More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mesil_3239 on replicon NC_014213
Organism: Meiothermus silvanus DSM 9946



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014213  Mesil_3239  hypothetical protein  100 
 
 
263 aa  500  1e-140  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.137179  normal 
 
 
-
 
NC_002936  DET1492  peptide ABC transporter, permease protein  46.35 
 
 
279 aa  194  2e-48  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1282  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  46.35 
 
 
279 aa  194  2e-48  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1268  ABC-type dipeptide/oligopeptide/nickel transport systems, permease component  44.83 
 
 
279 aa  192  6e-48  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1035  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.26 
 
 
276 aa  159  3e-38  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0928  oligopeptide ABC transporter, permease protein  40.38 
 
 
274 aa  156  3e-37  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  decreased coverage  0.00180433  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3464  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  40.5 
 
 
293 aa  153  2.9999999999999998e-36  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.141846  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1613  oligopeptide ABC transporter, permease protein  35.69 
 
 
319 aa  152  5.9999999999999996e-36  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2796  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  37.55 
 
 
299 aa  152  7e-36  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0858  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.8 
 
 
277 aa  147  1.0000000000000001e-34  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0330  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  40.53 
 
 
296 aa  145  6e-34  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0816987  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0237  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.24 
 
 
279 aa  145  9e-34  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0964586  normal  0.518429 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0043  hypothetical protein  38.07 
 
 
269 aa  144  2e-33  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.728589  normal  0.420247 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3569  dipeptide ABC transporter, permease  35.9 
 
 
257 aa  143  3e-33  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.0377777 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0312  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  41.67 
 
 
313 aa  142  4e-33  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7446  ABC transporter, permease  37.55 
 
 
299 aa  142  7e-33  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.913354  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1867  ABC-type transport system protein  38.53 
 
 
288 aa  138  1e-31  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1253  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.5 
 
 
305 aa  137  1e-31  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.95778  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2947  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  39.47 
 
 
300 aa  135  8e-31  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.456335  normal  0.0430362 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_19890  ABC-type dipeptide/oligopeptide/nickel transport system, permease component  40.87 
 
 
289 aa  134  9.999999999999999e-31  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  hitchhiker  0.00186711  hitchhiker  0.000357505 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3198  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  39.27 
 
 
260 aa  133  3.9999999999999996e-30  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  unclonable  0.0000000283157  unclonable  0.000000000020531 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2530  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  41.63 
 
 
286 aa  132  5e-30  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4283  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.77 
 
 
292 aa  132  6.999999999999999e-30  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.826823  normal 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2075  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.05 
 
 
344 aa  131  9e-30  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5372  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.68 
 
 
279 aa  131  1.0000000000000001e-29  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.194033 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0374  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  37.39 
 
 
300 aa  130  2.0000000000000002e-29  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.284254  normal  0.579699 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1216  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  37.39 
 
 
279 aa  130  2.0000000000000002e-29  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1274  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, permease protein  33.48 
 
 
305 aa  130  3e-29  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.000176481  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3861  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  40.87 
 
 
359 aa  130  3e-29  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.61209  hitchhiker  0.00385009 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0921  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  38.96 
 
 
284 aa  129  4.0000000000000003e-29  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.399737 
 
 
-
 
NC_013924  Nmag_3994  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.05 
 
 
325 aa  129  5.0000000000000004e-29  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0927  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  40.77 
 
 
284 aa  129  7.000000000000001e-29  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.0968091  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0132  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  39.06 
 
 
300 aa  128  9.000000000000001e-29  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.765267  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4862  putative ABC transporter, permease protein  36.71 
 
 
327 aa  128  1.0000000000000001e-28  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.400673  normal  0.659782 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0345  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.95 
 
 
287 aa  127  1.0000000000000001e-28  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0932  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  37.39 
 
 
279 aa  128  1.0000000000000001e-28  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.927066  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2403  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.81 
 
 
304 aa  128  1.0000000000000001e-28  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.0000000292743  normal 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1340  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.19 
 
 
469 aa  127  2.0000000000000002e-28  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4391  oligopeptide ABC transporter oligopeptide-binding protein  34.06 
 
 
299 aa  127  2.0000000000000002e-28  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4232  oligopeptide transport system, permease  34.06 
 
 
299 aa  127  2.0000000000000002e-28  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4244  oligopeptide ABC transporter, permease  34.06 
 
 
299 aa  127  2.0000000000000002e-28  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1436  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.06 
 
 
314 aa  127  2.0000000000000002e-28  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.289557  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4731  oligopeptide ABC transporter oligopeptide-binding protein  34.06 
 
 
299 aa  127  2.0000000000000002e-28  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0144  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  37.66 
 
 
298 aa  127  2.0000000000000002e-28  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0407535  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2422  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.84 
 
 
311 aa  127  2.0000000000000002e-28  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4609  oligopeptide ABC transporter, oligopeptide-binding protein  34.06 
 
 
299 aa  127  2.0000000000000002e-28  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0718  hypothetical protein  34.78 
 
