More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mlg_2178 on replicon NC_008340
Organism: Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008340  Mlg_2178  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  100 
 
 
445 aa  884    Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.645104  normal  0.606016 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1076  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  69.89 
 
 
444 aa  606  9.999999999999999e-173  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.0571583  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0147  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  45.02 
 
 
474 aa  344  2e-93  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.114503  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1063  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  37 
 
 
460 aa  320  1.9999999999999998e-86  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1331  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  30.66 
 
 
463 aa  201  1.9999999999999998e-50  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.759845  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_13060  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  27.06 
 
 
485 aa  199  1.0000000000000001e-49  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0718  binding-protein-dependent transporter inner membrane protein  26.54 
 
 
455 aa  187  2e-46  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1074  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, permease protein  28.9 
 
 
464 aa  182  1e-44  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0314  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  24.78 
 
 
468 aa  176  9e-43  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1420  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  27.31 
 
 
471 aa  169  1e-40  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.0657441  normal 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0911  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  28.03 
 
 
472 aa  167  2.9999999999999998e-40  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal  0.99842 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1895  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  27.94 
 
 
471 aa  167  2.9999999999999998e-40  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0973  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  28.21 
 
 
471 aa  162  2e-38  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.0283497 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0802  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  26.54 
 
 
462 aa  144  2e-33  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.548256  normal  0.2296 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_01330  ABC-type dipeptide/oligopeptide/nickel transport system, permease component  32.88 
 
 
311 aa  127  6e-28  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1492  peptide ABC transporter, permease protein  29.65 
 
 
279 aa  125  2e-27  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2494  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.76 
 
 
399 aa  125  2e-27  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.02594  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1282  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  29.65 
 
 
279 aa  125  2e-27  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1268  ABC-type dipeptide/oligopeptide/nickel transport systems, permease component  30.09 
 
 
279 aa  124  3e-27  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2230  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  23.19 
 
 
450 aa  122  9.999999999999999e-27  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.938775  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2594  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.03 
 
 
364 aa  120  3e-26  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.853093  normal 
 
 
-
 
NC_013924  Nmag_3994  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.18 
 
 
325 aa  120  4.9999999999999996e-26  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1661  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.5 
 
 
360 aa  120  6e-26  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.390668  normal  0.152299 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2055  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.9 
 
 
309 aa  119  9.999999999999999e-26  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  hitchhiker  0.00634879  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3402  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.14 
 
 
311 aa  119  1.9999999999999998e-25  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_19890  ABC-type dipeptide/oligopeptide/nickel transport system, permease component  30.36 
 
 
289 aa  119  1.9999999999999998e-25  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  hitchhiker  0.00186711  hitchhiker  0.000357505 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5372  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.9 
 
 
279 aa  117  3.9999999999999997e-25  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.194033 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1035  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  29.49 
 
 
276 aa  117  3.9999999999999997e-25  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_20160  ABC-type dipeptide/oligopeptide/nickel transport system, ATPase component  31.98 
 
 
621 aa  117  5e-25  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.533008  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_34910  ABC-type dipeptide/oligopeptide/nickel transport system, permease component  30.93 
 
 
342 aa  116  7.999999999999999e-25  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2379  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  29.46 
 
 
273 aa  116  7.999999999999999e-25  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.141415  normal 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0480  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  31.39 
 
 
274 aa  116  7.999999999999999e-25  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.534309  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7446  ABC transporter, permease  28.64 
 
 
299 aa  115  1.0000000000000001e-24  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.913354  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1400  ABC transporter related  29.28 
 
 
638 aa  115  1.0000000000000001e-24  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.785888  normal  0.726008 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2578  ABC-type [(GlcNAc)2] transporter, permease protein  27.98 
 
 
341 aa  114  2.0000000000000002e-24  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1482  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  29.63 
 
 
727 aa  114  3e-24  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1613  oligopeptide ABC transporter, permease protein  27.75 
 
 
319 aa  114  3e-24  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03425  hypothetical protein  28.76 
 
 
341 aa  114  4.0000000000000004e-24  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2553  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, permease protein  30.13 
 
 
304 aa  114  5e-24  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2256  oligopeptide ABC transporter, permease component  30.13 
 
 
304 aa  114  5e-24  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1436  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  30.18 
 
 
314 aa  112  1.0000000000000001e-23  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.289557  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2512  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.19 
 
 
363 aa  112  1.0000000000000001e-23  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.960083  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3318  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  31.98 
 
 
291 aa  112  1.0000000000000001e-23  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2084  ABC transporter, permease  28.76 
 
 
293 aa  111  2.0000000000000002e-23  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.395639  normal  0.741475 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0633  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  30.13 
 
 
340 aa  111  3e-23  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.705479 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0043  hypothetical protein  33.94 
 
 
269 aa  111  3e-23  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.728589  normal  0.420247 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002584  (GlcNAc)2 ABC transporter permease component 2  27.47 
 
