More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dtur_1063 on replicon NC_011661
Organism: Dictyoglomus turgidum DSM 6724



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011661  Dtur_1063  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  100 
 
 
460 aa  914    Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0147  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  45.51 
 
 
474 aa  377  1e-103  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.114503  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1076  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  40.04 
 
 
444 aa  362  6e-99  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.0571583  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2178  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.75 
 
 
445 aa  335  1e-90  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.645104  normal  0.606016 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_13060  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.12 
 
 
485 aa  244  1.9999999999999999e-63  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0718  binding-protein-dependent transporter inner membrane protein  29.68 
 
 
455 aa  220  5e-56  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0314  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  29.37 
 
 
468 aa  218  2e-55  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0911  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  31.66 
 
 
472 aa  209  6e-53  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal  0.99842 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1420  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  29.35 
 
 
471 aa  206  5e-52  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.0657441  normal 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1331  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  31.53 
 
 
463 aa  205  1e-51  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.759845  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1895  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  30.88 
 
 
471 aa  203  4e-51  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0973  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  29.98 
 
 
471 aa  202  9.999999999999999e-51  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.0283497 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0802  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  28.54 
 
 
462 aa  181  2e-44  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.548256  normal  0.2296 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1074  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, permease protein  30.28 
 
 
464 aa  176  7e-43  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2230  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  27.23 
 
 
450 aa  158  2e-37  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.938775  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2390  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.33 
 
 
306 aa  129  8.000000000000001e-29  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1268  ABC-type dipeptide/oligopeptide/nickel transport systems, permease component  26.56 
 
 
279 aa  124  5e-27  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1492  peptide ABC transporter, permease protein  26.14 
 
 
279 aa  122  9.999999999999999e-27  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0758  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.08 
 
 
340 aa  122  9.999999999999999e-27  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1282  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  26.14 
 
 
279 aa  122  9.999999999999999e-27  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1898  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  31.19 
 
 
331 aa  118  1.9999999999999998e-25  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5372  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  29.28 
 
 
279 aa  116  7.999999999999999e-25  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.194033 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_19890  ABC-type dipeptide/oligopeptide/nickel transport system, permease component  28.34 
 
 
289 aa  116  1.0000000000000001e-24  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  hitchhiker  0.00186711  hitchhiker  0.000357505 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1867  ABC-type transport system protein  31.25 
 
 
288 aa  114  3e-24  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2379  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  28.7 
 
 
273 aa  114  3e-24  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.141415  normal 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1170  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.74 
 
 
830 aa  114  4.0000000000000004e-24  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.920623  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0562  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.91 
 
 
840 aa  113  8.000000000000001e-24  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7446  ABC transporter, permease  28.18 
 
 
299 aa  112  1.0000000000000001e-23  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.913354  normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1035  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  27.57 
 
 
276 aa  112  1.0000000000000001e-23  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2198  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.48 
 
 
290 aa  112  1.0000000000000001e-23  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00106936  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4403  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.74 
 
 
311 aa  112  2.0000000000000002e-23  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.292723 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2796  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  30.94 
 
 
299 aa  111  2.0000000000000002e-23  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0480  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  29.6 
 
 
274 aa  111  3e-23  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.534309  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_34910  ABC-type dipeptide/oligopeptide/nickel transport system, permease component  31.39 
 
 
342 aa  111  3e-23  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2578  ABC-type [(GlcNAc)2] transporter, permease protein  26.32 
 
 
341 aa  110  4.0000000000000004e-23  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013924  Nmag_3994  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  30.62 
 
 
325 aa  110  5e-23  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3402  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  30.48 
 
 
311 aa  109  8.000000000000001e-23  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1137  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.33 
 
 
293 aa  108  1e-22  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  unclonable  0.0000000000296229  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03425  hypothetical protein  26.75 
 
 
341 aa  108  1e-22  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2084  ABC transporter, permease  26.91 
 
 
293 aa  108  2e-22  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.395639  normal  0.741475 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0843  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  28.43 
 
 
818 aa  108  2e-22  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  unclonable  0.000000000335755  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1412  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  27.35 
 
 
306 aa  108  2e-22  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1445  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  31.65 
 
 
352 aa  108  2e-22  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.000439393  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1848  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  30 
 
 
318 aa  107  3e-22  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0043  hypothetical protein  29.49 
 
 
269 aa  107  4e-22  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.728589  normal  0.420247 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3318  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  31.98 
 
 
291 aa  107  5e-22  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1436  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  29.73 
 
 
314 aa  107  5e-22  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.289557  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1592  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  29.46 
 
 
280 aa  106  8e-22  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.961775 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1613  oligopeptide ABC transporter, permease protein  27.03 
 
 
319 aa  106  1e-21  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002584  (GlcNAc)2 ABC transporter permease component 2  25.86 
 
