More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mthe_1035 on replicon NC_008553
Organism: Methanosaeta thermophila PT



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008553  Mthe_1035  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  100 
 
 
276 aa  548  1e-155  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1613  oligopeptide ABC transporter, permease protein  55.81 
 
 
319 aa  304  1.0000000000000001e-81  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002936  DET1492  peptide ABC transporter, permease protein  49.41 
 
 
279 aa  265  8e-70  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1282  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  49.41 
 
 
279 aa  265  8e-70  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1268  ABC-type dipeptide/oligopeptide/nickel transport systems, permease component  47.55 
 
 
279 aa  263  2e-69  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0043  hypothetical protein  48.25 
 
 
269 aa  239  4e-62  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.728589  normal  0.420247 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0237  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  45.24 
 
 
279 aa  231  1e-59  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0964586  normal  0.518429 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2198  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  44.11 
 
 
290 aa  198  7.999999999999999e-50  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00106936  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2395  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  38.69 
 
 
334 aa  192  7e-48  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013924  Nmag_3994  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  39.54 
 
 
325 aa  189  5e-47  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1436  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  41.7 
 
 
314 aa  188  7e-47  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.289557  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2390  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  38.85 
 
 
306 aa  186  4e-46  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2075  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  39.43 
 
 
344 aa  185  9e-46  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5233  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  44.02 
 
 
283 aa  183  3e-45  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2578  ABC-type [(GlcNAc)2] transporter, permease protein  36.3 
 
 
341 aa  181  8.000000000000001e-45  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0480  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.97 
 
 
274 aa  179  4e-44  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.534309  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0424  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  43.16 
 
 
281 aa  179  4.999999999999999e-44  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.170759  normal 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7183  ABC transporter membrane spanning protein (oligopeptide)  39.25 
 
 
335 aa  178  9e-44  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.587678  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0147  peptide ABC transporter, permease protein  36.62 
 
 
341 aa  178  9e-44  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1400  ABC transporter related  40.17 
 
 
638 aa  177  1e-43  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.785888  normal  0.726008 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002584  (GlcNAc)2 ABC transporter permease component 2  38.08 
 
 
341 aa  176  3e-43  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7556  putative dipeptide ABC transporter (permease protein)  39.35 
 
 
279 aa  176  4e-43  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03425  hypothetical protein  36.97 
 
 
341 aa  174  1.9999999999999998e-42  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2549  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  41.2 
 
 
344 aa  174  1.9999999999999998e-42  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5656  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  37.59 
 
 
332 aa  173  2.9999999999999996e-42  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1253  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.11 
 
 
305 aa  172  5e-42  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.95778  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4252  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  39.31 
 
 
276 aa  172  7.999999999999999e-42  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.176316  normal  0.343929 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1412  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  37.69 
 
 
306 aa  171  9e-42  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7446  ABC transporter, permease  36.36 
 
 
299 aa  171  1e-41  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.913354  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2379  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  37.16 
 
 
273 aa  171  1e-41  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.141415  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2013  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  37.89 
 
 
285 aa  170  2e-41  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0928  oligopeptide ABC transporter, permease protein  38.75 
 
 
274 aa  169  4e-41  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  decreased coverage  0.00180433  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1002  oligopeptide ABC transporter, permease protein  38.04 
 
 
283 aa  169  5e-41  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1592  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  39.61 
 
 
280 aa  168  7e-41  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.961775 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1485  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  39.84 
 
 
274 aa  168  9e-41  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0146821  normal  0.125484 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2947  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  39.45 
 
 
300 aa  167  1e-40  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.456335  normal  0.0430362 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0860  oligopeptide ABC transporter permease  37.25 
 
 
283 aa  167  1e-40  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0824  oligopeptide ABC transporter, permease  37.25 
 
 
283 aa  168  1e-40  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0947  oligopeptide ABC transporter, permease protein  37.25 
 
 
283 aa  167  1e-40  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.177412  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0805  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  37.64 
 
 
283 aa  168  1e-40  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.789025  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0910  oligopeptide ABC transporter permease protein  37.25 
 
 
283 aa  167  1e-40  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1482  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  37.01 
 
 
727 aa  167  1e-40  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2642  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  38.82 
 
 
280 aa  167  1e-40  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4384  oligopeptide ABC transporter, permease protein  37.25 
 
 
283 aa  168  1e-40  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  9.52955e-23 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2084  ABC transporter, permease  40.64 
 
 
293 aa  167  1e-40  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.395639  normal  0.741475 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0809  oligopeptide ABC transporter, permease  37.25 
 
 
283 aa  167  2e-40  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3131  binding-protein dependent transport system inner membrane protein  36.33 
 
 
279 aa  167  2e-40  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.19818 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4292  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.86 
 
 
301 aa  166  2.9999999999999998e-40  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2032  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  40.17 
 
 
285 aa  166  5e-40  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0998  oligopeptide ABC transporter, permease protein  36.86 
 