 
341 aa  111  3e-23  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0843  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.63 
 
 
818 aa  110  4.0000000000000004e-23  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  unclonable  0.000000000335755  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1445  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  28.23 
 
 
352 aa  110  5e-23  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.000439393  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0147  peptide ABC transporter, permease protein  26.03 
 
 
341 aa  110  6e-23  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1252  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  32.74 
 
 
650 aa  109  8.000000000000001e-23  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.0892214 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0732  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  30.99 
 
 
258 aa  109  9.000000000000001e-23  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1157  peptide ABC transporter, permease protein, putative  28.25 
 
 
473 aa  109  1e-22  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1412  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  27.75 
 
 
306 aa  108  2e-22  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1898  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  29.82 
 
 
331 aa  108  2e-22  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4283  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.22 
 
 
292 aa  108  2e-22  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.826823  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4965  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  31.86 
 
 
309 aa  108  2e-22  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.031791  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3080  binding-protein dependent transport system inner membrane protein  30.22 
 
 
283 aa  108  3e-22  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.35224  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3009  ABC transporter related  30.47 
 
 
314 aa  107  3e-22  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.450322 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1342  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.04 
 
 
380 aa  107  6e-22  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal  0.404079 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1343  peptide ABC transporter, permease protein, putative  28 
 
 
479 aa  106  7e-22  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.736839  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_21760  ABC-type dipeptide/oligopeptide/nickel transport system, permease component  28.38 
 
 
310 aa  106  7e-22  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0612673  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1644  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  27.11 
 
 
485 aa  106  8e-22  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.431647  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2970  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  28.12 
 
 
281 aa  106  9e-22  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0153047  normal  0.258787 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2390  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  31.22 
 
 
306 aa  106  9e-22  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5973  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.48 
 
 
390 aa  105  1e-21  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.469173 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0445  ABC-type dipeptide/oligopeptide/nickel transport systems permease components-like  30.47 
 
 
351 aa  105  1e-21  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.881548 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1485  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  29.41 
 
 
274 aa  105  1e-21  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0146821  normal  0.125484 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2013  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  29.91 
 
 
285 aa  105  1e-21  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2075  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  30.8 
 
 
344 aa  105  1e-21  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6186  ABC transporter related  28.76 
 
 
590 aa  105  2e-21  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0237  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  27.44 
 
 
279 aa  105  2e-21  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0964586  normal  0.518429 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2515  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  27.48 
 
 
331 aa  104  3e-21  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0878076  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1867  ABC-type transport system protein  27.23 
 
 
288 aa  104  3e-21  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1676  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  25.36 
 
 
494 aa  104  3e-21  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4292  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  30.22 
 
 
301 aa  104  3e-21  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4862  putative ABC transporter, permease protein  33.18 
 
 
327 aa  104  3e-21  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.400673  normal  0.659782 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0479  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  29.63 
 
 
304 aa  104  4e-21  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.477815  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3928  ABC transporter membrane spanning protein (oligopeptide)  29.63 
 
 
394 aa  103  4e-21  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4595  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.59 
 
 
391 aa  103  4e-21  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.579671  normal 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_7126  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.04 
 
 
390 aa  103  5e-21  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.106736 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4163  binding-protein dependent transport system inner membrane protein  30.7 
 
 
372 aa  103  6e-21  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0546516  hitchhiker  0.0000167593 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3198  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  28.69 
 
 
260 aa  103  6e-21  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  unclonable  0.0000000283157  unclonable  0.000000000020531 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4403  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.13 
 
 
311 aa  103  6e-21  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.292723 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2788  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  27.27 
 
 
310 aa  103  6e-21  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4452  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  27.95 
 
 
372 aa  103  6e-21  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.173212  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3569  dipeptide ABC transporter, permease  30.4 
 
 
257 aa  103  7e-21  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.0377777 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5669  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  31.11 
 
 
302 aa  103  7e-21  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.330271  normal  0.031338 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1901  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  29.72 
 
 
371 aa  103  8e-21  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1925  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  29.72 
 
 
371 aa  103  8e-21  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.866593  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0959  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  28 
 
 
352 aa  103  8e-21  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4464  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  27.68 
 
 
330 aa  103  8e-21  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.0131606  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0814  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  26.96 
 
 
603 aa  103  8e-21  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.959889  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2796  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  29.78 
 
 
299 aa  102  1e-20  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1848  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  27.73 
 
 
318 aa  102  1e-20  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1543  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  27.8 
 
 
496 aa  102  1e-20  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1494  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  27.11 
 
 
497 aa  102  1e-20  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.826633 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1405  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  29.91 
 
 
542 aa  101  2e-20  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.407034  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0562  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.6 
 
 
840 aa  101  2e-20  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5359  ABC transporter membrane spanning protein (dipeptide)  30.32 
 
 
289 aa  102  2e-20  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.632265  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>