More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pmob_0490 on replicon NC_010003
Organism: Petrotoga mobilis SJ95



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010003  Pmob_0490  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  100 
 
 
277 aa  544  1e-154  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_17740  ABC-type dipeptide/oligopeptide/nickel transport system, permease component  53.12 
 
 
331 aa  266  2e-70  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  decreased coverage  0.00436739  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0216  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  47.1 
 
 
280 aa  263  3e-69  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.0346829  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1555  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  48.15 
 
 
280 aa  263  3e-69  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.0590918  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3655  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  47.96 
 
 
302 aa  262  4.999999999999999e-69  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1597  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  46.18 
 
 
282 aa  261  8e-69  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.951442  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1547  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  46.18 
 
 
285 aa  261  8.999999999999999e-69  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.107676  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0916  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  44.89 
 
 
280 aa  243  1.9999999999999999e-63  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0894  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  44.89 
 
 
280 aa  243  1.9999999999999999e-63  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0912  ABC-type dipeptide/oligopeptide/nickel transport systems, permease components  40.07 
 
 
304 aa  228  1e-58  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0264  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  39.78 
 
 
299 aa  214  1.9999999999999998e-54  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.502248  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2075  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  39.78 
 
 
344 aa  205  6e-52  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1898  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  37.5 
 
 
331 aa  201  7e-51  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1678  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  39.49 
 
 
289 aa  200  1.9999999999999998e-50  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.771808  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2747  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.64 
 
 
288 aa  193  3e-48  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_34910  ABC-type dipeptide/oligopeptide/nickel transport system, permease component  37.73 
 
 
342 aa  189  5.999999999999999e-47  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6186  ABC transporter related  39.63 
 
 
590 aa  186  3e-46  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_20160  ABC-type dipeptide/oligopeptide/nickel transport system, ATPase component  40.46 
 
 
621 aa  185  8e-46  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.533008  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3402  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.03 
 
 
311 aa  184  2.0000000000000003e-45  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2515  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.33 
 
 
331 aa  182  4.0000000000000006e-45  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0878076  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0547  peptide ABC transporter, protein inner membrane binding component  36.19 
 
 
327 aa  182  5.0000000000000004e-45  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0218475  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1482  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  34.96 
 
 
727 aa  182  6e-45  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1400  ABC transporter related  38.29 
 
 
638 aa  181  1e-44  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.785888  normal  0.726008 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1681  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.43 
 
 
358 aa  179  4e-44  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.471831  n/a   
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6686  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.13 
 
 
292 aa  178  1e-43  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.340693  normal  0.469526 
 
 
-
 
NC_002936  DET1492  peptide ABC transporter, permease protein  35.51 
 
 
279 aa  176  5e-43  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2395  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.15 
 
 
334 aa  176  5e-43  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1282  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.51 
 
 
279 aa  176  5e-43  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2726  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  38.86 
 
 
303 aa  176  5e-43  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.576006 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2578  ABC-type [(GlcNAc)2] transporter, permease protein  35.5 
 
 
341 aa  176  6e-43  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0480  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.9 
 
 
274 aa  174  1.9999999999999998e-42  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.534309  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2621  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.66 
 
 
320 aa  172  5e-42  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7183  ABC transporter membrane spanning protein (oligopeptide)  35.64 
 
 
335 aa  171  1e-41  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.587678  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1180  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  37.68 
 
 
336 aa  171  1e-41  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2743  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  37.68 
 
 
302 aa  171  1e-41  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.418739  normal 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5670  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  37.09 
 
 
300 aa  170  3e-41  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_01330  ABC-type dipeptide/oligopeptide/nickel transport system, permease component  35.07 
 
 
311 aa  169  6e-41  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5782  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.67 
 
 
292 aa  168  1e-40  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.10252 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3488  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.96 
 
 
279 aa  168  1e-40  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0929  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.96 
 
 
350 aa  167  2e-40  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1268  ABC-type dipeptide/oligopeptide/nickel transport systems, permease component  34.78 
 
 
279 aa  167  2e-40  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0173  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.98 
 
 
309 aa  166  2.9999999999999998e-40  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.383419  n/a   
 
 
-
 
NC_013924  Nmag_3994  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.04 
 
 
325 aa  166  4e-40  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5669  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.93 
 
 
302 aa  165  9e-40  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.330271  normal  0.031338 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3131  binding-protein dependent transport system inner membrane protein  35.14 
 
 
279 aa  163  3e-39  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.19818 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2573  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.78 
 
 
279 aa  163  3e-39  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.786779  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0400  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.16 
 
 
348 aa  162  5.0000000000000005e-39  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0147  peptide ABC transporter, permease protein  32.34 
 
 
341 aa  162  7e-39  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7556  putative dipeptide ABC transporter (permease protein)  37 
 
 
279 aa  162  7e-39  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0130  binding-protein dependent transport system inner membrane protein  33.82 
 
