More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tneu_1420 on replicon NC_010525
Organism: Thermoproteus neutrophilus V24Sta



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010525  Tneu_1420  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  100 
 
 
471 aa  932    Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.0657441  normal 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0911  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  84.71 
 
 
472 aa  818    Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal  0.99842 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0973  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  77.07 
 
 
471 aa  737    Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.0283497 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1895  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  78.98 
 
 
471 aa  752    Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0718  binding-protein-dependent transporter inner membrane protein  35.79 
 
 
455 aa  289  7e-77  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1074  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, permease protein  35.22 
 
 
464 aa  262  1e-68  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0802  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.68 
 
 
462 aa  251  2e-65  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.548256  normal  0.2296 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_13060  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.14 
 
 
485 aa  238  1e-61  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0314  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.99 
 
 
468 aa  238  2e-61  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1331  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.56 
 
 
463 aa  227  3e-58  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.759845  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0147  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.06 
 
 
474 aa  204  3e-51  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.114503  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0843  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  47.09 
 
 
818 aa  197  5.000000000000001e-49  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  unclonable  0.000000000335755  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1063  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  29.35 
 
 
460 aa  191  2.9999999999999997e-47  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1076  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  30.28 
 
 
444 aa  181  2e-44  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.0571583  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2230  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  29.82 
 
 
450 aa  179  9e-44  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.938775  n/a   
 
 
-
 
NC_013924  Nmag_3994  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  41.52 
 
 
325 aa  176  7e-43  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1436  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  39.46 
 
 
314 aa  174  2.9999999999999996e-42  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.289557  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1492  peptide ABC transporter, permease protein  41.26 
 
 
279 aa  170  5e-41  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1282  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  41.26 
 
 
279 aa  170  5e-41  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2178  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  27.16 
 
 
445 aa  169  1e-40  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.645104  normal  0.606016 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1268  ABC-type dipeptide/oligopeptide/nickel transport systems, permease component  40.36 
 
 
279 aa  166  5.9999999999999996e-40  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2198  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  41.49 
 
 
290 aa  165  1.0000000000000001e-39  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00106936  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1848  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  39.46 
 
 
318 aa  159  7e-38  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2494  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  37.61 
 
 
399 aa  159  1e-37  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.02594  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7446  ABC transporter, permease  37.73 
 
 
299 aa  159  1e-37  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.913354  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6186  ABC transporter related  38.67 
 
 
590 aa  156  8e-37  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4403  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  37.73 
 
 
311 aa  156  9e-37  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.292723 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_19890  ABC-type dipeptide/oligopeptide/nickel transport system, permease component  37.84 
 
 
289 aa  154  2.9999999999999998e-36  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  hitchhiker  0.00186711  hitchhiker  0.000357505 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1613  oligopeptide ABC transporter, permease protein  36.49 
 
 
319 aa  152  1e-35  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2390  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  38.74 
 
 
306 aa  151  2e-35  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2594  oligopeptide ABC transporter, permease protein  40.99 
 
 
285 aa  151  2e-35  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0983  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  40.81 
 
 
495 aa  151  2e-35  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.99676  normal  0.0550466 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3569  dipeptide ABC transporter, permease  40.36 
 
 
257 aa  150  4e-35  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.0377777 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_4129  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  39.11 
 
 
312 aa  150  4e-35  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_01330  ABC-type dipeptide/oligopeptide/nickel transport system, permease component  39.46 
 
 
311 aa  150  5e-35  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0921  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  41.7 
 
 
284 aa  150  5e-35  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.399737 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1412  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.71 
 
 
306 aa  149  8e-35  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1644  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.69 
 
 
485 aa  148  2.0000000000000003e-34  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.431647  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2055  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  37.23 
 
 
309 aa  148  2.0000000000000003e-34  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  hitchhiker  0.00634879  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7556  putative dipeptide ABC transporter (permease protein)  37.22 
 
 
279 aa  148  2.0000000000000003e-34  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1343  peptide ABC transporter, permease protein, putative  39.73 
 
 
479 aa  147  3e-34  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.736839  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5372  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.16 
 
 
279 aa  147  3e-34  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.194033 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1494  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  39.64 
 
 
497 aa  147  4.0000000000000006e-34  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.826633 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0479  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  38.25 
 
 
304 aa  146  6e-34  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.477815  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2084  ABC transporter, permease  38.01 
 
 
293 aa  146  7.0000000000000006e-34  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.395639  normal  0.741475 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3009  ABC transporter related  36.32 
 
 
314 aa  146  8.000000000000001e-34  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.450322 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2796  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.06 
 
 
299 aa  144  2e-33  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1509  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  38.94 
 
 
280 aa  144  3e-33  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.284624  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3198  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  37.67 
 