 
341 aa  106  1e-21  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1236  binding-protein dependent transport system inner membrane protein  32.44 
 
 
284 aa  105  2e-21  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.143707  normal  0.209567 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2970  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  30.57 
 
 
281 aa  105  2e-21  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0153047  normal  0.258787 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0147  peptide ABC transporter, permease protein  25 
 
 
341 aa  104  3e-21  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_21760  ABC-type dipeptide/oligopeptide/nickel transport system, permease component  30.81 
 
 
310 aa  104  3e-21  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0612673  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_01330  ABC-type dipeptide/oligopeptide/nickel transport system, permease component  30.95 
 
 
311 aa  103  5e-21  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2642  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  28.57 
 
 
280 aa  103  6e-21  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1661  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  31.17 
 
 
360 aa  103  6e-21  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.390668  normal  0.152299 
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4464  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.74 
 
 
330 aa  103  7e-21  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.0131606  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2052  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  29.91 
 
 
280 aa  103  7e-21  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1684  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.6 
 
 
312 aa  103  9e-21  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1803  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.48 
 
 
387 aa  103  9e-21  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0633  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  26.2 
 
 
340 aa  102  1e-20  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.705479 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2032  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  30.77 
 
 
285 aa  102  1e-20  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2013  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  30.36 
 
 
285 aa  102  1e-20  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0104  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  30.36 
 
 
302 aa  102  2e-20  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.217904  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6186  ABC transporter related  30.47 
 
 
590 aa  102  2e-20  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2726  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  25.68 
 
 
303 aa  101  2e-20  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.576006 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0937  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  29.57 
 
 
315 aa  101  2e-20  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4142  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.68 
 
 
311 aa  102  2e-20  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.910518  normal  0.0436133 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0814  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  30.94 
 
 
334 aa  101  2e-20  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3119  IM pore protein  31.65 
 
 
312 aa  102  2e-20  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.141306  normal  0.0623657 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2383  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.48 
 
 
325 aa  102  2e-20  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5359  ABC transporter membrane spanning protein (dipeptide)  32.14 
 
 
289 aa  101  3e-20  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.632265  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2512  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.49 
 
 
363 aa  101  3e-20  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.960083  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1482  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  28.25 
 
 
727 aa  101  3e-20  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2084  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  30.94 
 
 
309 aa  100  4e-20  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5558  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  30.26 
 
 
391 aa  100  4e-20  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.203602  normal  0.0670857 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1761  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  30.94 
 
 
309 aa  100  4e-20  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0937857  normal  0.182989 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2553  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, permease protein  31.88 
 
 
304 aa  100  4e-20  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2256  oligopeptide ABC transporter, permease component  31.88 
 
 
304 aa  100  4e-20  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0843  ABC-type dipeptide/oligopeptide/nickel transport system, permease component  30 
 
 
337 aa  100  4e-20  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.0217859  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1644  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  28.92 
 
 
485 aa  100  5e-20  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.431647  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0130  binding-protein dependent transport system inner membrane protein  28.89 
 
 
306 aa  100  5e-20  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3376  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  30.97 
 
 
396 aa  100  6e-20  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0964452  normal  0.0737316 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2114  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  29.13 
 
 
326 aa  100  6e-20  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.230342  normal  0.0495653 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3080  binding-protein dependent transport system inner membrane protein  27.93 
 
 
283 aa  99.8  8e-20  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.35224  normal 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1930  ABC-type dipeptide/oligopeptide/nickel transport systems, permease component  31.7 
 
 
341 aa  99.8  8e-20  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.0488899  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1414  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.89 
 
 
258 aa  100  8e-20  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.289806  normal  0.295413 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1883  peptide ABC transporter transmembrane protein  31.82 
 
 
311 aa  99.4  1e-19  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.122955  normal  0.508741 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2811  peptide ABC transporter, permease protein  33.63 
 
 
306 aa  99  1e-19  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.167949  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4283  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  29.6 
 
 
292 aa  99.8  1e-19  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.826823  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5669  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  30.67 
 
 
302 aa  99.4  1e-19  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.330271  normal  0.031338 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2237  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  27.43 
 
 
533 aa  98.6  2e-19  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.822439  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1435  peptide ABC transporter, permease protein  29.73 
 
 
282 aa  98.6  2e-19  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.557175  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0898  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  28.25 
 
 
338 aa  98.2  2e-19  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1085  oligopeptide ABC transporter, permease  28.25 
 
 
338 aa  98.2  2e-19  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1236  oligopeptide ABC transporter, permease protein  28.25 
 
 
338 aa  98.6  2e-19  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.519507  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4106  oligopeptide ABC transporter, permease protein  28.25 
 
 
338 aa  99  2e-19  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6294  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  29.6 
 
 
303 aa  98.6  2e-19  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4965  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  30.49 
 
 
309 aa  99  2e-19  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.031791  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>