136 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ping_3074 on replicon NC_008709
Organism: Psychromonas ingrahamii 37



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008709  Ping_3074  globin  100 
 
 		 138 aa  291  2e-78  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.0236905 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3906  globin  69.63 
 
 		 140 aa  211  2.9999999999999995e-54  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.22456 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1541  hypothetical protein  63.71 
 
 		 141 aa  179  1e-44  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3575  globin  49.22 
 
 		 153 aa  133  9.999999999999999e-31  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.425401 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1326  globin  45.6 
 
 		 139 aa  125  2.0000000000000002e-28  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0068  globin  42.31 
 
 		 144 aa  111  3e-24  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0304952  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_18050  globin-like protein  37.19 
 
 		 131 aa  102  2e-21  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0868344  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0410  globin  37.1 
 
 		 144 aa  97.8  5e-20  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.236118 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1878  hypothetical protein  40 
 
 		 131 aa  93.6  8e-19  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3147  conserved hypothetical globin-like protein  39.39 
 
 		 129 aa  87  7e-17  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.0120923  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2346  globin  35.04 
 
 		 142 aa  86.7  1e-16  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.636016  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1548  heme-binding protein, putative  35.25 
 
 		 130 aa  85.9  2e-16  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2697  putative globin  35.83 
 
 		 136 aa  85.9  2e-16  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1263  globin  35.25 
 
 		 129 aa  85.9  2e-16  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  0.932923 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1464  putative globin  35.92 
 
 		 139 aa  84.3  5e-16  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00251248 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4060  globin family  42.11 
 
 		 145 aa  84.3  5e-16  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.171574 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2018  globin  33.88 
 
 		 133 aa  83.6  8e-16  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0697  globin  34.31 
 
 		 142 aa  83.2  0.000000000000001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.462727 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1355  globin  39.56 
 
 		 129 aa  82.4  0.000000000000002  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.610023  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5890  putative hemoglobin protein (truncated hemoglobin)  37.11 
 
 		 152 aa  80.9  0.000000000000006  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.429127  normal  0.556027 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0132  globin  32.74 
 
 		 144 aa  80.9  0.000000000000006  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.823311 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0774  putative oxygen-binding protein (globin)  36.13 
 
 		 126 aa  80.1  0.000000000000009  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.207145 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1767  globin  34.91 
 
 		 137 aa  80.1  0.000000000000009  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1800  globin family protein  43.01 
 
 		 128 aa  79.7  0.00000000000001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3650  globin  33.96 
 
 		 141 aa  79.3  0.00000000000002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.260647 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3254  globin  34.69 
 
 		 134 aa  78.6  0.00000000000003  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.512401  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0847  globin  32.28 
 
 		 143 aa  77.8  0.00000000000004  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0935  hypothetical protein  30.23 
 
 		 139 aa  77.4  0.00000000000006  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0899  globin  32.23 
 
 		 147 aa  76.6  0.0000000000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4036  globin  33.98 
 
 		 139 aa  75.9  0.0000000000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2614  globin  36 
 
 		 133 aa  75.9  0.0000000000002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.307504  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0031  globin  31.71 
 
 		 156 aa  75.9  0.0000000000002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.0000000058274  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1917  globin  30.58 
 
 		 134 aa  75.9  0.0000000000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.626219  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2781  globin  31.45 
 
 		 141 aa  75.9  0.0000000000002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.778315  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3454  globin  31.45 
 
 		 141 aa  75.9  0.0000000000002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.273084  normal  0.734777 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2090  putative oxygen-binding protein (globin)  30.83 
 
 		 134 aa  75.5  0.0000000000003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1997  hypothetical protein  33.04 
 
 		 129 aa  75.1  0.0000000000003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.174841  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1256  globin  32.2 
 
 		 137 aa  75.1  0.0000000000003  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.331075 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2241  globin  30.58 
 
 		 134 aa  75.1  0.0000000000003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.723886  normal  0.694262 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0039  globin  28.93 
 
 		 145 aa  74.7  0.0000000000004  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3955  globin  35.05 
 
 		 128 aa  74.7  0.0000000000004  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.405628  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0031  globin  29.03 
 
 		 145 aa  74.3  0.0000000000005  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0800503  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3728  globin  33.33 
 
 		 142 aa  74.3  0.0000000000006  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.325061  hitchhiker  0.00731261 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0031  globin  30.89 
 
 		 144 aa  72.8  0.000000000001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.0030771  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0039  globin  28.93 
 
 		 145 aa  72.8  0.000000000001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.372259  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0038  globin  28.93 
 
 		 145 aa  72.8  0.000000000001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0612769  unclonable  0.00000927103 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0038  globin  28.93 
 
 		 145 aa  72.8  0.000000000001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000122438 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0051  globin  38 
 
 		 143 aa  72  0.000000000002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.294967  normal  0.0701367 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0034  globin  28.93 
 
