More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mbar_A3569 on replicon NC_007355
Organism: Methanosarcina barkeri str. Fusaro



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007355  Mbar_A3569  dipeptide ABC transporter, permease  100 
 
 
257 aa  516  1.0000000000000001e-145  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.0377777 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0330  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  57.37 
 
 
296 aa  277  1e-73  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0816987  normal 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2631  peptide ABC transporter, permease protein, putative  42.54 
 
 
274 aa  202  3e-51  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.281475  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0928  oligopeptide ABC transporter, permease protein  42.41 
 
 
274 aa  196  3e-49  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  decreased coverage  0.00180433  normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0858  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  40.87 
 
 
277 aa  195  8.000000000000001e-49  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013924  Nmag_3994  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  39.92 
 
 
325 aa  194  1e-48  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1268  ABC-type dipeptide/oligopeptide/nickel transport systems, permease component  40.16 
 
 
279 aa  193  3e-48  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1492  peptide ABC transporter, permease protein  39.76 
 
 
279 aa  191  1e-47  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1282  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  39.76 
 
 
279 aa  191  1e-47  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0345  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  39.68 
 
 
287 aa  181  1e-44  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1436  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  38.17 
 
 
314 aa  178  9e-44  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.289557  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2947  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  39.13 
 
 
300 aa  178  9e-44  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.456335  normal  0.0430362 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1613  oligopeptide ABC transporter, permease protein  38.52 
 
 
319 aa  176  3e-43  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3674  oligopeptide ABC transporter, permease  40.78 
 
 
279 aa  170  3e-41  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.0467802 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2796  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.61 
 
 
299 aa  169  3e-41  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2578  ABC-type [(GlcNAc)2] transporter, permease protein  32.75 
 
 
341 aa  169  4e-41  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0147  peptide ABC transporter, permease protein  32.99 
 
 
341 aa  168  6e-41  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2379  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.9 
 
 
273 aa  168  8e-41  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.141415  normal 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0718  hypothetical protein  39.61 
 
 
282 aa  168  9e-41  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal  0.661918 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1282  oligopeptide ABC transporter, permease protein  39.29 
 
 
300 aa  167  1e-40  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.284613  normal 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1253  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  38.93 
 
 
305 aa  168  1e-40  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.95778  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0911  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  40.81 
 
 
472 aa  167  2e-40  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal  0.99842 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0843  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  40.79 
 
 
818 aa  166  4e-40  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  unclonable  0.000000000335755  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_01330  ABC-type dipeptide/oligopeptide/nickel transport system, permease component  37.45 
 
 
311 aa  165  5e-40  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002584  (GlcNAc)2 ABC transporter permease component 2  33.45 
 
 
341 aa  165  6.9999999999999995e-40  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1420  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  40.36 
 
 
471 aa  164  1.0000000000000001e-39  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.0657441  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4391  oligopeptide ABC transporter oligopeptide-binding protein  39.37 
 
 
299 aa  164  2.0000000000000002e-39  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4232  oligopeptide transport system, permease  39.37 
 
 
299 aa  164  2.0000000000000002e-39  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4244  oligopeptide ABC transporter, permease  39.37 
 
 
299 aa  164  2.0000000000000002e-39  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4731  oligopeptide ABC transporter oligopeptide-binding protein  39.37 
 
 
299 aa  164  2.0000000000000002e-39  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4609  oligopeptide ABC transporter, oligopeptide-binding protein  39.37 
 
 
299 aa  164  2.0000000000000002e-39  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7446  ABC transporter, permease  36.71 
 
 
299 aa  163  3e-39  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.913354  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03425  hypothetical protein  33.33 
 
 
341 aa  162  5.0000000000000005e-39  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2198  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  37.31 
 
 
290 aa  162  5.0000000000000005e-39  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00106936  normal 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0043  hypothetical protein  38.49 
 
 
269 aa  162  6e-39  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.728589  normal  0.420247 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1400  ABC transporter related  36.78 
 
 
638 aa  160  2e-38  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.785888  normal  0.726008 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1190  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.55 
 
 
290 aa  160  2e-38  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.287104  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2032  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.8 
 
 
285 aa  159  3e-38  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2788  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.82 
 
 
310 aa  159  4e-38  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_13060  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  38.5 
 
 
485 aa  158  7e-38  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1035  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  38.31 
 
 
276 aa  158  9e-38  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0860  oligopeptide ABC transporter permease  34.52 
 
 
283 aa  157  1e-37  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0910  oligopeptide ABC transporter permease protein  34.52 
 
 
283 aa  157  1e-37  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5372  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.02 
 
 
279 aa  158  1e-37  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.194033 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0824  oligopeptide ABC transporter, permease  34.52 
 
 
283 aa  157  2e-37  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0809  oligopeptide ABC transporter, permease  34.52 
 
 
283 aa  157  2e-37  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4384  oligopeptide ABC transporter, permease protein  34.52 
 
 
283 aa  157  2e-37  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  9.52955e-23 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2075  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.12 
 
 
344 aa  157  2e-37  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6686  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.76 
 