 
306 aa  161  1e-38  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0874  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.73 
 
 
284 aa  159  4e-38  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0897  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.42 
 
 
303 aa  159  4e-38  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0851  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.73 
 
 
284 aa  159  5e-38  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2796  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.94 
 
 
299 aa  159  5e-38  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1621  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.4 
 
 
291 aa  158  7e-38  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.00767174  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0040  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  37.34 
 
 
320 aa  158  7e-38  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002584  (GlcNAc)2 ABC transporter permease component 2  32.01 
 
 
341 aa  157  2e-37  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3009  ABC transporter related  32.63 
 
 
314 aa  157  2e-37  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.450322 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4862  putative ABC transporter, permease protein  34.83 
 
 
327 aa  157  2e-37  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.400673  normal  0.659782 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2567  putative dipeptide transport system permease protein  36.06 
 
 
274 aa  156  3e-37  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.255906 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2549  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.31 
 
 
344 aa  156  3e-37  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03425  hypothetical protein  36.84 
 
 
341 aa  156  3e-37  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2198  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.97 
 
 
290 aa  156  4e-37  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00106936  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_19890  ABC-type dipeptide/oligopeptide/nickel transport system, permease component  35.46 
 
 
289 aa  155  9e-37  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  hitchhiker  0.00186711  hitchhiker  0.000357505 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1509  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.3 
 
 
280 aa  154  1e-36  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.284624  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0160  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.59 
 
 
292 aa  154  1e-36  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.193009  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0904  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.13 
 
 
283 aa  154  1e-36  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.639488  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7446  ABC transporter, permease  33.33 
 
 
299 aa  154  2e-36  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.913354  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7458  peptide ABC transporter, permease protein  32.96 
 
 
281 aa  154  2e-36  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.48372 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2947  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.85 
 
 
300 aa  153  2.9999999999999998e-36  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.456335  normal  0.0430362 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4252  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.42 
 
 
276 aa  153  2.9999999999999998e-36  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.176316  normal  0.343929 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2390  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.13 
 
 
306 aa  152  4e-36  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0084  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  37.5 
 
 
289 aa  152  5e-36  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.726209  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1035  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.57 
 
 
276 aa  152  7e-36  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2055  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.65 
 
 
309 aa  151  8.999999999999999e-36  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  hitchhiker  0.00634879  normal 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0843  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  38.67 
 
 
818 aa  151  8.999999999999999e-36  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  unclonable  0.000000000335755  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0998  oligopeptide ABC transporter, permease protein  35.61 
 
 
283 aa  151  1e-35  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  3.8284200000000003e-62 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4520  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.23 
 
 
301 aa  150  2e-35  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.20807  normal  0.604183 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1563  ABC peptide transporter, inner membrane subunit  35.64 
 
 
323 aa  150  2e-35  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_06410  ABC-type dipeptide/oligopeptide/nickel transport system, permease component  33.46 
 
 
320 aa  150  2e-35  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.138967  normal 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0629  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.33 
 
 
289 aa  150  2e-35  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.709425  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0860  oligopeptide ABC transporter permease  35.25 
 
 
283 aa  149  3e-35  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1613  oligopeptide ABC transporter, permease protein  33.97 
 
 
319 aa  150  3e-35  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0910  oligopeptide ABC transporter permease protein  35.25 
 
 
283 aa  149  3e-35  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0236  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.89 
 
 
286 aa  150  3e-35  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.0893446  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1002  oligopeptide ABC transporter, permease protein  35.61 
 
 
283 aa  149  6e-35  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0824  oligopeptide ABC transporter, permease  34.3 
 
 
283 aa  149  6e-35  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4283  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.31 
 
 
292 aa  149  6e-35  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.826823  normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0809  oligopeptide ABC transporter, permease  33.94 
 
 
283 aa  149  7e-35  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2763  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.83 
 
 
297 aa  149  7e-35  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.405824  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4384  oligopeptide ABC transporter, permease protein  35.25 
 
 
283 aa  149  7e-35  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  9.52955e-23 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0947  oligopeptide ABC transporter, permease protein  34.3 
 
 
283 aa  148  8e-35  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.177412  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1684  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.45 
 
 
312 aa  148  8e-35  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2503  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  31 
 
 
299 aa  148  9e-35  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.876873  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0104  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.21 
 
 
302 aa  148  1.0000000000000001e-34  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.217904  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1436  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  37.1 
 
 
314 aa  148  1.0000000000000001e-34  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.289557  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5656  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.82 
 
 
332 aa  148  1.0000000000000001e-34  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0805  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.3 
 
 
283 aa  147  3e-34  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.789025  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0043  hypothetical protein  33.98 
 
 
269 aa  146  3e-34  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.728589  normal  0.420247 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3219  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.63 
 
 
279 aa  146  3e-34  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.511198  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>