More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tpet_0894 on replicon NC_009486
Organism: Thermotoga petrophila RKU-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010483  TRQ2_0916  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  100 
 
 
280 aa  555  1e-157  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0894  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  100 
 
 
280 aa  555  1e-157  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0216  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  70 
 
 
280 aa  414  9.999999999999999e-116  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.0346829  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0490  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  44.89 
 
 
277 aa  246  3e-64  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1555  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  46.49 
 
 
280 aa  243  1.9999999999999999e-63  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.0590918  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3655  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  41.64 
 
 
302 aa  237  2e-61  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1597  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  41.58 
 
 
282 aa  236  4e-61  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.951442  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1547  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  41.22 
 
 
285 aa  234  1.0000000000000001e-60  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.107676  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0912  ABC-type dipeptide/oligopeptide/nickel transport systems, permease components  40.52 
 
 
304 aa  220  1.9999999999999999e-56  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0264  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  40 
 
 
299 aa  198  9e-50  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.502248  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_17740  ABC-type dipeptide/oligopeptide/nickel transport system, permease component  39.55 
 
 
331 aa  188  7e-47  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  decreased coverage  0.00436739  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1678  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  37.41 
 
 
289 aa  182  4.0000000000000006e-45  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.771808  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1400  ABC transporter related  39.18 
 
 
638 aa  178  1e-43  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.785888  normal  0.726008 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_20160  ABC-type dipeptide/oligopeptide/nickel transport system, ATPase component  37.69 
 
 
621 aa  176  5e-43  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.533008  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1898  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.6 
 
 
331 aa  175  6e-43  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2075  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.91 
 
 
344 aa  174  9.999999999999999e-43  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3402  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.82 
 
 
311 aa  169  4e-41  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_34910  ABC-type dipeptide/oligopeptide/nickel transport system, permease component  34.07 
 
 
342 aa  167  1e-40  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2726  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  37.05 
 
 
303 aa  167  1e-40  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.576006 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0480  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.58 
 
 
274 aa  167  1e-40  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.534309  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0173  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.29 
 
 
309 aa  167  2e-40  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.383419  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2198  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.49 
 
 
290 aa  166  4e-40  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00106936  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1138  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.45 
 
 
290 aa  164  1.0000000000000001e-39  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.204889 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_01330  ABC-type dipeptide/oligopeptide/nickel transport system, permease component  35.85 
 
 
311 aa  164  1.0000000000000001e-39  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0897  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.78 
 
 
303 aa  164  2.0000000000000002e-39  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1482  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  34.56 
 
 
727 aa  164  2.0000000000000002e-39  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1035  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.82 
 
 
276 aa  164  2.0000000000000002e-39  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2796  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.9 
 
 
299 aa  164  2.0000000000000002e-39  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1613  oligopeptide ABC transporter, permease protein  34.98 
 
 
319 aa  162  6e-39  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0400  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.56 
 
 
348 aa  161  1e-38  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2515  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  30.8 
 
 
331 aa  159  3e-38  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0878076  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2621  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.06 
 
 
320 aa  159  4e-38  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2503  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.86 
 
 
299 aa  158  1e-37  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.876873  normal 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7183  ABC transporter membrane spanning protein (oligopeptide)  33.68 
 
 
335 aa  157  2e-37  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.587678  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7458  peptide ABC transporter, permease protein  33.83 
 
 
281 aa  156  3e-37  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.48372 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2747  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.73 
 
 
288 aa  155  8e-37  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2743  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.1 
 
 
302 aa  153  2e-36  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.418739  normal 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6686  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.97 
 
 
292 aa  153  2.9999999999999998e-36  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.340693  normal  0.469526 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2055  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.62 
 
 
309 aa  153  4e-36  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  hitchhiker  0.00634879  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2395  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.52 
 
 
334 aa  152  5e-36  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1492  peptide ABC transporter, permease protein  30.47 
 
 
279 aa  152  7e-36  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1282  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  30.47 
 
 
279 aa  152  7e-36  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1436  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.13 
 
 
314 aa  149  3e-35  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.289557  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0929  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.82 
 
 
350 aa  150  3e-35  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013924  Nmag_3994  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.33 
 
 
325 aa  149  4e-35  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6186  ABC transporter related  31.48 
 
 
590 aa  149  5e-35  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0040  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.33 
 
 
320 aa  149  7e-35  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1681  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.61 
 
 
358 aa  149  7e-35  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.471831  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0043  hypothetical protein  31.84 
 
 
269 aa  148  1.0000000000000001e-34  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.728589  normal  0.420247 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_06410  ABC-type dipeptide/oligopeptide/nickel transport system, permease component  32.47 
 
 
320 aa  147  2.0000000000000003e-34  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.138967  normal 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2578  ABC-type [(GlcNAc)2] transporter, permease protein  29.55 
 
 
341 aa  147  2.0000000000000003e-34  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1268  ABC-type dipeptide/oligopeptide/nickel transport systems, permease component  30.47 
 
