 aa  47.4  0.00007  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.17721  normal  1 
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4280  SEC-independent protein translocase protein TatC  33.77 
 
 		 154 aa  47  0.00009  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1715  hypothetical protein  32.43 
 
 		 163 aa  46.6  0.0001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.0910498 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4698  hypothetical protein  36.76 
 
 		 130 aa  45.8  0.0002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.100774 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2391  hypothetical protein  42.11 
 
 		 180 aa  45.8  0.0002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2064  hypothetical protein  32.5 
 
 		 132 aa  45.8  0.0002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1478  SEC-independent protein translocase protein TatC  38.46 
 
 		 139 aa  45.8  0.0002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2388  hypothetical protein  30.26 
 
 		 137 aa  45.8  0.0002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1869  hypothetical protein  42.11 
 
 		 180 aa  45.8  0.0002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0027  hypothetical protein  42.11 
 
 		 180 aa  45.8  0.0002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0995303  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2226  hypothetical protein  42.11 
 
 		 180 aa  45.8  0.0002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.442578  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2264  hypothetical protein  42.11 
 
 		 180 aa  45.8  0.0002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1141  hypothetical protein  42.11 
 
 		 180 aa  45.8  0.0002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0822886  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1581  globin  37.25 
 
 		 132 aa  46.2  0.0002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.100305  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1842  hypothetical protein  38.03 
 
 		 139 aa  45.1  0.0003  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1424  globin  42.11 
 
 		 184 aa  44.7  0.0004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0566863  hitchhiker  0.0088103 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2203  hypothetical protein  40.35 
 
 		 183 aa  45.1  0.0004  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.00750024  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1475  hypothetical protein  32.88 
 
 		 127 aa  43.9  0.0007  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.0660231  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0490  hypothetical protein  32.88 
 
 		 127 aa  43.9  0.0008  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.0856682  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0515  hypothetical protein  32 
 
 		 127 aa  43.9  0.0008  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.382779  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5150  globin-like protein  42.11 
 
 		 186 aa  43.1  0.001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.893313  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2376  hypothetical protein  40.35 
 
 		 181 aa  43.5  0.001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.733503 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1570  globin-like protein  41.51 
 
 		 143 aa  43.5  0.001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0955193  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1759  globin  40.35 
 
 		 186 aa  42  0.003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.170545 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1787  globin  40.35 
 
 		 186 aa  42  0.003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1849  globin  40.35 
 
 		 186 aa  41.2  0.004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6230  globin  40.35 
 
 		 186 aa  41.2  0.004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1873  globin  40.35 
 
 		 186 aa  41.2  0.005  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.380705  hitchhiker  0.0000412493 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6003  hypothetical protein  32.35 
 
 		 138 aa  40  0.01  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0188186  normal  0.0655749 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>