 
283 aa  165  6.9999999999999995e-40  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  3.8284200000000003e-62 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2422  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  39.11 
 
 
311 aa  165  9e-40  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5669  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.69 
 
 
302 aa  164  1.0000000000000001e-39  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.330271  normal  0.031338 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0547  peptide ABC transporter, protein inner membrane binding component  37.18 
 
 
327 aa  164  1.0000000000000001e-39  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0218475  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1435  peptide ABC transporter, permease protein  40 
 
 
282 aa  163  2.0000000000000002e-39  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.557175  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_19890  ABC-type dipeptide/oligopeptide/nickel transport system, permease component  38.57 
 
 
289 aa  163  2.0000000000000002e-39  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  hitchhiker  0.00186711  hitchhiker  0.000357505 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1867  ABC-type transport system protein  36.51 
 
 
288 aa  163  4.0000000000000004e-39  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2726  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.14 
 
 
303 aa  162  4.0000000000000004e-39  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.576006 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4862  putative ABC transporter, permease protein  38.21 
 
 
327 aa  162  4.0000000000000004e-39  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.400673  normal  0.659782 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1898  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.86 
 
 
331 aa  163  4.0000000000000004e-39  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2849  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  40.54 
 
 
304 aa  162  6e-39  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1509  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  38.04 
 
 
280 aa  161  9e-39  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.284624  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1183  putative permease of ABC transporter  40.4 
 
 
301 aa  161  1e-38  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.056047  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2573  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.94 
 
 
279 aa  161  1e-38  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.786779  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_34910  ABC-type dipeptide/oligopeptide/nickel transport system, permease component  35.74 
 
 
342 aa  160  2e-38  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3402  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  37.11 
 
 
311 aa  160  2e-38  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2788  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  37.6 
 
 
310 aa  160  2e-38  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0130  binding-protein dependent transport system inner membrane protein  35.27 
 
 
306 aa  160  2e-38  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_4129  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  38.49 
 
 
312 aa  160  2e-38  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2970  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.37 
 
 
281 aa  160  2e-38  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0153047  normal  0.258787 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_13060  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  38.32 
 
 
485 aa  160  2e-38  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3114  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  39.82 
 
 
302 aa  160  2e-38  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.171582  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3219  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  39 
 
 
279 aa  160  3e-38  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.511198  normal 
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3239  hypothetical protein  36.26 
 
 
263 aa  159  3e-38  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.137179  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2567  putative dipeptide transport system permease protein  38.28 
 
 
274 aa  159  3e-38  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.255906 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5372  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.9 
 
 
279 aa  159  4e-38  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.194033 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0330  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  40.67 
 
 
296 aa  159  4e-38  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0816987  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_20160  ABC-type dipeptide/oligopeptide/nickel transport system, ATPase component  36.47 
 
 
621 aa  159  4e-38  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.533008  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3198  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  39.21 
 
 
260 aa  159  5e-38  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  unclonable  0.0000000283157  unclonable  0.000000000020531 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0385  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  39.73 
 
 
343 aa  159  5e-38  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.519425 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0312  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  39.06 
 
 
313 aa  159  5e-38  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4597  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  39.73 
 
 
344 aa  159  6e-38  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0732  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.18 
 
 
258 aa  159  6e-38  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1597  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.71 
 
 
282 aa  158  9e-38  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.951442  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2756  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  37.92 
 
 
303 aa  158  9e-38  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_21760  ABC-type dipeptide/oligopeptide/nickel transport system, permease component  33.7 
 
 
310 aa  158  9e-38  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0612673  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1547  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.11 
 
 
285 aa  158  1e-37  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.107676  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2052  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  37.55 
 
 
280 aa  157  2e-37  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2796  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.25 
 
 
299 aa  157  2e-37  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3080  binding-protein dependent transport system inner membrane protein  35.27 
 
 
283 aa  157  2e-37  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.35224  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3133  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  38.58 
 
 
283 aa  157  2e-37  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1649  binding-protein dependent transport system inner membrane protein  38.62 
 
 
279 aa  156  3e-37  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.857985  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3464  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  38.39 
 
 
293 aa  156  3e-37  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.141846  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1236  binding-protein dependent transport system inner membrane protein  38.53 
 
 
284 aa  156  4e-37  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.143707  normal  0.209567 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2594  oligopeptide ABC transporter, permease protein  37.3 
 
 
285 aa  155  6e-37  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2553  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, permease protein  37.76 
 
 
304 aa  155  6e-37  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2256  oligopeptide ABC transporter, permease component  37.76 
 
 
304 aa  155  6e-37  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0207  oligopeptide ABC transporter, permease  37.36 
 
 
307 aa  155  9e-37  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6686  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  38.67 
 
 
292 aa  154  1e-36  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.340693  normal  0.469526 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5078  oligopeptide ABC transporter, permease protein  37.36 
 
 
306 aa  154  1e-36  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0247  oligopeptide ABC transporter, permease protein  37.36 
 
 
306 aa  154  1e-36  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0546254  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>