More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rleg_6686 on replicon NC_012858
Organism: Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012858  Rleg_6686  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  100 
 
 
292 aa  580  1e-164  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.340693  normal  0.469526 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5782  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  97.26 
 
 
292 aa  520  1e-146  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.10252 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2743  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  63.93 
 
 
302 aa  341  8e-93  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.418739  normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0147  peptide ABC transporter, permease protein  51.26 
 
 
341 aa  340  1e-92  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2578  ABC-type [(GlcNAc)2] transporter, permease protein  50.64 
 
 
341 aa  329  3e-89  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002584  (GlcNAc)2 ABC transporter permease component 2  51.26 
 
 
341 aa  328  9e-89  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03425  hypothetical protein  51.13 
 
 
341 aa  325  4.0000000000000003e-88  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5670  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  53 
 
 
300 aa  325  6e-88  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0547  peptide ABC transporter, protein inner membrane binding component  49.47 
 
 
327 aa  281  1e-74  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0218475  normal 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2075  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  50.92 
 
 
344 aa  273  2.0000000000000002e-72  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1482  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  44.21 
 
 
727 aa  252  6e-66  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0173  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  46.67 
 
 
309 aa  240  2e-62  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.383419  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0480  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  44.57 
 
 
274 aa  236  3e-61  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.534309  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2515  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  41.34 
 
 
331 aa  236  5.0000000000000005e-61  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0878076  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2621  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  43.17 
 
 
320 aa  231  1e-59  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1400  ABC transporter related  42.35 
 
 
638 aa  230  3e-59  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.785888  normal  0.726008 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1681  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  42.11 
 
 
358 aa  229  3e-59  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.471831  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1898  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  40 
 
 
331 aa  226  3e-58  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2395  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  39.93 
 
 
334 aa  224  1e-57  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3402  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  44.07 
 
 
311 aa  223  4e-57  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0929  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  42.09 
 
 
350 aa  220  1.9999999999999999e-56  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_20160  ABC-type dipeptide/oligopeptide/nickel transport system, ATPase component  44.61 
 
 
621 aa  219  3.9999999999999997e-56  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.533008  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_01330  ABC-type dipeptide/oligopeptide/nickel transport system, permease component  42.22 
 
 
311 aa  217  2e-55  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6186  ABC transporter related  44.94 
 
 
590 aa  217  2e-55  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1180  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  41.09 
 
 
336 aa  216  2.9999999999999998e-55  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0040  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  43.01 
 
 
320 aa  213  3.9999999999999995e-54  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_06410  ABC-type dipeptide/oligopeptide/nickel transport system, permease component  40.36 
 
 
320 aa  208  1e-52  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.138967  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_34910  ABC-type dipeptide/oligopeptide/nickel transport system, permease component  39.27 
 
 
342 aa  207  1e-52  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1597  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  38.38 
 
 
282 aa  204  2e-51  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.951442  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1547  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  38.01 
 
 
285 aa  203  3e-51  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.107676  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2726  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  42.35 
 
 
303 aa  203  3e-51  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.576006 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1555  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  40 
 
 
280 aa  202  6e-51  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.0590918  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0400  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  43.96 
 
 
348 aa  195  1e-48  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1613  oligopeptide ABC transporter, permease protein  39.39 
 
 
319 aa  190  2e-47  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002936  DET1492  peptide ABC transporter, permease protein  36.63 
 
 
279 aa  189  4e-47  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0912  ABC-type dipeptide/oligopeptide/nickel transport systems, permease components  36.06 
 
 
304 aa  189  4e-47  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1282  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.63 
 
 
279 aa  189  4e-47  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1268  ABC-type dipeptide/oligopeptide/nickel transport systems, permease component  37 
 
 
279 aa  186  4e-46  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3655  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.94 
 
 
302 aa  186  5e-46  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2379  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.29 
 
 
273 aa  183  2.0000000000000003e-45  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.141415  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7458  peptide ABC transporter, permease protein  39.86 
 
 
281 aa  183  3e-45  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.48372 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0490  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.13 
 
 
277 aa  181  1e-44  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5372  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  39.11 
 
 
279 aa  174  1.9999999999999998e-42  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.194033 
 
 
-
 
NC_013924  Nmag_3994  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36 
 
 
325 aa  172  5e-42  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0043  hypothetical protein  39.04 
 
 
269 aa  172  6.999999999999999e-42  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.728589  normal  0.420247 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1035  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  38.67 
 
 
276 aa  171  1e-41  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1597  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.96 
 
 
287 aa  164  1.0000000000000001e-39  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1436  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.71 
 
 
314 aa  164  2.0000000000000002e-39  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.289557  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1678  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.16 
 
 
289 aa  163  3e-39  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.771808  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1663  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.23 
 
