137 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swoo_3906 on replicon NC_010506
Organism: Shewanella woodyi ATCC 51908



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010506  Swoo_3906  globin  100 
 
 		 140 aa  295  2e-79  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.22456 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3074  globin  69.63 
 
 		 138 aa  211  1.9999999999999998e-54  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.0236905 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1541  hypothetical protein  58.33 
 
 		 141 aa  162  2.0000000000000002e-39  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3575  globin  53.44 
 
 		 153 aa  140  4e-33  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.425401 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1326  globin  47.62 
 
 		 139 aa  132  1.9999999999999998e-30  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0068  globin  43.88 
 
 		 144 aa  125  2.0000000000000002e-28  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0304952  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1878  hypothetical protein  40.16 
 
 		 131 aa  91.7  3e-18  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1800  globin family protein  47.31 
 
 		 128 aa  89  2e-17  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_18050  globin-like protein  43.01 
 
 		 131 aa  87.8  4e-17  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0868344  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4060  globin family  46.24 
 
 		 145 aa  84  7e-16  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.171574 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0774  putative oxygen-binding protein (globin)  37.82 
 
 		 126 aa  82.8  0.000000000000001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.207145 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0899  globin  35.25 
 
 		 147 aa  81.3  0.000000000000004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2697  putative globin  39.25 
 
 		 136 aa  81.3  0.000000000000004  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3147  conserved hypothetical globin-like protein  44.21 
 
 		 129 aa  81.6  0.000000000000004  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.0120923  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1917  globin  33.06 
 
 		 134 aa  79.7  0.00000000000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.626219  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3955  globin  34.71 
 
 		 128 aa  79.3  0.00000000000001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.405628  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0935  hypothetical protein  32.28 
 
 		 139 aa  79.3  0.00000000000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2241  globin  33.06 
 
 		 134 aa  79  0.00000000000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.723886  normal  0.694262 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2090  putative oxygen-binding protein (globin)  33.06 
 
 		 134 aa  78.2  0.00000000000003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2614  globin  35.34 
 
 		 133 aa  78.6  0.00000000000003  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.307504  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0410  globin  41.94 
 
 		 144 aa  78.6  0.00000000000003  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.236118 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3254  globin  36 
 
 		 134 aa  78.2  0.00000000000004  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.512401  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1997  hypothetical protein  33.33 
 
 		 129 aa  77.4  0.00000000000006  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.174841  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1355  globin  38.39 
 
 		 129 aa  77  0.00000000000008  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.610023  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3650  globin  35.04 
 
 		 141 aa  76.3  0.0000000000001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.260647 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2018  globin  31.93 
 
 		 133 aa  75.5  0.0000000000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0697  globin  37.63 
 
 		 142 aa  75.9  0.0000000000002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.462727 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1867  hypothetical protein  33.88 
 
 		 148 aa  75.1  0.0000000000003  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1401  hypothetical protein  33.88 
 
 		 148 aa  75.1  0.0000000000003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1030  hypothetical protein  33.88 
 
 		 164 aa  75.1  0.0000000000003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1095  hypothetical protein  33.88 
 
 		 136 aa  75.1  0.0000000000003  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0772  hypothetical protein  33.88 
 
 		 136 aa  75.1  0.0000000000003  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1253  hypothetical protein  33.88 
 
 		 136 aa  75.1  0.0000000000003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1261  hypothetical protein  33.88 
 
 		 136 aa  75.1  0.0000000000003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.100755  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0378  hypothetical protein  33.88 
 
 		 136 aa  75.1  0.0000000000003  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.746099  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2781  globin  33.64 
 
 		 141 aa  75.1  0.0000000000003  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.778315  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3454  globin  33.64 
 
 		 141 aa  74.7  0.0000000000004  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.273084  normal  0.734777 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1316  globin  32.23 
 
 		 137 aa  74.7  0.0000000000004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.129637 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1464  putative globin  33.88 
 
 		 139 aa  74.3  0.0000000000005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00251248 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2346  globin  33.88 
 
 		 142 aa  74.3  0.0000000000005  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.636016  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1548  heme-binding protein, putative  35.29 
 
 		 130 aa  74.3  0.0000000000005  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1263  globin  35.29 
 
 		 129 aa  74.3  0.0000000000005  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  0.932923 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1256  globin  38.71 
 
 		 137 aa  73.6  0.000000000001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.331075 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2317  globin  33.06 
 
 		 136 aa  73.2  0.000000000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0051  globin  34.69 
 
 		 143 aa  73.2  0.000000000001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.294967  normal  0.0701367 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2302  globin  32.33 
 
 		 136 aa  72.8  0.000000000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2195  globin  33.06 
 
 		 136 aa  73.2  0.000000000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1767  globin  40 
 
 		 137 aa  73.2  0.000000000001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5606  globin-like protein  32.23 
 
 		 136 aa  72.4  0.000000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.62023  normal  0.960923 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1667  globin  33.06 
 