 
292 aa  157  2e-37  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.340693  normal  0.469526 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0947  oligopeptide ABC transporter, permease protein  34.52 
 
 
283 aa  157  2e-37  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.177412  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_19890  ABC-type dipeptide/oligopeptide/nickel transport system, permease component  35.74 
 
 
289 aa  156  3e-37  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  hitchhiker  0.00186711  hitchhiker  0.000357505 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1002  oligopeptide ABC transporter, permease protein  34.13 
 
 
283 aa  156  3e-37  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0805  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.15 
 
 
283 aa  156  4e-37  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.789025  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1412  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.97 
 
 
306 aa  155  4e-37  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3840  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.9 
 
 
298 aa  155  5.0000000000000005e-37  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  decreased coverage  0.00781305  normal  0.217965 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0998  oligopeptide ABC transporter, permease protein  34.13 
 
 
283 aa  155  8e-37  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  3.8284200000000003e-62 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1663  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.92 
 
 
287 aa  154  1e-36  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3739  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  37.15 
 
 
300 aa  154  1e-36  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.146994  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1597  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.92 
 
 
287 aa  154  1e-36  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2030  ABC transporter, permease protein  41.82 
 
 
300 aa  154  2e-36  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0884139  normal  0.749678 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0547  peptide ABC transporter, protein inner membrane binding component  36.11 
 
 
327 aa  153  2e-36  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0218475  normal 
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3239  hypothetical protein  38.1 
 
 
263 aa  153  2.9999999999999998e-36  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.137179  normal 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1895  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  41.7 
 
 
471 aa  153  2.9999999999999998e-36  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2594  oligopeptide ABC transporter, permease protein  36.86 
 
 
285 aa  152  4e-36  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6557  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  39.91 
 
 
277 aa  152  4e-36  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.116936  normal  0.325454 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6186  ABC transporter related  35.04 
 
 
590 aa  152  4e-36  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3198  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.17 
 
 
260 aa  152  5e-36  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  unclonable  0.0000000283157  unclonable  0.000000000020531 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5782  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.69 
 
 
292 aa  152  5.9999999999999996e-36  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.10252 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1216  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.61 
 
 
279 aa  152  7e-36  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0132  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.72 
 
 
300 aa  152  7e-36  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.765267  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1485  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  39.5 
 
 
274 aa  152  7e-36  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0146821  normal  0.125484 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3090  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.2 
 
 
310 aa  151  1e-35  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3402  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.36 
 
 
311 aa  151  1e-35  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_34910  ABC-type dipeptide/oligopeptide/nickel transport system, permease component  35.55 
 
 
342 aa  151  1e-35  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_4129  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.92 
 
 
312 aa  151  1e-35  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0921  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.8 
 
 
284 aa  149  3e-35  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.399737 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2052  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.32 
 
 
280 aa  149  3e-35  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1236  binding-protein dependent transport system inner membrane protein  35.71 
 
 
284 aa  149  4e-35  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.143707  normal  0.209567 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2922  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.22 
 
 
285 aa  149  5e-35  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1592  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.51 
 
 
280 aa  149  5e-35  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.961775 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2395  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.21 
 
 
334 aa  149  5e-35  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5507  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.94 
 
 
285 aa  149  6e-35  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.389941 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1435  peptide ABC transporter, permease protein  34.9 
 
 
282 aa  148  8e-35  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.557175  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2390  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.59 
 
 
306 aa  148  8e-35  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0860  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.86 
 
 
287 aa  148  9e-35  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.000000642732  n/a   
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6142  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  38.68 
 
 
274 aa  148  1.0000000000000001e-34  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.266947  normal  0.0172479 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0036  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  38.82 
 
 
305 aa  147  1.0000000000000001e-34  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0186771  normal  0.317689 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1848  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.27 
 
 
318 aa  147  1.0000000000000001e-34  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5670  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.09 
 
 
300 aa  147  2.0000000000000003e-34  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004311  BRA1093  peptide ABC transporter, permease protein, putative  37.45 
 
 
296 aa  147  2.0000000000000003e-34  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1621  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  38.4 
 
 
291 aa  147  2.0000000000000003e-34  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.00767174  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0237  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  37.05 
 
 
279 aa  146  2.0000000000000003e-34  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0964586  normal  0.518429 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2756  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.08 
 
 
303 aa  147  2.0000000000000003e-34  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1395  ABC peptide transporter, inner membrane subunit  36.29 
 
 
288 aa  147  2.0000000000000003e-34  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.064701  decreased coverage  0.00784209 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0480  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.54 
 
 
274 aa  147  2.0000000000000003e-34  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.534309  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1250  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  40 
 
 
301 aa  147  2.0000000000000003e-34  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.70134 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_20160  ABC-type dipeptide/oligopeptide/nickel transport system, ATPase component  36.29 
 
 
621 aa  147  2.0000000000000003e-34  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.533008  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0718  binding-protein-dependent transporter inner membrane protein  37.5 
 
 
455 aa  146  2.0000000000000003e-34  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5440  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.11 
 
 
310 aa  147  2.0000000000000003e-34  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00362913 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2704  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  37.55 
 
 
301 aa  146  3e-34  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>