More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nther_2390 on replicon NC_010718
Organism: Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010718  Nther_2390  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  100 
 
 
306 aa  610  1e-173  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2198  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  67.27 
 
 
290 aa  366  1e-100  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00106936  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1436  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  47.3 
 
 
314 aa  291  1e-77  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.289557  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1412  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  41.92 
 
 
306 aa  259  3e-68  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4403  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  47.84 
 
 
311 aa  259  5.0000000000000005e-68  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.292723 
 
 
-
 
NC_013924  Nmag_3994  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  43.46 
 
 
325 aa  246  4e-64  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0843  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  48.13 
 
 
818 aa  218  1e-55  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  unclonable  0.000000000335755  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7446  ABC transporter, permease  38.41 
 
 
299 aa  202  5e-51  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.913354  normal 
 
 
-
 
NC_002936  DET1492  peptide ABC transporter, permease protein  36.2 
 
 
279 aa  201  9.999999999999999e-51  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1282  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.2 
 
 
279 aa  201  9.999999999999999e-51  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1848  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  39.37 
 
 
318 aa  200  3e-50  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_19890  ABC-type dipeptide/oligopeptide/nickel transport system, permease component  41.06 
 
 
289 aa  199  6e-50  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  hitchhiker  0.00186711  hitchhiker  0.000357505 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1035  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  38.85 
 
 
276 aa  196  5.000000000000001e-49  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1613  oligopeptide ABC transporter, permease protein  36.24 
 
 
319 aa  194  2e-48  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5372  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  38.04 
 
 
279 aa  192  5e-48  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.194033 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2970  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  39.27 
 
 
281 aa  192  7e-48  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0153047  normal  0.258787 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1268  ABC-type dipeptide/oligopeptide/nickel transport systems, permease component  36.84 
 
 
279 aa  192  7e-48  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1867  ABC-type transport system protein  39.86 
 
 
288 aa  192  8e-48  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1592  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  38.99 
 
 
280 aa  188  1e-46  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.961775 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1137  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  38.1 
 
 
293 aa  187  2e-46  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  unclonable  0.0000000000296229  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2084  ABC transporter, permease  38.11 
 
 
293 aa  186  3e-46  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.395639  normal  0.741475 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2642  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  39.35 
 
 
280 aa  185  7e-46  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7556  putative dipeptide ABC transporter (permease protein)  39.85 
 
 
279 aa  184  1.0000000000000001e-45  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1190  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  39.24 
 
 
290 aa  184  2.0000000000000003e-45  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.287104  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2788  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  38.76 
 
 
310 aa  184  2.0000000000000003e-45  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_13060  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  37.67 
 
 
485 aa  183  3e-45  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1002  oligopeptide ABC transporter, permease protein  38.63 
 
 
283 aa  183  4.0000000000000006e-45  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0824  oligopeptide ABC transporter, permease  37.91 
 
 
283 aa  182  5.0000000000000004e-45  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7183  ABC transporter membrane spanning protein (oligopeptide)  37.73 
 
 
335 aa  182  5.0000000000000004e-45  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.587678  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0947  oligopeptide ABC transporter, permease protein  37.91 
 
 
283 aa  182  6e-45  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.177412  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5656  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.69 
 
 
332 aa  182  7e-45  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0805  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  38.63 
 
 
283 aa  182  8.000000000000001e-45  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.789025  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0998  oligopeptide ABC transporter, permease protein  37.55 
 
 
283 aa  182  8.000000000000001e-45  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  3.8284200000000003e-62 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0424  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  37.82 
 
 
281 aa  181  1e-44  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.170759  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0860  oligopeptide ABC transporter permease  37.55 
 
 
283 aa  180  2e-44  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0910  oligopeptide ABC transporter permease protein  37.55 
 
 
283 aa  180  2e-44  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1597  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  41.03 
 
 
287 aa  180  2e-44  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4384  oligopeptide ABC transporter, permease protein  37.55 
 
 
283 aa  180  2.9999999999999997e-44  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  9.52955e-23 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0809  oligopeptide ABC transporter, permease  37.18 
 
 
283 aa  179  4e-44  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2796  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.12 
 
 
299 aa  179  4e-44  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2756  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.27 
 
 
303 aa  179  4e-44  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0481  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  38.91 
 
 
299 aa  179  4.999999999999999e-44  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00209608  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1215  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  39.78 
 
 
278 aa  179  5.999999999999999e-44  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0633  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.46 
 
 
340 aa  179  5.999999999999999e-44  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.705479 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1663  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  40.29 
 
 
287 aa  179  7e-44  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4244  oligopeptide ABC transporter, permease  34.31 
 
 
299 aa  178  9e-44  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4609  oligopeptide ABC transporter, oligopeptide-binding protein  34.42 
 
 
299 aa  178  1e-43  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4391  oligopeptide ABC transporter oligopeptide-binding protein  34.42 
 
