130 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swit_1200 on replicon NC_009511
Organism: Sphingomonas wittichii RW1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009511  Swit_1200  globin  100 
 
 		 137 aa  270  6e-72  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.139357  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_5057  globin  56.2 
 
 		 131 aa  139  1.9999999999999998e-32  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.342069 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0069  globin  56.56 
 
 		 131 aa  136  7.999999999999999e-32  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4060  globin family  42.64 
 
 		 145 aa  93.2  1e-18  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.171574 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2018  globin  43.8 
 
 		 133 aa  85.1  3e-16  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2697  putative globin  43.33 
 
 		 136 aa  83.6  8e-16  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2781  globin  42.24 
 
 		 141 aa  83.6  9e-16  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.778315  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3955  globin  48.48 
 
 		 128 aa  83.6  9e-16  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.405628  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4036  globin  41.53 
 
 		 139 aa  83.2  0.000000000000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1997  hypothetical protein  45.54 
 
 		 129 aa  83.2  0.000000000000001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.174841  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0899  globin  42.74 
 
 		 147 aa  83.2  0.000000000000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3454  globin  42.24 
 
 		 141 aa  83.2  0.000000000000001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.273084  normal  0.734777 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3147  conserved hypothetical globin-like protein  42.57 
 
 		 129 aa  82  0.000000000000002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.0120923  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1800  globin family protein  40.65 
 
 		 128 aa  81.3  0.000000000000004  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1917  globin  39.55 
 
 		 134 aa  81.3  0.000000000000004  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.626219  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1548  heme-binding protein, putative  37.4 
 
 		 130 aa  79.7  0.00000000000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2241  globin  38.81 
 
 		 134 aa  79.3  0.00000000000001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.723886  normal  0.694262 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1263  globin  37.4 
 
 		 129 aa  79.7  0.00000000000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  0.932923 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0935  hypothetical protein  42.02 
 
 		 139 aa  79  0.00000000000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1256  globin  39.02 
 
 		 137 aa  79  0.00000000000002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.331075 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1767  globin  37.98 
 
 		 137 aa  78.6  0.00000000000003  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0697  globin  38.6 
 
 		 142 aa  78.2  0.00000000000004  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.462727 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1878  hypothetical protein  38.4 
 
 		 131 aa  77.8  0.00000000000005  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0847  globin  43.86 
 
 		 143 aa  77.8  0.00000000000005  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0774  putative oxygen-binding protein (globin)  38.4 
 
 		 126 aa  75.9  0.0000000000002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.207145 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00030  putative hemoglobin-like oxygen-binding protein  31.75 
 
 		 143 aa  75.1  0.0000000000003  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0488861  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1355  globin  37.3 
 
 		 129 aa  74.3  0.0000000000005  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.610023  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2090  putative oxygen-binding protein (globin)  37.12 
 
 		 134 aa  73.6  0.0000000000008  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2330  globin  37.6 
 
 		 130 aa  73.6  0.0000000000009  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.260372  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0410  globin  32.5 
 
 		 144 aa  72.4  0.000000000002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.236118 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5890  putative hemoglobin protein (truncated hemoglobin)  37.27 
 
 		 152 aa  71.6  0.000000000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.429127  normal  0.556027 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1095  hypothetical protein  37.61 
 
 		 136 aa  71.2  0.000000000004  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0772  hypothetical protein  37.61 
 
 		 136 aa  71.2  0.000000000004  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0378  hypothetical protein  37.61 
 
 		 136 aa  71.2  0.000000000004  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.746099  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1867  hypothetical protein  37.61 
 
 		 148 aa  70.9  0.000000000005  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1401  hypothetical protein  37.61 
 
 		 148 aa  71.2  0.000000000005  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1253  hypothetical protein  37.61 
 
 		 136 aa  71.2  0.000000000005  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1261  hypothetical protein  37.61 
 
 		 136 aa  71.2  0.000000000005  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.100755  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3254  globin  38.94 
 
 		 134 aa  70.5  0.000000000007  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.512401  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5606  globin-like protein  39.25 
 
 		 136 aa  70.1  0.00000000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.62023  normal  0.960923 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1030  hypothetical protein  37.61 
 
 		 164 aa  69.7  0.00000000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2614  globin  35.94 
 
 		 133 aa  68.9  0.00000000002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.307504  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0132  globin  37.37 
 
 		 144 aa  69.3  0.00000000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.823311 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3575  globin  40.74 
 
 		 153 aa  68.6  0.00000000003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.425401 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2302  globin  40.19 
 
 		 136 aa  68.6  0.00000000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1316  globin  36.94 
 
 		 137 aa  68.2  0.00000000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.129637 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1667  globin  40.82 
 
 		 136 aa  68.2  0.00000000004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.291446  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2317  globin  39.25 
 