 
282 aa  127  2.0000000000000002e-28  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal  0.661918 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1236  binding-protein dependent transport system inner membrane protein  34.71 
 
 
284 aa  126  3e-28  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.143707  normal  0.209567 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0890  glutathione ABC transporter, permease protein GsiD  34.62 
 
 
303 aa  126  4.0000000000000003e-28  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.221253  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4292  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.04 
 
 
301 aa  125  6e-28  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1592  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.96 
 
 
280 aa  125  7e-28  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.961775 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1766  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.75 
 
 
468 aa  125  8.000000000000001e-28  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0164204  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1435  peptide ABC transporter, permease protein  35.81 
 
 
282 aa  125  9e-28  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.557175  n/a   
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7183  ABC transporter membrane spanning protein (oligopeptide)  34.76 
 
 
335 aa  125  9e-28  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.587678  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3326  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  37.83 
 
 
279 aa  125  9e-28  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.862949  normal  0.0950252 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4111  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.8 
 
 
299 aa  125  1e-27  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.553979  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2812  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.19 
 
 
303 aa  124  1e-27  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0951  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.36 
 
 
275 aa  124  1e-27  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.24114  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4400  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.8 
 
 
299 aa  125  1e-27  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.111328  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2013  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.04 
 
 
285 aa  125  1e-27  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00799  predicted peptide transporter subunit: membrane component of ABC superfamily  34.19 
 
 
303 aa  123  2e-27  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2810  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.19 
 
 
303 aa  123  2e-27  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.482593  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00816  hypothetical protein  34.19 
 
 
303 aa  123  2e-27  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0805  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.87 
 
 
283 aa  124  2e-27  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.789025  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0805  ABC dipeptide transporter, inner membrane subunit DppC  36.52 
 
 
300 aa  123  2e-27  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2463  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.52 
 
 
300 aa  123  2e-27  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.342595  normal  0.319214 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0903  glutathione ABC transporter, permease protein GsiD  34.19 
 
 
303 aa  124  2e-27  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0857  glutathione ABC transporter, permease protein GsiD  34.19 
 
 
303 aa  124  2e-27  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0713  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.96 
 
 
330 aa  124  2e-27  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.409479  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2516  glutathione ABC transporter, permease protein GsiD  34.19 
 
 
303 aa  124  2e-27  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.245881  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0983  glutathione ABC transporter, permease protein GsiD  34.19 
 
 
303 aa  124  2e-27  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.631876 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1002  oligopeptide ABC transporter, permease protein  34.02 
 
 
283 aa  123  3e-27  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0947  oligopeptide ABC transporter, permease protein  34.02 
 
 
283 aa  123  3e-27  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.177412  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2379  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  31.58 
 
 
273 aa  123  3e-27  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.141415  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0385  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.51 
 
 
343 aa  123  3e-27  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.519425 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0860  oligopeptide ABC transporter permease  33.99 
 
 
283 aa  123  4e-27  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0824  oligopeptide ABC transporter, permease  34.02 
 
 
283 aa  123  4e-27  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0809  oligopeptide ABC transporter, permease  33.99 
 
 
283 aa  122  4e-27  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0424  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  38.39 
 
 
296 aa  122  4e-27  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.271529  normal  0.0400541 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0910  oligopeptide ABC transporter permease protein  33.99 
 
 
283 aa  123  4e-27  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0897  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.77 
 
 
303 aa  123  4e-27  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3991  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.09 
 
 
300 aa  123  4e-27  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.368526  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4384  oligopeptide ABC transporter, permease protein  34.02 
 
 
283 aa  123  4e-27  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  9.52955e-23 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4597  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.1 
 
 
344 aa  122  4e-27  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0481  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.81 
 
 
299 aa  122  5e-27  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00209608  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2660  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  37.72 
 
 
294 aa  122  5e-27  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00097283 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2642  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.96 
 
 
280 aa  122  6e-27  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1597  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.19 
 
 
287 aa  122  6e-27  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3435  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.64 
 
 
271 aa  122  6e-27  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.58374  normal  0.490957 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3674  oligopeptide ABC transporter, permease  34.93 
 
 
279 aa  122  7e-27  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.0467802 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3090  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.34 
 
 
310 aa  122  7e-27  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7556  putative dipeptide ABC transporter (permease protein)  34.21 
 
 
279 aa  122  7e-27  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5656  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.47 
 
 
332 aa  122  7e-27  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2594  oligopeptide ABC transporter, permease protein  36.36 
 
 
285 aa  122  8e-27  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3105  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.73 
 
 
307 aa  122  8e-27  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5669  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.62 
 
 
302 aa  122  8e-27  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.330271  normal  0.031338 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0391  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.33 
 
 
295 aa  122  8e-27  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0633  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.29 
 
 
340 aa  121  9e-27  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.705479 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2084  ABC transporter, permease  32.1 
 
 
293 aa  121  9e-27  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.395639  normal  0.741475 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5440  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.53 
 
 
310 aa  121  9.999999999999999e-27  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00362913 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>