 
299 aa  178  1e-43  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4232  oligopeptide transport system, permease  34.42 
 
 
299 aa  178  1e-43  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4731  oligopeptide ABC transporter oligopeptide-binding protein  34.42 
 
 
299 aa  178  1e-43  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2032  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  39.24 
 
 
285 aa  178  1e-43  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2567  putative dipeptide transport system permease protein  39.41 
 
 
274 aa  177  2e-43  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.255906 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2052  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  38.18 
 
 
280 aa  177  2e-43  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5233  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  37.09 
 
 
283 aa  177  3e-43  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0370  nickel ABC transporter, permease subunit NikC  37.04 
 
 
284 aa  176  4e-43  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2594  oligopeptide ABC transporter, permease protein  36.17 
 
 
285 aa  176  6e-43  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1236  binding-protein dependent transport system inner membrane protein  39.64 
 
 
284 aa  176  7e-43  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.143707  normal  0.209567 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0860  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.73 
 
 
287 aa  175  7e-43  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.000000642732  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2403  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.23 
 
 
304 aa  174  9.999999999999999e-43  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.0000000292743  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2763  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  37.36 
 
 
297 aa  174  9.999999999999999e-43  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.405824  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0448  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.36 
 
 
287 aa  174  9.999999999999999e-43  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.144364 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4252  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  37.68 
 
 
276 aa  174  9.999999999999999e-43  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.176316  normal  0.343929 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0621  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.5 
 
 
310 aa  174  1.9999999999999998e-42  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0465132  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1584  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  38.38 
 
 
302 aa  174  1.9999999999999998e-42  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0548  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.5 
 
 
310 aa  174  1.9999999999999998e-42  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1354  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  38.41 
 
 
299 aa  174  1.9999999999999998e-42  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2549  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.77 
 
 
344 aa  174  1.9999999999999998e-42  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2013  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  38.6 
 
 
285 aa  173  2.9999999999999996e-42  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3402  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.61 
 
 
311 aa  173  2.9999999999999996e-42  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0130  binding-protein dependent transport system inner membrane protein  34.55 
 
 
306 aa  172  3.9999999999999995e-42  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0312  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36 
 
 
313 aa  172  5e-42  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5669  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.1 
 
 
302 aa  172  6.999999999999999e-42  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.330271  normal  0.031338 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0011  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.41 
 
 
307 aa  171  1e-41  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2395  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.27 
 
 
334 aa  171  1e-41  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1485  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  37.68 
 
 
274 aa  171  1e-41  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0146821  normal  0.125484 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2947  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.23 
 
 
300 aa  171  1e-41  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.456335  normal  0.0430362 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2573  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.89 
 
 
279 aa  171  2e-41  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.786779  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1253  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.05 
 
 
305 aa  171  2e-41  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.95778  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3080  binding-protein dependent transport system inner membrane protein  36.36 
 
 
283 aa  171  2e-41  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.35224  normal 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1074  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, permease protein  32.38 
 
 
464 aa  170  3e-41  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_4129  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.73 
 
 
312 aa  170  3e-41  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2422  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  38.34 
 
 
311 aa  170  3e-41  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1331  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  39.46 
 
 
463 aa  169  4e-41  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.759845  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3318  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.5 
 
 
291 aa  169  5e-41  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3464  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  40.69 
 
 
293 aa  169  6e-41  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.141846  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1395  ABC peptide transporter, inner membrane subunit  38.6 
 
 
288 aa  169  7e-41  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.064701  decreased coverage  0.00784209 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3198  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  39.26 
 
 
260 aa  169  7e-41  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  unclonable  0.0000000283157  unclonable  0.000000000020531 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2553  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, permease protein  33.69 
 
 
304 aa  169  7e-41  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2256  oligopeptide ABC transporter, permease component  33.69 
 
 
304 aa  169  7e-41  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3233  ABC peptide transporter, inner membrane subunit  34.11 
 
 
300 aa  168  9e-41  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3971  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.11 
 
 
300 aa  168  9e-41  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1669  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  37.1 
 
 
300 aa  168  9e-41  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.830597 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2745  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35 
 
 
313 aa  167  1e-40  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3131  binding-protein dependent transport system inner membrane protein  34.89 
 
 
279 aa  168  1e-40  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.19818 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2642  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.66 
 
 
310 aa  167  1e-40  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1435  peptide ABC transporter, permease protein  38.98 
 
 
282 aa  167  2e-40  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.557175  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0314  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.49 
 
 
468 aa  167  2e-40  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3840  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  37.09 
 
 
298 aa  167  2e-40  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  decreased coverage  0.00781305  normal  0.217965 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0613  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.88 
 
 
280 aa  167  2e-40  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0911  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  39.19 
 
 
472 aa  167  2e-40  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal  0.99842 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>