 		 136 aa  67.8  0.00000000004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2279  globin  40.82 
 
 		 136 aa  68.2  0.00000000004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0999  globin  39.25 
 
 		 136 aa  68.2  0.00000000004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0834187  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2195  globin  39.25 
 
 		 136 aa  67.8  0.00000000004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0945  globin  54.1 
 
 		 166 aa  67.8  0.00000000005  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.286317  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3244  putative oxygen-binding protein, globin-like  39.8 
 
 		 137 aa  66.2  0.0000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3444  hypothetical protein  31.5 
 
 		 130 aa  65.1  0.0000000003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.237349  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2346  globin  31.45 
 
 		 142 aa  65.5  0.0000000003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.636016  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0031  globin  30.33 
 
 		 144 aa  64.7  0.0000000004  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.0030771  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3261  globin  33.33 
 
 		 136 aa  64.3  0.0000000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.4456 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2049  globin  38.32 
 
 		 141 aa  63.5  0.0000000009  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.366529  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0039  globin  30.83 
 
 		 145 aa  63.5  0.000000001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0034  globin  30.83 
 
 		 145 aa  63.5  0.000000001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.0103941 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3074  globin  26.72 
 
 		 138 aa  63.2  0.000000001  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.0236905 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1541  hypothetical protein  30.33 
 
 		 141 aa  62  0.000000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1464  putative globin  33.04 
 
 		 139 aa  62  0.000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00251248 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0036  globin  30 
 
 		 145 aa  62.4  0.000000002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0572064  hitchhiker  0.00805011 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3010  globin  33.33 
 
 		 136 aa  62.8  0.000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0042  globin  30 
 
 		 145 aa  62  0.000000003  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0182573  hitchhiker  0.000000860997 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0031  globin  30 
 
 		 145 aa  62  0.000000003  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0800503  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0039  globin  29.51 
 
 		 145 aa  61.2  0.000000004  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.372259  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0038  globin  29.51 
 
 		 145 aa  61.6  0.000000004  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0612769  unclonable  0.00000927103 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0038  globin  29.51 
 
 		 145 aa  61.6  0.000000004  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000122438 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_18050  globin-like protein  33.33 
 
 		 131 aa  61.2  0.000000005  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0868344  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3728  globin  28.21 
 
 		 142 aa  60.5  0.000000007  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.325061  hitchhiker  0.00731261 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0031  globin  28.69 
 
 		 156 aa  60.1  0.000000009  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.0000000058274  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0034  globin  28.69 
 
 		 144 aa  59.7  0.00000001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.674256  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3650  globin  30.16 
 
 		 141 aa  60.1  0.00000001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.260647 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1326  globin  34.34 
 
 		 139 aa  58.5  0.00000003  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0046  globin  29.17 
 
 		 149 aa  58.2  0.00000004  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0363016  normal  0.25879 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3906  globin  26.09 
 
 		 140 aa  57.4  0.00000006  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.22456 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0039  globin  27.5 
 
 		 144 aa  55.5  0.0000003  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.102658  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1116  hypothetical protein  30.53 
 
 		 132 aa  52  0.000003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1209  hypothetical protein  30.53 
 
 		 132 aa  52  0.000003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0051  globin  26.23 
 
 		 143 aa  51.6  0.000004  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.294967  normal  0.0701367 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2370  globin  32.79 
 
 		 130 aa  51.6  0.000004  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.16985  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1105  globin  30.53 
 
 		 132 aa  51.2  0.000004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7353  globin  30.47 
 
 		 129 aa  51.2  0.000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.23037 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1317  hypothetical protein  30.53 
 
 		 132 aa  50.8  0.000006  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.997153  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1098  globin family protein  30.53 
 
 		 132 aa  50.8  0.000006  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1092  globin family protein  30.53 
 
 		 132 aa  50.8  0.000006  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.720422  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1279  globin family protein  30.53 
 
 		 132 aa  50.8  0.000006  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1355  globin family protein  30.53 
 
 		 132 aa  50.8  0.000007  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1626  globin  33.66 
 
 		 137 aa  49.7  0.00001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0911  globin  29.47 
 
 		 132 aa  49.7  0.00001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1250  globin family protein  29.47 
 
 		 132 aa  49.7  0.00001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2015  globin  30.7 
 
 		 121 aa  48.9  0.00002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1376  globin  28.1 
 
 		 124 aa  48.9  0.00002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.510666  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3538  globin  29.92 
 
 		 142 aa  49.3  0.00002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.637564  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1823  globin  33.33 
 
 		 145 aa  49.3  0.00002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000381812  normal  0.0630387 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4091  globin family protein  29.47 
 
 		 132 aa  49.3  0.00002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1225  globin  32.43 
 
 		 125 aa  48.1  0.00003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0341074  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3913  globin  31.36 
 
 		 142 aa  48.5  0.00003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.237071 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>