 
287 aa  162  4.0000000000000004e-39  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_19890  ABC-type dipeptide/oligopeptide/nickel transport system, permease component  37.6 
 
 
289 aa  162  5.0000000000000005e-39  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  hitchhiker  0.00186711  hitchhiker  0.000357505 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0548  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.84 
 
 
310 aa  162  8.000000000000001e-39  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7446  ABC transporter, permease  33.94 
 
 
299 aa  160  2e-38  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.913354  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0621  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.48 
 
 
310 aa  160  3e-38  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0465132  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3569  dipeptide ABC transporter, permease  36.76 
 
 
257 aa  159  4e-38  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.0377777 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2796  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.31 
 
 
299 aa  159  6e-38  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2084  ABC transporter, permease  37 
 
 
293 aa  158  1e-37  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.395639  normal  0.741475 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1412  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.29 
 
 
306 aa  157  2e-37  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2594  oligopeptide ABC transporter, permease protein  38.4 
 
 
285 aa  157  2e-37  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2747  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.26 
 
 
288 aa  157  2e-37  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0264  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.82 
 
 
299 aa  157  2e-37  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.502248  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0843  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  43.3 
 
 
818 aa  156  4e-37  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  unclonable  0.000000000335755  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0801  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.45 
 
 
321 aa  155  7e-37  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.187971  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0216  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.23 
 
 
280 aa  155  1e-36  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.0346829  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_17740  ABC-type dipeptide/oligopeptide/nickel transport system, permease component  36.47 
 
 
331 aa  154  1e-36  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  decreased coverage  0.00436739  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4454  opine ABC transporter, permease protein, putative  38.55 
 
 
290 aa  154  2e-36  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000504442 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4762  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  37 
 
 
307 aa  154  2e-36  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1592  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.7 
 
 
280 aa  154  2e-36  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.961775 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7556  putative dipeptide ABC transporter (permease protein)  36.26 
 
 
279 aa  153  2.9999999999999998e-36  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7183  ABC transporter membrane spanning protein (oligopeptide)  34.31 
 
 
335 aa  153  2.9999999999999998e-36  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.587678  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3080  binding-protein dependent transport system inner membrane protein  35.66 
 
 
283 aa  153  2.9999999999999998e-36  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.35224  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2970  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.94 
 
 
281 aa  153  2.9999999999999998e-36  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0153047  normal  0.258787 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0916  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.97 
 
 
280 aa  152  5e-36  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0894  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.97 
 
 
280 aa  152  5e-36  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0897  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.85 
 
 
303 aa  152  5e-36  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0330  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.11 
 
 
296 aa  152  5.9999999999999996e-36  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0816987  normal 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1190  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.58 
 
 
290 aa  152  8e-36  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.287104  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0928  oligopeptide ABC transporter, permease protein  38.22 
 
 
274 aa  152  8.999999999999999e-36  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  decreased coverage  0.00180433  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1435  peptide ABC transporter, permease protein  37.36 
 
 
282 aa  151  1e-35  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.557175  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0269  ABC transporter related protein  35.74 
 
 
867 aa  151  1e-35  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5301  ABC transporter membrane spanning protein (oligopeptide)  39.06 
 
 
296 aa  151  1e-35  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.527833  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5669  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.94 
 
 
302 aa  151  1e-35  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.330271  normal  0.031338 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2573  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.7 
 
 
279 aa  150  2e-35  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.786779  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_21760  ABC-type dipeptide/oligopeptide/nickel transport system, permease component  32.77 
 
 
310 aa  150  2e-35  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0612673  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2642  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  37.08 
 
 
280 aa  150  2e-35  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4732  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.36 
 
 
299 aa  150  3e-35  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0851  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.73 
 
 
284 aa  150  3e-35  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2947  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.8 
 
 
300 aa  150  3e-35  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.456335  normal  0.0430362 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1002  oligopeptide ABC transporter, permease protein  34.81 
 
 
283 aa  149  4e-35  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0824  oligopeptide ABC transporter, permease  34.81 
 
 
283 aa  149  4e-35  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0874  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.73 
 
 
284 aa  149  4e-35  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0947  oligopeptide ABC transporter, permease protein  34.81 
 
 
283 aa  149  4e-35  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.177412  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0487  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  30.22 
 
 
284 aa  149  4e-35  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0011  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.36 
 
 
307 aa  149  5e-35  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1621  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.1 
 
 
291 aa  149  5e-35  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.00767174  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3131  binding-protein dependent transport system inner membrane protein  33.33 
 
 
279 aa  149  6e-35  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.19818 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2032  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.3 
 
 
285 aa  149  6e-35  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4252  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.18 
 
 
276 aa  149  7e-35  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.176316  normal  0.343929 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1074  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, permease protein  33.09 
 
 
464 aa  148  8e-35  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4403  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.66 
 
 
311 aa  148  8e-35  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.292723 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>