37 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene AFE_0721 on replicon NC_011761
Organism: Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011761  AFE_0721  hypothetical protein  100 
 
 		 132 aa  274  3e-73  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0869  globin  100 
 
 		 132 aa  274  3e-73  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.523216  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2635  globin  42.86 
 
 		 151 aa  94.4  5e-19  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0270867  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2371  globin  36.44 
 
 		 126 aa  87.4  7e-17  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.868938 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2979  globin  35.29 
 
 		 129 aa  82  0.000000000000003  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0655  globin  35.14 
 
 		 274 aa  60.1  0.00000001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0495224  normal  0.954759 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2388  hypothetical protein  30.16 
 
 		 137 aa  56.2  0.0000002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1838  globin  29.03 
 
 		 129 aa  50.1  0.00001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.342813  hitchhiker  0.000000178358 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2391  hypothetical protein  31.45 
 
 		 180 aa  48.1  0.00004  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1141  hypothetical protein  31.45 
 
 		 180 aa  48.1  0.00004  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0822886  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2264  hypothetical protein  31.45 
 
 		 180 aa  48.1  0.00004  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2226  hypothetical protein  31.45 
 
 		 180 aa  48.1  0.00004  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.442578  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0027  hypothetical protein  31.45 
 
 		 180 aa  48.1  0.00004  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0995303  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1869  hypothetical protein  31.45 
 
 		 180 aa  48.1  0.00004  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2203  hypothetical protein  31.45 
 
 		 183 aa  48.1  0.00004  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.00750024  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1759  globin  32.41 
 
 		 186 aa  45.4  0.0002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.170545 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3614  hypothetical protein  30.58 
 
 		 140 aa  45.1  0.0003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.17721  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0222  truncated hemoglobin  26.55 
 
 		 124 aa  44.7  0.0004  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000508679  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0779  globin  32.61 
 
 		 135 aa  44.7  0.0004  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.388138  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1428  putative sec-independent protein translocase protein TatC  27.93 
 
 		 146 aa  45.1  0.0004  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1787  globin  31.48 
 
 		 186 aa  44.3  0.0005  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5150  globin-like protein  31.15 
 
 		 186 aa  43.9  0.0006  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.893313  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1424  globin  31.48 
 
 		 184 aa  43.9  0.0007  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0566863  hitchhiker  0.0088103 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1873  globin  30.56 
 
 		 186 aa  43.9  0.0007  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.380705  hitchhiker  0.0000412493 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6230  globin  30.56 
 
 		 186 aa  43.9  0.0008  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1849  globin  30.56 
 
 		 186 aa  43.9  0.0008  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2147  globin  25.23 
 
 		 144 aa  43.1  0.001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.20017 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1842  hypothetical protein  30.28 
 
 		 139 aa  42.7  0.001  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2305  hypothetical protein  33.75 
 
 		 151 aa  42  0.003  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_5029  globin  28.95 
 
 		 165 aa  42  0.003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0499  sec-independent protein translocase protein TatC  30.28 
 
 		 141 aa  42  0.003  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0742  hypothetical protein  28.7 
 
 		 140 aa  41.6  0.003  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.74406  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1570  globin-like protein  28.97 
 
 		 143 aa  42  0.003  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0955193  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1025  hypothetical protein  28.7 
 
 		 138 aa  41.6  0.004  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.645968 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5909  globin  30.63 
 
 		 165 aa  41.2  0.004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.94864  normal  0.233628 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3212  globin  28.32 
 
 		 153 aa  41.2  0.005  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00535354 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3175  hypothetical protein  33.33 
 
 		 142 aa  40.4  0.008  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>