 		 144 aa  72.4  0.000000000002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.674256  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0042  globin  29.27 
 
 		 145 aa  71.6  0.000000000003  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0182573  hitchhiker  0.000000860997 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1867  hypothetical protein  31.15 
 
 		 148 aa  71.2  0.000000000004  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1401  hypothetical protein  31.15 
 
 		 148 aa  71.2  0.000000000004  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1095  hypothetical protein  31.15 
 
 		 136 aa  71.2  0.000000000004  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0772  hypothetical protein  31.15 
 
 		 136 aa  71.2  0.000000000004  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1253  hypothetical protein  31.15 
 
 		 136 aa  71.2  0.000000000004  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1261  hypothetical protein  31.15 
 
 		 136 aa  71.2  0.000000000004  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.100755  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0378  hypothetical protein  31.15 
 
 		 136 aa  71.2  0.000000000004  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.746099  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0036  globin  29.27 
 
 		 145 aa  71.2  0.000000000005  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0572064  hitchhiker  0.00805011 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1030  hypothetical protein  31.15 
 
 		 164 aa  70.9  0.000000000006  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1316  globin  28.69 
 
 		 137 aa  70.9  0.000000000006  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.129637 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0034  globin  29.27 
 
 		 145 aa  70.5  0.000000000007  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.0103941 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2317  globin  30.33 
 
 		 136 aa  70.5  0.000000000007  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2195  globin  30.33 
 
 		 136 aa  70.5  0.000000000007  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3244  putative oxygen-binding protein, globin-like  29.51 
 
 		 137 aa  70.5  0.000000000008  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2302  globin  29.55 
 
 		 136 aa  70.1  0.000000000009  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5606  globin-like protein  30.33 
 
 		 136 aa  70.1  0.00000000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.62023  normal  0.960923 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1667  globin  30.33 
 
 		 136 aa  69.3  0.00000000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.291446  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2279  globin  30.33 
 
 		 136 aa  69.3  0.00000000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0999  globin  30.33 
 
 		 136 aa  70.1  0.00000000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0834187  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2049  globin  35.11 
 
 		 141 aa  70.1  0.00000000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.366529  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0945  globin  29.23 
 
 		 166 aa  68.9  0.00000000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.286317  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0039  globin  30.08 
 
 		 144 aa  68.2  0.00000000004  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.102658  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2330  globin  29.36 
 
 		 130 aa  67.8  0.00000000005  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.260372  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_5057  globin  30.97 
 
 		 131 aa  67.8  0.00000000005  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.342069 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0046  globin  28.93 
 
 		 149 aa  67.8  0.00000000005  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0363016  normal  0.25879 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3444  hypothetical protein  32.63 
 
 		 130 aa  67.4  0.00000000007  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.237349  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0069  globin  31.25 
 
 		 131 aa  66.6  0.0000000001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0911  globin  29.41 
 
 		 132 aa  66.2  0.0000000001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3010  globin  33.68 
 
 		 136 aa  65.1  0.0000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1250  globin family protein  30.25 
 
 		 132 aa  63.9  0.0000000006  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1105  globin  29.41 
 
 		 132 aa  63.9  0.0000000006  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1355  globin family protein  29.41 
 
 		 132 aa  63.9  0.0000000007  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4636  globin  32.73 
 
 		 150 aa  63.5  0.0000000008  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0856308  normal  0.0106718 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1317  hypothetical protein  29.41 
 
 		 132 aa  63.2  0.000000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.997153  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1098  globin family protein  29.41 
 
 		 132 aa  63.2  0.000000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1092  globin family protein  29.41 
 
 		 132 aa  63.2  0.000000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.720422  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4091  globin family protein  29.41 
 
 		 132 aa  63.2  0.000000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1200  globin  26.72 
 
 		 137 aa  63.2  0.000000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.139357  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1279  globin family protein  29.41 
 
 		 132 aa  63.2  0.000000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1116  hypothetical protein  29.41 
 
 		 132 aa  62.8  0.000000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1209  hypothetical protein  29.41 
 
 		 132 aa  62.8  0.000000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1626  globin  32.63 
 
 		 137 aa  62.4  0.000000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1001  globin  27.12 
 
 		 121 aa  60.5  0.000000008  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.621706  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1020  globin  27.12 
 
 		 121 aa  60.5  0.000000008  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.0280188  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2370  globin  28.18 
 
 		 130 aa  60.5  0.000000008  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.16985  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0771  globin  33.68 
 
 		 137 aa  60.1  0.000000009  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0582  hypothetical protein  27.05 
 
 		 147 aa  59.7  0.00000001  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.709558  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3261  globin  29.7 
 
 		 136 aa  59.3  0.00000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.4456 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3425  globin  30.43 
 
 		 173 aa  58.5  0.00000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.646541 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1573  globin  29.21 
 
 		 144 aa  56.6  0.0000001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.732575 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>