 
260 aa  144  4e-33  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  unclonable  0.0000000283157  unclonable  0.000000000020531 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0669  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  38.67 
 
 
280 aa  143  6e-33  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.489038  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_34910  ABC-type dipeptide/oligopeptide/nickel transport system, permease component  35.43 
 
 
342 aa  142  9.999999999999999e-33  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_20160  ABC-type dipeptide/oligopeptide/nickel transport system, ATPase component  36.32 
 
 
621 aa  142  9.999999999999999e-33  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.533008  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0676  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.87 
 
 
394 aa  142  9.999999999999999e-33  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.328727  normal  0.105516 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1543  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  38.74 
 
 
496 aa  142  1.9999999999999998e-32  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1035  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  38.03 
 
 
276 aa  142  1.9999999999999998e-32  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1676  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.23 
 
 
494 aa  141  3e-32  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2075  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.77 
 
 
344 aa  140  3.9999999999999997e-32  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1215  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  39.29 
 
 
278 aa  140  6e-32  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2032  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  37.95 
 
 
285 aa  140  7e-32  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0330  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  41.78 
 
 
296 aa  139  7e-32  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0816987  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1236  binding-protein dependent transport system inner membrane protein  37.95 
 
 
284 aa  139  7.999999999999999e-32  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.143707  normal  0.209567 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1157  peptide ABC transporter, permease protein, putative  36.8 
 
 
473 aa  139  1e-31  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1592  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.61 
 
 
280 aa  139  1e-31  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.961775 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1253  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  38.29 
 
 
305 aa  139  1e-31  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.95778  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4965  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  41.63 
 
 
309 aa  139  1e-31  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.031791  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1435  peptide ABC transporter, permease protein  36.1 
 
 
282 aa  138  2e-31  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.557175  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1621  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  37.61 
 
 
291 aa  138  3.0000000000000003e-31  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.00767174  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1077  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  37.44 
 
 
289 aa  137  3.0000000000000003e-31  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0858  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  37.5 
 
 
277 aa  137  3.0000000000000003e-31  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2970  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.18 
 
 
281 aa  137  5e-31  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0153047  normal  0.258787 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2642  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  37.1 
 
 
310 aa  136  6.0000000000000005e-31  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1485  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  38.91 
 
 
274 aa  136  7.000000000000001e-31  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0146821  normal  0.125484 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0104  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.18 
 
 
302 aa  136  7.000000000000001e-31  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.217904  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2642  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.71 
 
 
280 aa  136  9e-31  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2553  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, permease protein  37.39 
 
 
304 aa  136  9e-31  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2256  oligopeptide ABC transporter, permease component  37.39 
 
 
304 aa  136  9e-31  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2013  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.16 
 
 
285 aa  135  9.999999999999999e-31  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2756  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.43 
 
 
303 aa  135  9.999999999999999e-31  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0211  oligopeptide ABC transporter, permease  35.93 
 
 
307 aa  135  1.9999999999999998e-30  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3219  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.98 
 
 
279 aa  135  1.9999999999999998e-30  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.511198  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4042  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.84 
 
 
307 aa  135  1.9999999999999998e-30  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0243  oligopeptide ABC transporter, permease protein  35.93 
 
 
307 aa  135  1.9999999999999998e-30  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2549  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.63 
 
 
344 aa  135  1.9999999999999998e-30  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2379  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35 
 
 
273 aa  135  1.9999999999999998e-30  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.141415  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2726  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.88 
 
 
303 aa  134  1.9999999999999998e-30  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.576006 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1445  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.71 
 
 
352 aa  134  3e-30  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.000439393  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3402  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.58 
 
 
311 aa  134  3e-30  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2947  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  37.5 
 
 
300 aa  134  3e-30  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.456335  normal  0.0430362 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1250  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  37.17 
 
 
301 aa  134  3e-30  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.70134 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3464  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.29 
 
 
293 aa  134  3e-30  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.141846  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0207  oligopeptide ABC transporter, permease  35.5 
 
 
307 aa  133  5e-30  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0928  oligopeptide ABC transporter, permease protein  36.32 
 
 
274 aa  134  5e-30  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  decreased coverage  0.00180433  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1977  ABC transporter permease  38.17 
 
 
256 aa  134  5e-30  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1274  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, permease protein  35.27 
 
 
305 aa  133  6e-30  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.000176481  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0250  oligopeptide ABC transporter, permease protein  35.5 
 
 
307 aa  133  6e-30  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1684  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.66 
 
 
367 aa  133  6e-30  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000435882  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0621  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  38.39 
 
 
310 aa  133  6e-30  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0465132  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0510  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.84 
 
 
270 aa  133  6e-30  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1273  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.78 
 
 
286 aa  133  6.999999999999999e-30  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0548  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  38.39 
 
 
310 aa  133  6.999999999999999e-30  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>