 		 136 aa  72.4  0.000000000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.291446  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2279  globin  33.06 
 
 		 136 aa  72.4  0.000000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0999  globin  33.06 
 
 		 136 aa  72.8  0.000000000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0834187  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2049  globin  33.93 
 
 		 141 aa  72.4  0.000000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.366529  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3244  putative oxygen-binding protein, globin-like  32.23 
 
 		 137 aa  71.6  0.000000000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0911  globin  32.48 
 
 		 132 aa  71.2  0.000000000004  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0034  globin  29.77 
 
 		 144 aa  70.9  0.000000000005  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.674256  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0038  globin  30.83 
 
 		 145 aa  70.9  0.000000000006  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000122438 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0038  globin  30.58 
 
 		 145 aa  70.5  0.000000000007  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0612769  unclonable  0.00000927103 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0039  globin  29.17 
 
 		 145 aa  69.7  0.00000000001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5890  putative hemoglobin protein (truncated hemoglobin)  38.71 
 
 		 152 aa  69.7  0.00000000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.429127  normal  0.556027 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0046  globin  36.84 
 
 		 149 aa  69.7  0.00000000001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0363016  normal  0.25879 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4036  globin  33.98 
 
 		 139 aa  69.3  0.00000000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0039  globin  30 
 
 		 145 aa  68.9  0.00000000002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.372259  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0132  globin  35.11 
 
 		 144 aa  69.3  0.00000000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.823311 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0031  globin  28.23 
 
 		 145 aa  68.6  0.00000000003  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0800503  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1250  globin family protein  37.14 
 
 		 132 aa  67.8  0.00000000004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3728  globin  34.38 
 
 		 142 aa  67  0.00000000007  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.325061  hitchhiker  0.00731261 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4091  globin family protein  36.19 
 
 		 132 aa  67  0.00000000008  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0847  globin  36.36 
 
 		 143 aa  67  0.00000000008  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0031  globin  33.68 
 
 		 156 aa  66.6  0.0000000001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.0000000058274  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3444  hypothetical protein  36.56 
 
 		 130 aa  66.2  0.0000000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.237349  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0042  globin  28.93 
 
 		 145 aa  66.2  0.0000000001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0182573  hitchhiker  0.000000860997 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1105  globin  34.26 
 
 		 132 aa  66.6  0.0000000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1355  globin family protein  35.24 
 
 		 132 aa  66.6  0.0000000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1317  hypothetical protein  35.24 
 
 		 132 aa  65.9  0.0000000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.997153  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1116  hypothetical protein  35.24 
 
 		 132 aa  65.9  0.0000000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1098  globin family protein  35.24 
 
 		 132 aa  65.9  0.0000000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1092  globin family protein  35.24 
 
 		 132 aa  65.9  0.0000000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.720422  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1209  hypothetical protein  35.24 
 
 		 132 aa  65.9  0.0000000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0036  globin  28.93 
 
 		 145 aa  65.9  0.0000000002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0572064  hitchhiker  0.00805011 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1279  globin family protein  35.24 
 
 		 132 aa  65.9  0.0000000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2330  globin  30.91 
 
 		 130 aa  64.3  0.0000000005  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.260372  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0069  globin  35.29 
 
 		 131 aa  62.8  0.000000001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1573  globin  34.65 
 
 		 144 aa  63.2  0.000000001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.732575 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0034  globin  28.33 
 
 		 145 aa  63.2  0.000000001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.0103941 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0031  globin  31.58 
 
 		 144 aa  61.2  0.000000004  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.0030771  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0039  globin  31.58 
 
 		 144 aa  61.2  0.000000004  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.102658  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3010  globin  31.62 
 
 		 136 aa  60.5  0.000000007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0771  globin  31.62 
 
 		 137 aa  59.7  0.00000001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4636  globin  39.18 
 
 		 150 aa  60.1  0.00000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0856308  normal  0.0106718 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0582  hypothetical protein  31.45 
 
 		 147 aa  59.3  0.00000002  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.709558  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0945  globin  35.96 
 
 		 166 aa  59.3  0.00000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.286317  normal  1 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1001  globin  29.91 
 
 		 121 aa  58.2  0.00000004  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.621706  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1020  globin  29.91 
 
 		 121 aa  58.2  0.00000004  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.0280188  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_5057  globin  28.71 
 
 		 131 aa  57.8  0.00000004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.342069 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1626  globin  34.41 
 
 		 137 aa  57.8  0.00000005  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1200  globin  26.09 
 
 		 137 aa  57.4  0.00000006  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.139357  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2370  globin  29.09 
 
 		 130 aa  55.5  0.0000002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.16985  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2419  globin  33.63 
 
 		 123 aa  54.7  0.0000004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12495  hemoglobin-like oxygen-binding protein glbO  34.74 
 
 		 128 aa  53.9  0.0000007  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.134199 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>