More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caci_5372 on replicon NC_013131
Organism: Catenulispora acidiphila DSM 44928



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013131  Caci_5372  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  100 
 
 
279 aa  536  1e-151  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.194033 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_19890  ABC-type dipeptide/oligopeptide/nickel transport system, permease component  62.64 
 
 
289 aa  326  2.0000000000000001e-88  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  hitchhiker  0.00186711  hitchhiker  0.000357505 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0633  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  59.57 
 
 
340 aa  306  2.0000000000000002e-82  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.705479 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7446  ABC transporter, permease  56.09 
 
 
299 aa  292  4e-78  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.913354  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2084  ABC transporter, permease  55.31 
 
 
293 aa  291  7e-78  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.395639  normal  0.741475 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3198  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  58.61 
 
 
260 aa  273  3e-72  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  unclonable  0.0000000283157  unclonable  0.000000000020531 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3464  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  56.25 
 
 
293 aa  261  8e-69  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.141846  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1436  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  40.21 
 
 
314 aa  201  8e-51  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.289557  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2796  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  37.32 
 
 
299 aa  198  6e-50  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7556  putative dipeptide ABC transporter (permease protein)  40.07 
 
 
279 aa  191  1e-47  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0843  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  44 
 
 
818 aa  190  2e-47  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  unclonable  0.000000000335755  n/a   
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7183  ABC transporter membrane spanning protein (oligopeptide)  39.1 
 
 
335 aa  190  2.9999999999999997e-47  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.587678  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5656  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  40.6 
 
 
332 aa  187  1e-46  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1592  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  40.88 
 
 
280 aa  187  2e-46  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.961775 
 
 
-
 
NC_002936  DET1492  peptide ABC transporter, permease protein  39.33 
 
 
279 aa  186  3e-46  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1282  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  39.33 
 
 
279 aa  186  3e-46  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1509  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  39.15 
 
 
280 aa  185  7e-46  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.284624  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5359  ABC transporter membrane spanning protein (dipeptide)  42.79 
 
 
289 aa  185  7e-46  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.632265  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1268  ABC-type dipeptide/oligopeptide/nickel transport systems, permease component  37.5 
 
 
279 aa  184  9e-46  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013924  Nmag_3994  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.73 
 
 
325 aa  184  1.0000000000000001e-45  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2012  binding-protein dependent transport system inner membrane protein  39.86 
 
 
276 aa  184  1.0000000000000001e-45  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2970  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.23 
 
 
281 aa  184  2.0000000000000003e-45  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0153047  normal  0.258787 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2573  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  38.18 
 
 
279 aa  184  2.0000000000000003e-45  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.786779  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5669  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  39.05 
 
 
302 aa  183  3e-45  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.330271  normal  0.031338 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2642  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  39.78 
 
 
280 aa  183  3e-45  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0998  oligopeptide ABC transporter, permease protein  38.24 
 
 
283 aa  183  3e-45  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  3.8284200000000003e-62 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0947  oligopeptide ABC transporter, permease protein  37.59 
 
 
283 aa  182  4.0000000000000006e-45  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.177412  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0805  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  38.6 
 
 
283 aa  182  4.0000000000000006e-45  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.789025  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1002  oligopeptide ABC transporter, permease protein  37.59 
 
 
283 aa  182  5.0000000000000004e-45  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0824  oligopeptide ABC transporter, permease  37.59 
 
 
283 aa  182  5.0000000000000004e-45  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0809  oligopeptide ABC transporter, permease  38.6 
 
 
283 aa  182  5.0000000000000004e-45  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2452  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  38.16 
 
 
296 aa  182  6e-45  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0368392  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4384  oligopeptide ABC transporter, permease protein  37.87 
 
 
283 aa  181  9.000000000000001e-45  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  9.52955e-23 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2379  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.88 
 
 
273 aa  181  1e-44  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.141415  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0860  oligopeptide ABC transporter permease  38.24 
 
 
283 aa  181  1e-44  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0910  oligopeptide ABC transporter permease protein  38.24 
 
 
283 aa  181  1e-44  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3080  binding-protein dependent transport system inner membrane protein  36 
 
 
283 aa  181  2e-44  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.35224  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3131  binding-protein dependent transport system inner membrane protein  37.09 
 
 
279 aa  180  2e-44  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.19818 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3840  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  38.33 
 
 
298 aa  179  2.9999999999999997e-44  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  decreased coverage  0.00781305  normal  0.217965 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_4129  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.96 
 
 
312 aa  179  2.9999999999999997e-44  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4252  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  38.32 
 
 
276 aa  179  2.9999999999999997e-44  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.176316  normal  0.343929 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0424  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  40.36 
 
 
281 aa  179  4e-44  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.170759  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4862  putative ABC transporter, permease protein  41.44 
 
 
327 aa  179  4e-44  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.400673  normal  0.659782 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5440  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  41.73 
 
 
310 aa  179  5.999999999999999e-44  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00362913 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2849  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  41.16 
 