 
279 aa  147  3e-34  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0547  peptide ABC transporter, protein inner membrane binding component  29.12 
 
 
327 aa  146  3e-34  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0218475  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0160  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  31.34 
 
 
292 aa  146  4.0000000000000006e-34  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.193009  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0487  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.5 
 
 
284 aa  144  2e-33  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5670  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.46 
 
 
300 aa  143  3e-33  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1002  oligopeptide ABC transporter, permease protein  34.66 
 
 
283 aa  143  3e-33  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4520  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.45 
 
 
301 aa  143  3e-33  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.20807  normal  0.604183 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5782  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.6 
 
 
292 aa  143  4e-33  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.10252 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0843  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.16 
 
 
818 aa  143  4e-33  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  unclonable  0.000000000335755  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0824  oligopeptide ABC transporter, permease  34.3 
 
 
283 aa  142  5e-33  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0221  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  31.49 
 
 
307 aa  142  5e-33  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0947  oligopeptide ABC transporter, permease protein  34.3 
 
 
283 aa  142  5e-33  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.177412  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1183  putative permease of ABC transporter  31.51 
 
 
301 aa  142  6e-33  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.056047  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0210  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  30.8 
 
 
307 aa  142  7e-33  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0860  oligopeptide ABC transporter permease  34.77 
 
 
283 aa  142  8e-33  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0809  oligopeptide ABC transporter, permease  33.94 
 
 
283 aa  142  8e-33  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0910  oligopeptide ABC transporter permease protein  34.77 
 
 
283 aa  142  8e-33  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_19890  ABC-type dipeptide/oligopeptide/nickel transport system, permease component  36.52 
 
 
289 aa  142  8e-33  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  hitchhiker  0.00186711  hitchhiker  0.000357505 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4384  oligopeptide ABC transporter, permease protein  34.3 
 
 
283 aa  142  8e-33  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  9.52955e-23 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0236  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.33 
 
 
286 aa  141  9.999999999999999e-33  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.0893446  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0805  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.3 
 
 
283 aa  141  9.999999999999999e-33  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.789025  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7556  putative dipeptide ABC transporter (permease protein)  32.61 
 
 
279 aa  141  1.9999999999999998e-32  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_21760  ABC-type dipeptide/oligopeptide/nickel transport system, permease component  31.23 
 
 
310 aa  140  1.9999999999999998e-32  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0612673  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0268  oligopeptide ABC transporter, permease protein  30.45 
 
 
307 aa  140  1.9999999999999998e-32  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0247  oligopeptide ABC transporter, permease protein  30.8 
 
 
306 aa  140  1.9999999999999998e-32  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0546254  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5078  oligopeptide ABC transporter, permease protein  30.8 
 
 
306 aa  140  1.9999999999999998e-32  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5372  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  31.54 
 
 
279 aa  140  1.9999999999999998e-32  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.194033 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1621  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.04 
 
 
291 aa  140  1.9999999999999998e-32  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.00767174  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0207  oligopeptide ABC transporter, permease  30.45 
 
 
307 aa  140  3e-32  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0998  oligopeptide ABC transporter, permease protein  33.94 
 
 
283 aa  139  6e-32  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  3.8284200000000003e-62 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1137  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  30.5 
 
 
293 aa  138  1e-31  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  unclonable  0.0000000000296229  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0483  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  28.67 
 
 
291 aa  138  1e-31  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.125001  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001972  peptide ABC transporter permease component  30.66 
 
 
318 aa  138  1e-31  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00495  ABC transporter permease component  30.45 
 
 
318 aa  137  1e-31  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0250  oligopeptide ABC transporter, permease protein  29.41 
 
 
307 aa  137  2e-31  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2756  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  31.27 
 
 
303 aa  137  2e-31  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2390  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.16 
 
 
306 aa  137  2e-31  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5669  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  30.74 
 
 
302 aa  136  4e-31  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.330271  normal  0.031338 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0243  oligopeptide ABC transporter, permease protein  29.07 
 
 
307 aa  136  4e-31  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1412  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  30.8 
 
 
306 aa  136  4e-31  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4283  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.6 
 
 
292 aa  136  4e-31  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.826823  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2379  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  29.01 
 
 
273 aa  136  4e-31  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.141415  normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0211  oligopeptide ABC transporter, permease  29.07 
 
 
307 aa  135  5e-31  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3009  ABC transporter related  30 
 
 
314 aa  135  6.0000000000000005e-31  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.450322 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0564  peptide ABC transporter, protein inner membrane binding component  29.49 
 
 
314 aa  135  7.000000000000001e-31  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0220  oligopeptide ABC transporter permease  29.07 
 
 
307 aa  135  8e-31  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0233  oligopeptide ABC transporter permease protein  29.07 
 
 
307 aa  135  8e-31  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1794  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.1 
 
 
293 aa  135  9e-31  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0357708  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1766  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  28.32 
 
 
468 aa  134  9.999999999999999e-31  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0164204  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>