 
304 aa  179  5.999999999999999e-44  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0130  binding-protein dependent transport system inner membrane protein  37.45 
 
 
306 aa  178  8e-44  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2390  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  38.04 
 
 
306 aa  178  9e-44  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5233  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  41.18 
 
 
283 aa  177  1e-43  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1867  ABC-type transport system protein  38.41 
 
 
288 aa  177  1e-43  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1190  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  38.35 
 
 
290 aa  178  1e-43  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.287104  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1613  oligopeptide ABC transporter, permease protein  34.16 
 
 
319 aa  177  2e-43  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4329  putative ABC transporter, permease protein  43.86 
 
 
276 aa  177  2e-43  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2198  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  37.68 
 
 
290 aa  177  2e-43  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00106936  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0132  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  42.75 
 
 
300 aa  177  2e-43  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.765267  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4105  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  42.36 
 
 
291 aa  176  4e-43  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4403  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  40.26 
 
 
311 aa  176  4e-43  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.292723 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1253  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.71 
 
 
305 aa  176  4e-43  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.95778  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1150  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  44.26 
 
 
276 aa  176  5e-43  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.155338 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3488  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  41.95 
 
 
279 aa  175  7e-43  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0958  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.7 
 
 
318 aa  175  8e-43  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.643704  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2916  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  43.83 
 
 
276 aa  174  9.999999999999999e-43  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0498468  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6649  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  39.85 
 
 
294 aa  173  1.9999999999999998e-42  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.789298  normal 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3233  ABC peptide transporter, inner membrane subunit  38.35 
 
 
300 aa  174  1.9999999999999998e-42  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0860  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.79 
 
 
287 aa  174  1.9999999999999998e-42  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.000000642732  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1663  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  37.72 
 
 
287 aa  173  1.9999999999999998e-42  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3971  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  38.35 
 
 
300 aa  174  1.9999999999999998e-42  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7646  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  41.22 
 
 
304 aa  173  1.9999999999999998e-42  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5136  putative peptide ABC transporter permease protein, oppC-like protein  44.59 
 
 
288 aa  172  3.9999999999999995e-42  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.0406235 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1443  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  43.2 
 
 
277 aa  172  5e-42  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.486684  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0628  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.36 
 
 
294 aa  172  5e-42  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.881682  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1676  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  37.34 
 
 
494 aa  172  5e-42  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1274  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, permease protein  36.71 
 
 
305 aa  172  5.999999999999999e-42  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.000176481  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3965  hypothetical protein  37.28 
 
 
300 aa  172  5.999999999999999e-42  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.16334 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2052  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  39.64 
 
 
280 aa  172  7.999999999999999e-42  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2549  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.64 
 
 
344 aa  172  7.999999999999999e-42  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2848  ABC transporter permease protein  38.83 
 
 
276 aa  171  7.999999999999999e-42  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1236  binding-protein dependent transport system inner membrane protein  39.78 
 
 
284 aa  171  1e-41  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.143707  normal  0.209567 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1039  binding-protein dependent transport system inner membrane protein  43.81 
 
 
276 aa  171  1e-41  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.336081  normal 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5171  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  42.61 
 
 
311 aa  170  2e-41  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.23044 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2947  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  39.57 
 
 
300 aa  170  2e-41  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.456335  normal  0.0430362 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2763  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  38.58 
 
 
297 aa  171  2e-41  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.405824  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1504  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  38.81 
 
 
289 aa  171  2e-41  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.109416  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4283  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  37.23 
 
 
292 aa  171  2e-41  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.826823  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3739  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  37.5 
 
 
300 aa  171  2e-41  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.146994  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1343  peptide ABC transporter, permease protein, putative  38.43 
 
 
479 aa  170  3e-41  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.736839  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3090  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  41.23 
 
 
310 aa  169  3e-41  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1597  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  37.01 
 
 
287 aa  169  4e-41  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3250  dipeptide ABC transporter, permease protein DppC, putative  38.38 
 
 
301 aa  169  5e-41  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.193894  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2114  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  39.54 
 
 
326 aa  169  5e-41  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.230342  normal  0.0495653 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2013  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  37.55 
 
 
285 aa  169  5e-41  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2756  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  37.14 
 
 
303 aa  169  6e-41  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2032  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  39.63 
 
 
285 aa  169  6e-41  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0391  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.58 
 
 
295 aa  169  6e-41  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1671  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  44.3 
 
 
293 aa  168  8e-41  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3318  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  37.23 
 
 
291 aa  168  9e-41  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4400  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.64 
 
 
299 aa  168  9e-41  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.111328  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0312  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  40.79 
 
 
313 aa  168  1e-40  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3865  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.74 
 
 
307 aa  167  1e-40  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0778  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  40.75 
 
 
300 aa  168  1e-40  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.0620007  normal  0.517219 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4111  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.25 
 
 
299 aa  167  1e-40  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.553979  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>